More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1132 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1644  methionyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 679 aa  714    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02044  methionyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 677 aa  697    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.846253  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1543  methionyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 677 aa  696    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.164847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2296  methionyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 678 aa  694    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.556426  normal  0.0916418 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1917  methionyl-tRNA synthetase  50.5 
 
 		 679 aa  704    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.700224  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2389  methionyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 677 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1097  methionyl-tRNA synthetase  51.15 
 
 		 679 aa  709    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.915405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2191  methionyl-tRNA synthetase  49.09 
 
 		 726 aa  653    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00221982  normal  0.440795 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2578  methionyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 689 aa  698    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0207474  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0856  methionyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 677 aa  696    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0016  methionyl-tRNA synthetase  51.98 
 
 		 694 aa  695    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2381  methionyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 		 688 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173076  hitchhiker  0.00746029 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0857  methionyl-tRNA synthetase  47.62 
 
 		 722 aa  640    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000674462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1573  methionyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 673 aa  692    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0544859  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2839  methionyl-tRNA synthetase  47.78 
 
 		 713 aa  674    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.776393  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2982  methionyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 717 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.326883  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2619  methionyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 676 aa  683    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4147  methionyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 682 aa  701    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19280  methionyl-tRNA synthetase  52.07 
 
 		 681 aa  728    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1977  methionyl-tRNA synthetase  51.64 
 
 		 688 aa  714    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000167164  hitchhiker  0.00798123 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1052  methionyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 717 aa  640    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1057  methionyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 725 aa  640    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2220  methionyl-tRNA synthetase  50.22 
 
 		 689 aa  699    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0218045  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0709  methionyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 725 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24373  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2941  methionyl-tRNA synthetase  46.49 
 
 		 670 aa  646    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2795  methionyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 		 670 aa  647    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2554  methionyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 675 aa  687    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3886  methionyl-tRNA synthetase  50.14 
 
 		 682 aa  704    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.444378 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1432  methionyl-tRNA synthetase  47.15 
 
 		 700 aa  659    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.111821  normal  0.539533 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0574  methionyl-tRNA synthetase  51.47 
 
 		 696 aa  712    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0911876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1573  methionyl-tRNA synthetase  49.57 
 
 		 675 aa  678    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.960021  normal  0.561708 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0674  methionyl-tRNA synthetase  48.02 
 
 		 688 aa  646    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2350  methionyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 720 aa  647    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.145755  normal  0.0876744 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0860  methionyl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 690 aa  737    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00024146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1211  methionyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 725 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0971  methionyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 674 aa  706    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.894235  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4507  methionyl-tRNA synthetase  50.72 
 
 		 683 aa  705    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000498816 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1546  methionyl-tRNA synthetase  51.58 
 
 		 678 aa  704    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.229818  hitchhiker  0.00141555 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5768  methionyl-tRNA synthetase  48.59 
 
 		 720 aa  648    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0145693  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1126  methionyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 681 aa  703    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3197  methionyl-tRNA synthetase  48.43 
 
 		 675 aa  687    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000166166  decreased coverage  0.00110356 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2404  methionyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 677 aa  697    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1037  methionyl-tRNA synthetase  49.07 
 
 		 680 aa  701    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02927  methionyl-tRNA synthetase  48.01 
 
 		 661 aa  657    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2465  methionyl-tRNA synthetase  50.43 
 
 		 689 aa  697    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00474925  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2393  methionyl-tRNA synthetase  48.93 
 
 		 677 aa  695    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1936  methionyl-tRNA synthetase  45.98 
 
 		 728 aa  638    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.547314  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0929  methionyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 677 aa  697    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0856  methionyl-tRNA synthetase  47.41 
 
 		 770 aa  647    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2594  methionyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 710 aa  646    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.156229 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2442  methionyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 716 aa  649    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000739386  normal  0.856672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0554  methionyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 731 aa  700    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3097  methionyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 677 aa  696    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2398  methionyl-tRNA synthetase  51.01 
 
 		 677 aa  705    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.323766  normal  0.502216 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0921  methionyl-tRNA synthetase  50.07 
 
 		 692 aa  705    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.387172 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1065  methionyl-tRNA synthetase  50.07 
 
 		 692 aa  705    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2501  methionyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 677 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3483  methionyl-tRNA synthetase  49.02 
 
 		 710 aa  661    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000647027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2056  methionyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 689 aa  683    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.566745  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4315  methionyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 679 aa  704    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2120  methionyl-tRNA synthetase  51.07 
 
 		 681 aa  686    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1596  methionyl-tRNA synthetase  47.32 
 
 		 700 aa  667    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0255918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2769  methionyl-tRNA synthetase  47.53 
 
 		 690 aa  642    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.537254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1195  methionyl-tRNA synthetase  49.43 
 
 		 676 aa  693    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1709  methionyl-tRNA synthetase  46.98 
 
 		 697 aa  659    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1405  methionyl-tRNA synthetase  50.93 
 
 		 678 aa  716    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341077  normal  0.644842 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2249  methionyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 677 aa  697    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1826  methionyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 718 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0136637  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1533  methionyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 677 aa  697    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1897  methionyl-tRNA synthetase  47.84 
 
 		 675 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0232375  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2190  methionyl-tRNA synthetase  48.37 
 
 		 709 aa  649    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.250508 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2458  methionyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 689 aa  701    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000397831  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1015  methionyl-tRNA synthetase  48.95 
 
 		 711 aa  654    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000669444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1179  methionyl-tRNA synthetase  49.5 
 
 		 683 aa  676    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1655  methionyl-tRNA synthetase  49.93 
 
 		 676 aa  688    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1730  methionyl-tRNA synthetase  49.78 
 
 		 676 aa  686    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000858186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0817  methionyl-tRNA synthetase  52.44 
 
 		 675 aa  734    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.835964 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2246  methionyl-tRNA synthetase  50.79 
 
 		 683 aa  709    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.140646  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2226  methionyl-tRNA synthetase  47.99 
 
 		 686 aa  683    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000556353  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2653  methionyl-tRNA synthetase  51.36 
 
 		 692 aa  708    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.998721  normal  0.311411 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2484  methionyl-tRNA synthetase  48.45 
 
 		 720 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.735844  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19050  methionyl-tRNA synthetase  51.86 
 
 		 678 aa  717    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.153863 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2304  methionyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 717 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1886  methionyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 		 689 aa  700    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000156137  hitchhiker  0.00620527 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2672  methionyl-tRNA synthetase  51.93 
 
 		 678 aa  694    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0717  methionyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 		 679 aa  699    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.638395  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2437  methionyl-tRNA synthetase  47.83 
 
 		 718 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.116232  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2622  methionyl-tRNA synthetase  51.94 
 
 		 680 aa  724    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.931885  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2721  methionyl-tRNA synthetase  49.08 
 
 		 680 aa  698    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1856  methionyl-tRNA synthetase  52.22 
 
 		 686 aa  704    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00031284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1760  methionyl-tRNA synthetase  49.93 
 
 		 676 aa  689    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00800656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2300  methionyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 677 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2344  methionyl-tRNA synthetase  48.79 
 
 		 677 aa  697    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.236169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1617  methionyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 		 717 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1137  methionyl-tRNA synthetase  51 
 
 		 710 aa  708    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2455  methionyl-tRNA synthetase  48.57 
 
 		 675 aa  688    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2049  methionyl-tRNA synthetase  51.51 
 
 		 675 aa  703    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.145243  normal  0.303358 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01984  methionyl-tRNA synthetase  50.86 
 
 		 698 aa  711    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1623  methionyl-tRNA synthetase  48.71 
 
 		 686 aa  687    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.161995 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0939  methionyl-tRNA synthetase  52.2 
 
 		 678 aa  724    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0746683  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>