More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3422 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3422  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3868  ABC transporter related  93.31 
 
 		 239 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3131  ABC transporter ATPase  92.47 
 
 		 239 aa  425  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2779  ABC transporter related  36.96 
 
 		 257 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.02 
 
 		 376 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.84314  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  42.86 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  44.32 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  40.68 
 
 		 233 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.42 
 
 		 283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  38.25 
 
 		 254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  39.61 
 
 		 285 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  42.11 
 
 		 245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  35.39 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6149  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.02 
 
 		 360 aa  113  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2628  ABC transporter  37 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0570  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.17 
 
 		 365 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1511  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 		 358 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280689  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2333  ABC transporter related protein  38.39 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0564  ATPase  35.38 
 
 		 237 aa  112  7.000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0266482 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  36.1 
 
 		 363 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  43.09 
 
 		 403 aa  111  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2875  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 		 230 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0026509  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  40 
 
 		 358 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4235  ABC transporter related  38.04 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  41.88 
 
 		 369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0530  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding protein PhnT  42.25 
 
 		 369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.540583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system ATP-binding component PhnT  42.25 
 
 		 369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0469  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  42.25 
 
 		 369 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6582  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.02 
 
 		 360 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4672  ABC transporter related  42.47 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.592834 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  37.98 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3499  ABC transporter related  38.98 
 
 		 265 aa  110  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.14517  normal  0.695761 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0039  ABC transporter related  37.56 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1305  molybdate ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 		 353 aa  109  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.4508 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  41.05 
 
 		 220 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  35.61 
 
 		 359 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0467  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  41.88 
 
 		 369 aa  109  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2407  ABC transporter-related protein  35.65 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  39.46 
 
 		 246 aa  109  5e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2073  ABC transporter related protein  43.5 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0435  ABC transporter related  41.38 
 
 		 453 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1576  ABC transporter related  36.17 
 
 		 381 aa  108  5e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224014  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2120  ABC transporter related protein  31.37 
 
 		 243 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4361  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  36.49 
 
 		 362 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000264978  normal  0.276396 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1300  ABC transporter related  33.04 
 
 		 356 aa  108  6e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.437284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0308  ABC transporter related  35.56 
 
 		 360 aa  108  7.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  36.61 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  41.62 
 
 		 248 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  37.82 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  37.09 
 
 		 236 aa  108  7.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  35.43 
 
 		 345 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  34.93 
 
 		 364 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  41.14 
 
 		 222 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2267  ABC transporter related protein  42.46 
 
 		 351 aa  108  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  42.86 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  42.29 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3150  ABC transporter component  36.98 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4305  ABC transporter related  37.5 
 
 		 273 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.272884  hitchhiker  0.0022322 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0585  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components  43.86 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1669  ABC transporter related  37.02 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5470  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  32.99 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.867721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  38.42 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0292  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.94 
 
 		 510 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  36.16 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2228  ABC transporter related  31.1 
 
 		 241 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0571204  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4452  ABC transporter related  38.14 
 
 		 380 aa  107  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  36.9 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  42.93 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  35.96 
 
 		 351 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0359  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  32.37 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000171313  hitchhiker  0.000153008 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2657  ABC transporter related  35.56 
 
 		 254 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159789  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  34.47 
 
 		 240 aa  107  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  44.17 
 
 		 362 aa  107  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.82 
 
 		 364 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1782  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.82 
 
 		 364 aa  106  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.132629  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3853  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.17 
 
 		 357 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  40.98 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.31 
 
 		 353 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  37.31 
 
 		 353 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  37.95 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  36.65 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  41.08 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.57 
 
 		 370 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0790  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.66 
 
 		 372 aa  106  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7063  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.65 
 
 		 353 aa  106  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.790238 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  37.77 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0466  ABC transporter related protein  32.26 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  39.77 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  38.46 
 
 		 357 aa  106  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1821  ABC transporter related  37.88 
 
 		 243 aa  106  4e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0936228  hitchhiker  0.0000000174264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3975  ABC transporter related  41.08 
 
 		 243 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.154749  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  37.77 
 
 		 231 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3424  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  43.27 
 
 		 367 aa  106  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.457506  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0832  ABC transporter related  39.57 
 
 		 344 aa  106  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1117  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.49 
 
 		 367 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.417968  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.5 
 
 		 366 aa  105  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2235  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.1 
 
 		 364 aa  105  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1321  ABC transporter related protein  34.23 
 
 		 259 aa  105  5e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 		 365 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2053  ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 		 337 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>