More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1576 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1576  ABC transporter related  100 
 
 		 381 aa  775    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224014  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1641  ABC transporter related  38.48 
 
 		 353 aa  272  7e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0717047  normal  0.0310282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1275  ABC transporter related  39.79 
 
 		 369 aa  270  4e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3882  sugar transport ATP-binding protein  43.93 
 
 		 366 aa  270  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.151408 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0967  ABC transporter related  43.65 
 
 		 368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.855115  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0913  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  43.65 
 
 		 368 aa  269  5.9999999999999995e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.872871  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1091  ABC transporter related  41.71 
 
 		 364 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603928 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1981  ABC transporter related  42.94 
 
 		 368 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114074  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3906  ABC transporter related  40.73 
 
 		 361 aa  267  2e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.294989 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2591  ABC transporter related  42.94 
 
 		 368 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0994309  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0706  ABC transporter related  41.14 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.860798  normal  0.259574 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0120  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.83 
 
 		 357 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2639  ABC transporter related  43.25 
 
 		 369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.716845  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3206  ABC transporter related  42.33 
 
 		 364 aa  266  4e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0268123  normal  0.0421878 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0886  maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  40.49 
 
 		 381 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0347101  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0724  ABC sugar transporter, ATPase subunit  41.23 
 
 		 369 aa  266  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0847542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0894  ABC transporter related  41.82 
 
 		 370 aa  266  5e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0128  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.83 
 
 		 357 aa  266  5.999999999999999e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2615  ABC transporter related  42.94 
 
 		 369 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2712  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  43.95 
 
 		 363 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.12421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2348  ABC transporter related  52.97 
 
 		 368 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.917479  normal  0.103865 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0142  ABC transporter related  40.75 
 
 		 363 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2140  sugar ATP-binding ABC transporter protein  44.41 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.112283  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0759  ABC transporter:TOBE  41.26 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00374684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2957  ABC transporter related  44.24 
 
 		 360 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3512  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.67 
 
 		 362 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0362101  normal  0.0791586 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5922  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  42.33 
 
 		 369 aa  264  2e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1322  ABC transporter related protein  44.24 
 
 		 360 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4975  ABC transporter related  44.48 
 
 		 359 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.485856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3242  ABC transporter related  41.52 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1699  ABC transporter related  38.99 
 
 		 355 aa  263  3e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2507  ABC transporter related  41.28 
 
 		 369 aa  263  3e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0382888  normal  0.462927 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3851  ABC transporter related  42.94 
 
 		 375 aa  263  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  47.17 
 
 		 361 aa  263  4e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17000  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  42.37 
 
 		 364 aa  263  4.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.781259 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3618  ABC transporter related  41.25 
 
 		 361 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0445  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.24 
 
 		 362 aa  262  8e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  44.52 
 
 		 356 aa  261  1e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0788  ABC transporter related  54.3 
 
 		 335 aa  260  2e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  47.1 
 
 		 357 aa  261  2e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0854  ABC transporter related  43.35 
 
 		 340 aa  260  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.627153 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0867  ABC transporter related  43.48 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4163  ABC transporter related  44.55 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.308021  normal  0.489611 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  46.18 
 
 		 349 aa  261  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2913  ABC transporter for sugar/spermidine/putrescine/iron/thiamine ATP-binding protein  40.73 
 
 		 366 aa  261  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8165  ABC transporter related  44.3 
 
 		 364 aa  261  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0859  ABC transporter related  54.3 
 
 		 335 aa  261  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.928128 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.72 
 
 		 349 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3814  ABC transporter related  39.48 
 
 		 371 aa  261  2e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.39251  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3127  maltose/maltodextrin transporter ATP-binding protein  42.99 
 
 		 371 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.507344  normal  0.0367052 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 349 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4042  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.02 
 
 		 358 aa  260  3e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  45.3 
 
 		 353 aa  259  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0975  ABC transporter related protein  40 
 
 		 361 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0661  glycerol-3-phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  46.62 
 
 		 368 aa  259  6e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1992  ABC transporter related  36.59 
 
 		 426 aa  259  6e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.394996  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0607  ABC transporter related  39.5 
 
 		 355 aa  259  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000630486 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4422  ABC transporter related protein  46.99 
 
 		 398 aa  259  8e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.945238  normal  0.406817 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1158  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.19 
 
 		 372 aa  258  9e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  42.86 
 
 		 349 aa  258  9e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2583  ABC transporter related  47.62 
 
 		 353 aa  258  9e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0115601  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0337  maltose/mannitol ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.43 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.111228  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3116  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  44.55 
 
 		 369 aa  258  1e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12730  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.306152  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0636  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275932  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2470  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0243761  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0877  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0880  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 		 388 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0084  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.43 
 
 		 370 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.145989  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5504  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  45.03 
 
 		 381 aa  258  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2324  ABC transporter related  45.15 
 
 		 381 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.517442  normal  0.838202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0892  ABC transporter-related protein  41.41 
 
 		 357 aa  257  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1284  ABC transporter related  41.04 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2347  ABC transporter related  45.3 
 
 		 379 aa  257  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590876 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3388  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.36 
 
 		 369 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.745344  normal  0.270179 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1262  ABC transporter related  37.8 
 
 		 357 aa  258  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0750  ABC transporter related  44.48 
 
 		 363 aa  257  2e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4484  ABC transporter-related protein  36.55 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00113019  normal  0.0744175 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0739  ABC transporter related  39.29 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1250  ABC transporter related  46.26 
 
 		 351 aa  258  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.440423 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1040  ABC sugar transporter, ATP-binding protein  41.53 
 
 		 370 aa  257  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2017  sn-glycerol-3-phosphate import ATP-binding protein  38.38 
 
 		 333 aa  257  3e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0314304 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0494  ABC transporter related  42.06 
 
 		 369 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952416  decreased coverage  0.000489409 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  44.67 
 
 		 355 aa  256  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3858  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  39.28 
 
 		 358 aa  256  3e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3656  ATPase  41.39 
 
 		 366 aa  256  4e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5155  ABC transporter related protein  43.03 
 
 		 395 aa  256  5e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.766387 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2096  ABC transporter ATP-binding protein  41.45 
 
 		 373 aa  256  5e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.425612 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03299  glycerol-3-phosphate transporter subunit  40.65 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.90322  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03252  hypothetical protein  40.65 
 
 		 356 aa  256  6e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22470  ATPase component of ABC-type sugar transporter  42.68 
 
 		 359 aa  256  6e-67  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2710  ABC transporter related  43.99 
 
 		 333 aa  256  6e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4396  ABC transporter related  38.06 
 
 		 370 aa  256  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.625138  normal  0.658591 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7445  ABC transporter related  46.23 
 
 		 371 aa  255  7e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  42.17 
 
 		 353 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5799  ABC transporter related protein  39.72 
 
 		 398 aa  255  8e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.171688 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0064  ABC transporter related  40.25 
 
 		 380 aa  255  8e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  38.56 
 
 		 360 aa  255  8e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3647  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.58 
 
 		 356 aa  255  9e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0266  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  41.58 
 
 		 356 aa  255  9e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0202281  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>