More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_3868 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_3868  ABC transporter related  100 
 
 		 239 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0461389  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3131  ABC transporter ATPase  97.91 
 
 		 239 aa  447  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0239588  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3422  hypothetical protein  93.31 
 
 		 239 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2779  ABC transporter related  36.96 
 
 		 257 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3022  ABC transporter related  41.71 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  decreased coverage  0.000385784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4213  ABC transporter related  39.71 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6149  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.02 
 
 		 360 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2628  ABC transporter  38.5 
 
 		 230 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.166504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3644  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.18 
 
 		 376 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.84314  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2875  ABC transporter, ATP-binding protein  39 
 
 		 230 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0026509  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1511  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  38.02 
 
 		 358 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.280689  normal  0.146459 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2961  ABC transporter related  44.07 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.109609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4235  ABC transporter related  38.71 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6582  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.02 
 
 		 360 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.34057 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2251  ABC transporter-like  34.27 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00178125  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0209  nitrate ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.28 
 
 		 283 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.465549 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3699  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.07 
 
 		 230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752092 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  37.16 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0564  ATPase  34.91 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0266482 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3943  ABC transporter related  43.68 
 
 		 403 aa  111  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.39994  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5009  ABC transporter related  38.16 
 
 		 285 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0839  taurine transporter ATP-binding subunit  37.38 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0541  ABC transporter related protein  38.42 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0570  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.65 
 
 		 365 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.124586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1942  ABC transporter related  39.34 
 
 		 254 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.934009  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0279  taurine transporter ATP-binding subunit  38.54 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2067  peptide ABC transporter ATP-binding protein  42.39 
 
 		 240 aa  109  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2120  ABC transporter related protein  32.67 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0346  ABC transporter related  43.5 
 
 		 227 aa  109  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.11442  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2657  ABC transporter related  35.56 
 
 		 254 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000159789  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1534  polyamine transport protein PotA  36.1 
 
 		 359 aa  109  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0441  taurine transporter ATP-binding subunit  38.54 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1553  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  43.56 
 
 		 362 aa  108  6e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00925156  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1542  ABC transporter, ATPase subunit  41.71 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0585  ABC-type spermidine/putrescine transport systems, ATPase components  43.86 
 
 		 365 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0087071  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0039  ABC transporter related  36.59 
 
 		 359 aa  108  8.000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  39.8 
 
 		 369 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17640  polyamine transport protein PotA  35.61 
 
 		 363 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3241  ABC transporter related protein  37.77 
 
 		 255 aa  108  9.000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4105  ABC transporter-like  37.22 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.479165 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0467  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  39.8 
 
 		 369 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1918  ABC transporter related  39.58 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2085  ABC-type transport system, putative ATPase component  36.32 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.218522  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3150  ABC transporter component  38.02 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2656  ABC transporter, ATPase subunit  41.08 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.177844  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4361  spermidine/putrescine ABC transporter ATP-binding subunit  39.04 
 
 		 362 aa  107  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000264978  normal  0.276396 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0833  ABC transporter related  38.92 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.557912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0475  2-aminoethylphosphonate ABC transport system ATP-binding component PhnT  41.08 
 
 		 369 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.47979 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0488  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 		 365 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.296007  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0292  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  38.94 
 
 		 510 aa  107  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.429579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5857  ABC transporter related  38.34 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.105187  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1972  ABC transporter related  36.9 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2053  ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.514983  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3424  2-aminoethylphosphonate ABC transport system, ATP-binding component PhnT  43.27 
 
 		 367 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.457506  normal  0.0648028 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2109  ABC transporter related protein  37.95 
 
 		 226 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3075  ABC transporter related  37.95 
 
 		 357 aa  107  2e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.106558 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0530  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding protein PhnT  41.08 
 
 		 369 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.540583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0469  2-aminoethylphosphonate ABC transporter ATP-binding component PhnT  41.08 
 
 		 369 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0466  ABC transporter related  41.3 
 
 		 361 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.305347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2028  ABC transporter related  41.24 
 
 		 221 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00316  taurine transporter subunit  37.23 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3262  taurine transporter ATP-binding subunit  37.23 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0856  ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 		 337 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0425057  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1901  ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 		 337 aa  106  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2213  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 		 365 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.527977  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4263  ABC transporter related  35.81 
 
 		 364 aa  106  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2005  ABC transporter related  47.93 
 
 		 378 aa  106  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.833855  normal  0.0467613 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0430  taurine transporter ATP-binding subunit  37.23 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  38.01 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0193  ABC transporter related  41.14 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.334053  normal  0.472012 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1178  ABC transporter related  40 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00268171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3743  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  41.01 
 
 		 370 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4660  ABC transporter related  43.27 
 
 		 367 aa  106  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0960037  normal  0.0689846 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0897  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 		 365 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106898  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00320  hypothetical protein  37.23 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2474  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  36.9 
 
 		 353 aa  106  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1759  2-aminoethylphosphonate ABC transporter, ATP-binding protein  43.86 
 
 		 365 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0354405  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4672  ABC transporter related  42.47 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.592834 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1149  ABC transporter related  39.39 
 
 		 358 aa  106  3e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  40.54 
 
 		 244 aa  106  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1871  ABC transporter related protein  34.95 
 
 		 240 aa  106  4e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000629259  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3743  ABC transporter  40 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.153359  normal  0.0240293 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0395  taurine transporter ATP-binding subunit  37.5 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  40.54 
 
 		 244 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1576  ABC transporter related  36.17 
 
 		 381 aa  106  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224014  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1865  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.46 
 
 		 364 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.919871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2630  ABC transporter related  47.34 
 
 		 378 aa  106  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0792503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1576  ABC transporter related  37.5 
 
 		 236 aa  106  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2289  ABC transporter related protein  44.81 
 
 		 391 aa  105  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3735  ABC transporter ATP-binding protein  41.24 
 
 		 221 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1602  ABC transporter  40.46 
 
 		 329 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0412984 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6545  ABC transporter related  36.95 
 
 		 351 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.423857 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0349  ABC transporter, ATPase subunit  43.27 
 
 		 367 aa  105  5e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0448761  normal  0.766328 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10131  ABC transporter, ATP-binding component  39.67 
 
 		 251 aa  105  5e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0945741 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1874  ABC transporter, ATPase subunit  40.96 
 
 		 366 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.209056  normal  0.189934 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2540  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  39.08 
 
 		 364 aa  105  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.534677 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0446  putative polar amino acid transport system ATP-binding protein  36.92 
 
 		 244 aa  105  5e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0642  ABC transporter related  37.04 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0483  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein LolD  37.04 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>