268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3080 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_3080  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  100 
 
 		 455 aa  874    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.153672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0691  DNA photolyase domain-containing protein  72.84 
 
 		 454 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1981  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  66.96 
 
 		 454 aa  502  1e-141  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1225  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.11 
 
 		 514 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.474608  normal  0.333965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1873  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  42.51 
 
 		 517 aa  269  7e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543845 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1651  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.33 
 
 		 496 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0708  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.89 
 
 		 493 aa  209  6e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03991  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  25.6 
 
 		 503 aa  193  5e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03931  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  25.75 
 
 		 498 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03921  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  25.11 
 
 		 498 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.322027  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3105  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.4 
 
 		 505 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1306  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.71 
 
 		 507 aa  167  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0779  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.55 
 
 		 504 aa  164  3e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0151  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.11 
 
 		 495 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617218  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001126  deoxyribodipyrimidine photolyase/cryptochrome family protein  26.43 
 
 		 493 aa  164  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00185581  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1248  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.69 
 
 		 493 aa  163  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00593835 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3951  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.2 
 
 		 526 aa  149  8e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1549  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.62 
 
 		 517 aa  144  3e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701631  normal  0.426947 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06659  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.86 
 
 		 493 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0600  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.07 
 
 		 561 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_1947  cyclobutane pyrimidine dimer 1  25.4 
 
 		 515 aa  130  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000588882  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1163  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.71 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3586  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.47 
 
 		 487 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1112  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.27 
 
 		 487 aa  121  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196695  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1004  cryptochrome Cry2  26.46 
 
 		 504 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.72 
 
 		 487 aa  113  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0343  cryptochrome, DASH family  25.21 
 
 		 488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2343  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.47 
 
 		 389 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.84 
 
 		 483 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.28 
 
 		 491 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.83 
 
 		 475 aa  110  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.13 
 
 		 497 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0723  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.94 
 
 		 472 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.867142 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.39 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0814  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.77 
 
 		 490 aa  106  7e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.54 
 
 		 472 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05122  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.44 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6186  cryptochrome, DASH family  25.2 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.73 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  27.89 
 
 		 473 aa  104  4e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.89 
 
 		 472 aa  104  4e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.89 
 
 		 472 aa  104  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4538  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  22.4 
 
 		 498 aa  103  5e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.43 
 
 		 477 aa  103  5e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  27.81 
 
 		 456 aa  103  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4658  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.93 
 
 		 476 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0553081  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.84 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.6 
 
 		 479 aa  102  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.22 
 
 		 463 aa  102  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.82 
 
 		 484 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2928  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.69 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1152  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.02 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0172656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0729  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.85 
 
 		 483 aa  101  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.78 
 
 		 481 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0755  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.69 
 
 		 472 aa  102  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.391934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.82 
 
 		 476 aa  101  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1134  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.81 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172014  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0866  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.12 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  29.11 
 
 		 468 aa  101  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0756  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.71 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.645703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.68 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.33 
 
 		 499 aa  101  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0700  cryptochrome, DASH family  23.55 
 
 		 488 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0915  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.9 
 
 		 477 aa  101  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.6 
 
 		 478 aa  100  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.24 
 
 		 493 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.15 
 
 		 452 aa  100  5e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1613  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.32 
 
 		 425 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0831  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.12 
 
 		 473 aa  99.8  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.31293  hitchhiker  0.0019608 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0798  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.81 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1262  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.11 
 
 		 463 aa  99.8  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0769  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.12 
 
 		 473 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.568717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0817  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.12 
 
 		 473 aa  97.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.64 
 
 		 469 aa  98.2  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0811  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.33 
 
 		 475 aa  97.8  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  25.43 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  27.74 
 
 		 472 aa  97.8  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1615  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.23 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02013  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  28.7 
 
 		 478 aa  97.4  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000664179  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.96 
 
 		 482 aa  97.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0729  cryptochrome, DASH family  23.35 
 
 		 488 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264496  normal  0.107921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.93 
 
 		 454 aa  97.1  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0288  DNA photolyase FAD-binding  27.06 
 
 		 465 aa  96.3  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.155544  normal  0.119697 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.82 
 
 		 497 aa  95.9  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.25 
 
 		 481 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3894  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.42 
 
 		 470 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2595  cryptochrome, DASH family  26.25 
 
 		 478 aa  94.4  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0775599  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  21.61 
 
 		 476 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3369  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.04 
 
 		 526 aa  94  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.149993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  24.16 
 
 		 474 aa  94  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0565  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.21 
 
 		 518 aa  93.6  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3694  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.15 
 
 		 484 aa  93.6  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2665  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.58 
 
 		 501 aa  93.6  7e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  24.57 
 
 		 471 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.46 
 
 		 476 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0617  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28 
 
 		 518 aa  92.4  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00814306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1364  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.33 
 
 		 473 aa  92.4  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  26.55 
 
 		 477 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0778  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.12 
 
 		 453 aa  91.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0703  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.16 
 
 		 525 aa  91.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>