297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0343 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4538  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  66.94 
 
 		 498 aa  704    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0343  cryptochrome, DASH family  100 
 
 		 488 aa  1013    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0729  cryptochrome, DASH family  75 
 
 		 488 aa  788    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264496  normal  0.107921 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0700  cryptochrome, DASH family  74.79 
 
 		 488 aa  791    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6186  cryptochrome, DASH family  52.72 
 
 		 487 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1053  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  50.47 
 
 		 434 aa  442  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2235  cryptochrome, DASH family  46.22 
 
 		 483 aa  440  9.999999999999999e-123  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.14399  normal  0.570848 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29275  predicted protein  42.91 
 
 		 551 aa  410  1e-113  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2595  cryptochrome, DASH family  43.76 
 
 		 478 aa  399  9.999999999999999e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0775599  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34592  cry-dash from the cryptochrome/photolyase family  43.75 
 
 		 610 aa  392  1e-108  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07806  probable bacterial cryptochrome  44.39 
 
 		 421 aa  353  5e-96  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1411  cryptochrome, DASH family  38.17 
 
 		 447 aa  309  9e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0320  DNA photolyase FAD-binding subunit  40.47 
 
 		 440 aa  306  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000796  deoxyribodipyrimidine photolyase single-strand-specific  40.5 
 
 		 444 aa  298  2e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1410  RNA-binding cryptochrome Cry1  40.27 
 
 		 461 aa  294  2e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3718  cryptochrome, DASH family  38.84 
 
 		 430 aa  289  7e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0336  cryptochrome DASH  39.24 
 
 		 441 aa  288  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0152  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.14 
 
 		 445 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06693  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.24 
 
 		 460 aa  277  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3953  cryptochrome, DASH family  35.76 
 
 		 515 aa  277  3e-73  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4337  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.91 
 
 		 396 aa  273  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4658  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.72 
 
 		 476 aa  255  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0553081  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.25 
 
 		 487 aa  249  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1548  DNA photolyase FAD-binding subunit  36.51 
 
 		 448 aa  248  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3098  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.94 
 
 		 487 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.383524  normal  0.0341678 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1613  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.12 
 
 		 425 aa  242  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.46 
 
 		 491 aa  236  6e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3589  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.52 
 
 		 483 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.4 
 
 		 475 aa  232  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.15 
 
 		 479 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  33.13 
 
 		 471 aa  231  3e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  33.13 
 
 		 471 aa  230  5e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.42 
 
 		 483 aa  229  7e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2364  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.85 
 
 		 487 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.45 
 
 		 481 aa  226  8e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.89 
 
 		 481 aa  226  9e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0814  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.23 
 
 		 490 aa  225  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.66 
 
 		 481 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0906  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.39 
 
 		 493 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207875  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.26 
 
 		 478 aa  223  7e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_27429  cryptochrome photolyase family 1  30.87 
 
 		 550 aa  221  1.9999999999999999e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0475276  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.18 
 
 		 486 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.6 
 
 		 474 aa  220  5e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1577  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.64 
 
 		 493 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547552  normal  0.6563 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4676  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.91 
 
 		 500 aa  217  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.499221 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1604  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.3 
 
 		 486 aa  217  4e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0241  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.04 
 
 		 492 aa  217  4e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.76 
 
 		 484 aa  216  8e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.75 
 
 		 488 aa  216  8e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3356  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.2 
 
 		 483 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  33.06 
 
 		 468 aa  215  9.999999999999999e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  32.58 
 
 		 474 aa  215  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0813  hypothetical protein  29.92 
 
 		 486 aa  216  9.999999999999999e-55  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.182333 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.02 
 
 		 475 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3963  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.59 
 
 		 511 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000556996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1880  DNA photolyase  32.78 
 
 		 483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.99 
 
 		 476 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2095  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.63 
 
 		 500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3694  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.17 
 
 		 484 aa  213  5.999999999999999e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5488  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.56 
 
 		 518 aa  212  9e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1921  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.17 
 
 		 488 aa  212  1e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.37 
 
 		 476 aa  212  1e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2217  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.84 
 
 		 525 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.511177  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.84 
 
 		 499 aa  212  2e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0575  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.55 
 
 		 468 aa  211  3e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.35 
 
 		 476 aa  209  9e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5849  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.72 
 
 		 505 aa  209  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2665  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.52 
 
 		 501 aa  209  9e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4409  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.58 
 
 		 504 aa  209  1e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.735576 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.52 
 
 		 476 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.52 
 
 		 476 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3193  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.25 
 
 		 476 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.52 
 
 		 476 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3894  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.34 
 
 		 470 aa  207  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0704  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.13 
 
 		 497 aa  207  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0439  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.82 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5903  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.26 
 
 		 436 aa  206  7e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.4 
 
 		 472 aa  206  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  30.4 
 
 		 473 aa  206  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.4 
 
 		 472 aa  205  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3349  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.88 
 
 		 477 aa  205  1e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2196  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.14 
 
 		 519 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2928  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.04 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0755  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.04 
 
 		 472 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.391934  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2677  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.9 
 
 		 486 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.33 
 
 		 481 aa  205  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.57 
 
 		 490 aa  204  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5899  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.93 
 
 		 519 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0769953  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.93 
 
 		 519 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1163  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.04 
 
 		 487 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2734  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.9 
 
 		 486 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.913993  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.2 
 
 		 472 aa  204  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3180  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  30.25 
 
 		 469 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2800  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.9 
 
 		 486 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1623  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.68 
 
 		 482 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  30.71 
 
 		 456 aa  203  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0723  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.8 
 
 		 472 aa  203  6e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.867142 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3586  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.84 
 
 		 487 aa  203  6e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0112  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.14 
 
 		 484 aa  203  7e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00531501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.4 
 
 		 478 aa  202  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.219923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>