294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0320 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0320  DNA photolyase FAD-binding subunit  100 
 
 		 440 aa  910    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0152  deoxyribodipyrimidine photolyase  50.34 
 
 		 445 aa  426  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1548  DNA photolyase FAD-binding subunit  45.21 
 
 		 448 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06693  deoxyribodipyrimidine photolyase  47.07 
 
 		 460 aa  380  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000796  deoxyribodipyrimidine photolyase single-strand-specific  46.64 
 
 		 444 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0336  cryptochrome DASH  45.68 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1410  RNA-binding cryptochrome Cry1  45.75 
 
 		 461 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0729  cryptochrome, DASH family  38.91 
 
 		 488 aa  309  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264496  normal  0.107921 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6186  cryptochrome, DASH family  41.93 
 
 		 487 aa  309  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0700  cryptochrome, DASH family  38.46 
 
 		 488 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0343  cryptochrome, DASH family  40.47 
 
 		 488 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1053  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.75 
 
 		 434 aa  305  8.000000000000001e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4538  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.3 
 
 		 498 aa  288  1e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1411  cryptochrome, DASH family  40 
 
 		 447 aa  268  2e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2595  cryptochrome, DASH family  38.94 
 
 		 478 aa  257  2e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0775599  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2235  cryptochrome, DASH family  37.16 
 
 		 483 aa  253  5.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.14399  normal  0.570848 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07806  probable bacterial cryptochrome  35.93 
 
 		 421 aa  250  3e-65  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3953  cryptochrome, DASH family  36.58 
 
 		 515 aa  237  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29275  predicted protein  32.11 
 
 		 551 aa  231  2e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34592  cry-dash from the cryptochrome/photolyase family  33.4 
 
 		 610 aa  211  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3718  cryptochrome, DASH family  30.33 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4337  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.15 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.02 
 
 		 452 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.63 
 
 		 479 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.64 
 
 		 499 aa  166  8e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.65 
 
 		 493 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.61 
 
 		 487 aa  162  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0241  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.59 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.22 
 
 		 463 aa  161  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.89 
 
 		 491 aa  159  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0080  deoxyribodipyrimidine photolyase, cyclobutane pyrimidine dimer-specific  29.77 
 
 		 469 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000198558  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.93 
 
 		 477 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2305  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.05 
 
 		 467 aa  157  3e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000471562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1479  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.33 
 
 		 478 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5903  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.42 
 
 		 436 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.72 
 
 		 476 aa  156  7e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  29.55 
 
 		 471 aa  156  8e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.96 
 
 		 490 aa  155  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  29.55 
 
 		 471 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4658  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.56 
 
 		 476 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0553081  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.59 
 
 		 497 aa  155  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1165  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.68 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.05 
 
 		 470 aa  154  4e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.77 
 
 		 493 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1166  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.79 
 
 		 493 aa  153  5e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0239  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.11 
 
 		 477 aa  152  8e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.52668  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0061  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.93 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.8 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0241  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.8 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.581458 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0994  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.14 
 
 		 462 aa  151  2e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11303  deoxyribodipyrimidine photolyase-class I  27.63 
 
 		 434 aa  150  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.68 
 
 		 474 aa  150  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.84 
 
 		 482 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.33 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.77 
 
 		 482 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3054  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.91 
 
 		 505 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.746759  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.51 
 
 		 481 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.62 
 
 		 500 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  31.19 
 
 		 468 aa  147  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.53 
 
 		 476 aa  147  3e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0439  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.22 
 
 		 435 aa  147  4.0000000000000006e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.04 
 
 		 477 aa  147  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.84 
 
 		 434 aa  147  5e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.02 
 
 		 488 aa  146  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.64 
 
 		 481 aa  146  6e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.06 
 
 		 486 aa  146  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1309  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.76 
 
 		 499 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1577  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.77 
 
 		 493 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547552  normal  0.6563 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3586  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.28 
 
 		 487 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1112  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.28 
 
 		 487 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196695  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3589  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.25 
 
 		 483 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.15 
 
 		 481 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3098  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.93 
 
 		 487 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.383524  normal  0.0341678 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0998  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.34 
 
 		 453 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1163  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.44 
 
 		 487 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3211  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.07 
 
 		 499 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6799  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.07 
 
 		 499 aa  144  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000114492  decreased coverage  0.000000135491 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0756  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.25 
 
 		 473 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.645703  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1302  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.05 
 
 		 456 aa  144  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.674491  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1364  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.68 
 
 		 473 aa  143  6e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6960  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.01 
 
 		 434 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.386716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3694  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.77 
 
 		 484 aa  143  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0213  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.71 
 
 		 477 aa  143  7e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.615271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03081  putative DNA photolyase  28.88 
 
 		 477 aa  143  8e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.7 
 
 		 481 aa  143  8e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0940349 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3384  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.26 
 
 		 512 aa  142  9e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0831  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.25 
 
 		 473 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.31293  hitchhiker  0.0019608 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00387  DNA photolyase (Eurofung)  29.2 
 
 		 567 aa  141  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.892479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3894  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.66 
 
 		 470 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.78 
 
 		 484 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2021  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.78 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.128536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4409  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.89 
 
 		 504 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.735576 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.78 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0866  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.02 
 
 		 473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2084  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.78 
 
 		 445 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.8 
 
 		 488 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0575  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.82 
 
 		 468 aa  140  3e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0906  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.04 
 
 		 493 aa  140  3e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207875  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0817  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.79 
 
 		 473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0811  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.7 
 
 		 475 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>