More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A9601_03081 on replicon NC_008816
Organism: Prochlorococcus marinus str. AS9601



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_03081  putative DNA photolyase  100 
 
 		 477 aa  983    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0287  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  89.54 
 
 		 478 aa  889    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03091  putative DNA photolyase  94.35 
 
 		 478 aa  932    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03181  putative DNA photolyase  72.78 
 
 		 478 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0239  deoxyribodipyrimidine photolyase  49.17 
 
 		 477 aa  495  1e-139  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.52668  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0213  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  48.76 
 
 		 477 aa  492  9.999999999999999e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.615271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03651  putative DNA photolyase  50.1 
 
 		 504 aa  481  1e-134  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1651  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  50.3 
 
 		 493 aa  478  1e-133  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309463  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  49.9 
 
 		 481 aa  448  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  50 
 
 		 474 aa  451  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0112  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  46.97 
 
 		 484 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00531501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  49.69 
 
 		 481 aa  442  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4292  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  47.73 
 
 		 479 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  47.69 
 
 		 475 aa  435  1e-120  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0241  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.47 
 
 		 475 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.581458 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0776  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  47.17 
 
 		 479 aa  417  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0436296  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.68 
 
 		 479 aa  317  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  38.28 
 
 		 471 aa  298  1e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.15 
 
 		 487 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  37.95 
 
 		 471 aa  295  8e-79  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1623  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.08 
 
 		 482 aa  295  9e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  37.71 
 
 		 474 aa  295  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4692  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.51 
 
 		 476 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.71 
 
 		 481 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0994  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.62 
 
 		 462 aa  290  5.0000000000000004e-77  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.34 
 
 		 475 aa  289  7e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.44 
 
 		 452 aa  289  9e-77  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3894  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.76 
 
 		 470 aa  288  1e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2844  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.84 
 
 		 499 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.55 
 
 		 483 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1437  DNA photolyase FAD-binding  32.48 
 
 		 514 aa  287  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.98 
 
 		 484 aa  286  7e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6960  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.36 
 
 		 434 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.386716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2879  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.61 
 
 		 470 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1880  DNA photolyase  37 
 
 		 483 aa  284  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6799  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.43 
 
 		 499 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000114492  decreased coverage  0.000000135491 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1969  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.73 
 
 		 486 aa  283  6.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3963  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.72 
 
 		 511 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000556996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3694  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.4 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.73 
 
 		 491 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0704  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.21 
 
 		 497 aa  280  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2541  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.48 
 
 		 466 aa  280  4e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.272644 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2305  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.29 
 
 		 467 aa  279  7e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000471562  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.75 
 
 		 488 aa  279  1e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0575  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.9 
 
 		 468 aa  278  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4249  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.28 
 
 		 442 aa  277  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1921  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.75 
 
 		 488 aa  276  4e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1577  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.33 
 
 		 493 aa  276  7e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547552  normal  0.6563 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3349  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.99 
 
 		 477 aa  276  8e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4409  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.29 
 
 		 504 aa  275  9e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.735576 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0029  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.17 
 
 		 438 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.919202  normal  0.63493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0061  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.53 
 
 		 431 aa  274  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0906  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.13 
 
 		 493 aa  273  6e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207875  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.11 
 
 		 469 aa  272  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2745  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.33 
 
 		 513 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0241  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.55 
 
 		 492 aa  270  2.9999999999999997e-71  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11303  deoxyribodipyrimidine photolyase-class I  36.53 
 
 		 434 aa  270  4e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0565  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33 
 
 		 518 aa  269  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.78 
 
 		 483 aa  266  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.94 
 
 		 490 aa  266  8e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1145  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.12 
 
 		 476 aa  265  8.999999999999999e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0617  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.44 
 
 		 518 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00814306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1364  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.23 
 
 		 473 aa  265  1e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0729  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.34 
 
 		 483 aa  264  2e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0080  deoxyribodipyrimidine photolyase, cyclobutane pyrimidine dimer-specific  36.04 
 
 		 469 aa  264  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000198558  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.47 
 
 		 478 aa  264  3e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.34 
 
 		 478 aa  263  4e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2747  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.23 
 
 		 474 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00995843  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  33.76 
 
 		 476 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1958  deoxyribodipyrimidine photolyase (photoreactivating enzyme)  33.97 
 
 		 433 aa  263  6e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021636 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.79 
 
 		 470 aa  262  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.11 
 
 		 463 aa  262  1e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0798  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.55 
 
 		 472 aa  261  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  33.33 
 
 		 476 aa  261  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1562  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.13 
 
 		 471 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.51951  normal  0.490223 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0915  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.43 
 
 		 477 aa  261  2e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1376  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.33 
 
 		 492 aa  261  2e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.34 
 
 		 472 aa  261  3e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2364  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.06 
 
 		 487 aa  260  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2087  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.04 
 
 		 434 aa  259  7e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0527605  normal  0.0533895 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  37.13 
 
 		 473 aa  258  1e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.08 
 
 		 492 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.13 
 
 		 472 aa  258  1e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2665  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.56 
 
 		 501 aa  259  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.29 
 
 		 476 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.13 
 
 		 472 aa  258  1e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0703  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.92 
 
 		 525 aa  258  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5488  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.77 
 
 		 518 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  36.92 
 
 		 456 aa  258  2e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0756  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.56 
 
 		 473 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.645703  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  33.12 
 
 		 499 aa  258  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.51 
 
 		 476 aa  257  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  32.27 
 
 		 476 aa  257  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2095  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.07 
 
 		 500 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0866  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.56 
 
 		 473 aa  257  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  32.27 
 
 		 476 aa  257  3e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  36.12 
 
 		 472 aa  257  4e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.54 
 
 		 454 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4618  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.19 
 
 		 515 aa  256  4e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.82 
 
 		 486 aa  257  4e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>