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for query gene Slin_0029 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0029  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  100 
 
 
438 aa  912    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.919202  normal  0.63493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4249  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  58.26 
 
 
442 aa  535  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6960  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  59.31 
 
 
434 aa  529  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.386716  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11303  deoxyribodipyrimidine photolyase-class I  51.49 
 
 
434 aa  468  9.999999999999999e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2087  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  50 
 
 
434 aa  462  1e-129  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0527605  normal  0.0533895 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1958  deoxyribodipyrimidine photolyase (photoreactivating enzyme)  49.76 
 
 
433 aa  449  1e-125  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0061  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  49.32 
 
 
431 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  46.09 
 
 
481 aa  412  1e-114  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0704  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  45.04 
 
 
497 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  45.88 
 
 
488 aa  386  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3349  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.7 
 
 
477 aa  385  1e-106  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355989  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1577  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.54 
 
 
493 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547552  normal  0.6563 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1921  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.88 
 
 
488 aa  385  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2844  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  45.42 
 
 
499 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758456  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3894  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  45.69 
 
 
470 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6799  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.58 
 
 
499 aa  380  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000114492  decreased coverage  0.000000135491 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4409  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.26 
 
 
504 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.735576 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3963  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.56 
 
 
511 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000556996 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3694  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.19 
 
 
484 aa  375  1e-103  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4618  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  43.22 
 
 
515 aa  372  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0241  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.83 
 
 
492 aa  367  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0906  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  45.02 
 
 
493 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207875  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.79 
 
 
490 aa  362  8e-99  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0617  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.68 
 
 
518 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00814306  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0565  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.89 
 
 
518 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470462  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2745  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  43.89 
 
 
513 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1376  deoxyribodipyrimidine photolyase  42.77 
 
 
492 aa  351  1e-95  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0703  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  42.32 
 
 
525 aa  339  5e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0994  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.2 
 
 
462 aa  334  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.49 
 
 
479 aa  329  5.0000000000000004e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.46 
 
 
487 aa  324  2e-87  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.06 
 
 
491 aa  318  9e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0776  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.57 
 
 
479 aa  316  6e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0436296  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.73 
 
 
474 aa  308  1.0000000000000001e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1151  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.66 
 
 
452 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.146213  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.13 
 
 
463 aa  304  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.7 
 
 
475 aa  303  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1969  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.75 
 
 
486 aa  303  5.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4292  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.05 
 
 
479 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.04 
 
 
478 aa  300  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.63 
 
 
481 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.53 
 
 
481 aa  298  2e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2305  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.34 
 
 
467 aa  296  4e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000471562  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0241  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.44 
 
 
475 aa  294  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.581458 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0810  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.84 
 
 
470 aa  294  3e-78  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.24 
 
 
481 aa  292  9e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0940349 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0465  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.58 
 
 
473 aa  289  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.24 
 
 
477 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1623  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.58 
 
 
482 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  37.39 
 
 
471 aa  284  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  37.18 
 
 
471 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.08 
 
 
477 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5849  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.74 
 
 
505 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2879  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.84 
 
 
470 aa  282  8.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0798  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.97 
 
 
472 aa  282  9e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3211  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.63 
 
 
499 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.941968 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  36.97 
 
 
473 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1437  DNA photolyase FAD-binding  35.99 
 
 
514 aa  280  4e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.97 
 
 
472 aa  280  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.97 
 
 
472 aa  280  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.75 
 
 
472 aa  279  9e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3054  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.51 
 
 
505 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.746759  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0866  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.08 
 
 
473 aa  278  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.55052 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2928  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.97 
 
 
472 aa  278  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0756  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.08 
 
 
473 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.645703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1309  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.18 
 
 
499 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0755  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.97 
 
 
472 aa  278  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.391934  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.38 
 
 
493 aa  278  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0575  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.91 
 
 
468 aa  278  2e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2541  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.86 
 
 
466 aa  277  2e-73  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.272644 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0831  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.08 
 
 
473 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.31293  hitchhiker  0.0019608 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0723  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.18 
 
 
472 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.867142 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.31 
 
 
500 aa  277  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.02 
 
 
475 aa  276  4e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0769  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.5 
 
 
473 aa  276  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.568717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.29 
 
 
483 aa  276  5e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.7 
 
 
434 aa  275  8e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03081  putative DNA photolyase  35.17 
 
 
477 aa  275  9e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1479  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.98 
 
 
478 aa  275  9e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.37 
 
 
482 aa  273  3e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.91 
 
 
471 aa  274  3e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.88 
 
 
482 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.44 
 
 
488 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03091  putative DNA photolyase  35.23 
 
 
478 aa  273  4.0000000000000004e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1611  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.52 
 
 
445 aa  273  6e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0817  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.65 
 
 
473 aa  272  8.000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  37 
 
 
456 aa  271  1e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0998  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.22 
 
 
453 aa  272  1e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0287  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.44 
 
 
478 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0112  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.83 
 
 
484 aa  271  2e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00531501  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.34 
 
 
497 aa  271  2e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1152  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.42 
 
 
470 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0172656  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.79 
 
 
480 aa  270  4e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.16 
 
 
499 aa  270  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03651  putative DNA photolyase  33.68 
 
 
504 aa  270  5e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305782  normal 
 
 
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NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.33 
 
 
484 aa  269  7e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010501  PputW619_4450  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.4 
 
 
480 aa  269  7e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008700  Sama_0811  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.06 
 
 
475 aa  269  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009512  Pput_0767  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35 
 
 
475 aa  269  8e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007335  PMN2A_1651  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.79 
 
 
493 aa  269  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309463  n/a   
 
 
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