More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0112 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0112  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  100 
 
 
484 aa  988    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00531501  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  62.03 
 
 
481 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  61.81 
 
 
481 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  59.79 
 
 
475 aa  601  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4292  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  59.45 
 
 
479 aa  593  1e-168  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0776  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  58.79 
 
 
479 aa  591  1e-167  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0436296  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0241  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  60.55 
 
 
475 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.581458 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  56.54 
 
 
474 aa  577  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0239  deoxyribodipyrimidine photolyase  55.74 
 
 
477 aa  539  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.52668  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0213  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  56.6 
 
 
477 aa  541  9.999999999999999e-153  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.615271  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0287  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  47.9 
 
 
478 aa  463  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03091  putative DNA photolyase  47.18 
 
 
478 aa  461  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03081  putative DNA photolyase  46.97 
 
 
477 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1651  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  46.61 
 
 
493 aa  455  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309463  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03651  putative DNA photolyase  46.61 
 
 
504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305782  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03181  putative DNA photolyase  47.15 
 
 
478 aa  453  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1437  DNA photolyase FAD-binding  40 
 
 
514 aa  360  4e-98  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2879  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.75 
 
 
470 aa  348  1e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.9 
 
 
487 aa  347  4e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  43.01 
 
 
479 aa  341  2e-92  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0575  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.38 
 
 
468 aa  335  1e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2541  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.03 
 
 
466 aa  326  5e-88  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.272644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.48 
 
 
491 aa  324  2e-87  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.96 
 
 
475 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1969  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.84 
 
 
486 aa  317  3e-85  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1623  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.73 
 
 
482 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.38 
 
 
481 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0704  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.52 
 
 
497 aa  312  1e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2745  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.4 
 
 
513 aa  310  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6799  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.26 
 
 
499 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000114492  decreased coverage  0.000000135491 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3963  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.6 
 
 
511 aa  305  1.0000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000556996 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1880  DNA photolyase  39.19 
 
 
483 aa  305  1.0000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2844  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  39.05 
 
 
499 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758456  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4409  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.7 
 
 
504 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.735576 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0994  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.64 
 
 
462 aa  301  2e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2305  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.93 
 
 
467 aa  300  4e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000471562  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0288  DNA photolyase FAD-binding  36.91 
 
 
465 aa  300  4e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.155544  normal  0.119697 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  39.29 
 
 
473 aa  299  9e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.29 
 
 
472 aa  299  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2087  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.02 
 
 
434 aa  298  1e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0527605  normal  0.0533895 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0798  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.62 
 
 
472 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.56 
 
 
476 aa  297  2e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.67 
 
 
472 aa  298  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.29 
 
 
472 aa  298  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  40.04 
 
 
456 aa  298  2e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  39.88 
 
 
488 aa  296  5e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2928  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.41 
 
 
472 aa  296  7e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0755  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.41 
 
 
472 aa  296  7e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.391934  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3894  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.72 
 
 
470 aa  295  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.47 
 
 
470 aa  295  9e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0866  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.4 
 
 
473 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.07 
 
 
490 aa  295  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.58 
 
 
483 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1921  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.67 
 
 
488 aa  294  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11303  deoxyribodipyrimidine photolyase-class I  35.93 
 
 
434 aa  295  2e-78  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.45 
 
 
452 aa  293  3e-78  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0756  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.19 
 
 
473 aa  293  6e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.645703  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0241  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.44 
 
 
492 aa  293  6e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  36.8 
 
 
471 aa  292  7e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1577  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.41 
 
 
493 aa  292  8e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547552  normal  0.6563 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0831  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.19 
 
 
473 aa  292  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.31293  hitchhiker  0.0019608 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1112  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.38 
 
 
487 aa  292  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1163  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.38 
 
 
487 aa  291  1e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1958  deoxyribodipyrimidine photolyase (photoreactivating enzyme)  35.98 
 
 
433 aa  291  1e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021636 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3586  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.38 
 
 
487 aa  292  1e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0723  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.84 
 
 
472 aa  291  2e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.867142 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0769  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.19 
 
 
473 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.568717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0565  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.49 
 
 
518 aa  291  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470462  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0617  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.36 
 
 
518 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00814306  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  37.08 
 
 
471 aa  290  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0817  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.35 
 
 
473 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.6 
 
 
478 aa  289  7e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.65 
 
 
497 aa  289  9e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.85 
 
 
488 aa  288  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3694  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.79 
 
 
484 aa  288  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1376  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.03 
 
 
492 aa  286  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.41 
 
 
483 aa  286  5e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0810  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.83 
 
 
470 aa  286  5e-76  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.57 
 
 
476 aa  286  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.7 
 
 
478 aa  286  7e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4249  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.12 
 
 
442 aa  286  7e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.846588  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.72 
 
 
471 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.33 
 
 
492 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.35 
 
 
497 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.84 
 
 
463 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  39.31 
 
 
477 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0780  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.14 
 
 
475 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431367  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.08 
 
 
480 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4450  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.05 
 
 
480 aa  281  1e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.51 
 
 
493 aa  281  1e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.03 
 
 
499 aa  281  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3349  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.65 
 
 
477 aa  281  2e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355989  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6960  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.94 
 
 
434 aa  281  2e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.386716  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.7 
 
 
482 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2665  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.3 
 
 
501 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5488  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.22 
 
 
518 aa  281  2e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.62 
 
 
484 aa  281  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.3 
 
 
482 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1134  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.3 
 
 
477 aa  279  8e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172014  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0767  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.08 
 
 
475 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>