More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0239 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0239  deoxyribodipyrimidine photolyase  100 
 
 
477 aa  972    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.52668  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0213  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  82.39 
 
 
477 aa  800    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.615271  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0112  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  55.74 
 
 
484 aa  528  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00531501  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1651  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  50.81 
 
 
493 aa  526  1e-148  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309463  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03651  putative DNA photolyase  50.81 
 
 
504 aa  522  1e-147  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305782  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0287  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  50.1 
 
 
478 aa  497  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03081  putative DNA photolyase  49.17 
 
 
477 aa  495  1e-139  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03091  putative DNA photolyase  49.07 
 
 
478 aa  493  9.999999999999999e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  51.23 
 
 
475 aa  492  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4292  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  51.8 
 
 
479 aa  488  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  50.63 
 
 
474 aa  489  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  49.37 
 
 
481 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  49.58 
 
 
481 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0241  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  51.28 
 
 
475 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.581458 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03181  putative DNA photolyase  47.62 
 
 
478 aa  471  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0776  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  49.47 
 
 
479 aa  468  9.999999999999999e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0436296  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.79 
 
 
479 aa  337  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.43 
 
 
487 aa  320  5e-86  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.85 
 
 
491 aa  305  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1437  DNA photolyase FAD-binding  37.45 
 
 
514 aa  298  2e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3894  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.24 
 
 
470 aa  295  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1880  DNA photolyase  39.34 
 
 
483 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1623  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.47 
 
 
482 aa  292  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1969  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.11 
 
 
486 aa  288  2e-76  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2305  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.81 
 
 
467 aa  286  4e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000471562  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.88 
 
 
483 aa  286  4e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0798  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.26 
 
 
472 aa  285  9e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3349  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.06 
 
 
477 aa  283  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355989  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.26 
 
 
472 aa  283  4.0000000000000003e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  39.26 
 
 
473 aa  283  5.000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.26 
 
 
472 aa  283  5.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.06 
 
 
472 aa  283  6.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0756  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.76 
 
 
473 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.645703  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1166  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  39.07 
 
 
493 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2879  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.63 
 
 
470 aa  281  1e-74  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2541  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.24 
 
 
466 aa  282  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.272644 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.47 
 
 
452 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  39.33 
 
 
456 aa  281  2e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0831  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.76 
 
 
473 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.31293  hitchhiker  0.0019608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1165  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  39.47 
 
 
493 aa  281  3e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0723  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.26 
 
 
472 aa  280  4e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.867142 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.83 
 
 
471 aa  280  4e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2928  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.06 
 
 
472 aa  280  6e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0755  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.06 
 
 
472 aa  280  6e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.391934  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  39.25 
 
 
493 aa  279  7e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0866  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.56 
 
 
473 aa  279  7e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0817  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.54 
 
 
473 aa  279  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  36.68 
 
 
474 aa  278  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.44 
 
 
481 aa  278  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.49 
 
 
475 aa  278  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2844  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.58 
 
 
499 aa  278  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758456  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0769  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.56 
 
 
473 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.568717 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11303  deoxyribodipyrimidine photolyase-class I  34.48 
 
 
434 aa  277  4e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0906  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.55 
 
 
493 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207875  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3963  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.55 
 
 
511 aa  276  5e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000556996 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.49 
 
 
488 aa  276  8e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0704  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.06 
 
 
497 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  35.22 
 
 
471 aa  274  3e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6799  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.34 
 
 
499 aa  273  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000114492  decreased coverage  0.000000135491 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.51 
 
 
470 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.67 
 
 
476 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0575  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.08 
 
 
468 aa  273  4.0000000000000004e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2087  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.03 
 
 
434 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0527605  normal  0.0533895 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.54 
 
 
482 aa  272  7e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.56 
 
 
497 aa  272  1e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.25 
 
 
492 aa  271  1e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  35.01 
 
 
471 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2747  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.74 
 
 
474 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00995843  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.08 
 
 
469 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.15 
 
 
463 aa  270  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3694  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.74 
 
 
484 aa  270  5e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.4 
 
 
484 aa  268  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1577  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.37 
 
 
493 aa  268  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547552  normal  0.6563 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3211  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.74 
 
 
499 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.38 
 
 
478 aa  267  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0080  deoxyribodipyrimidine photolyase, cyclobutane pyrimidine dimer-specific  37.32 
 
 
469 aa  268  2e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000198558  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05122  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.76 
 
 
471 aa  266  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4409  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.71 
 
 
504 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.735576 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1309  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.34 
 
 
499 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2179  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.25 
 
 
481 aa  266  7e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0994  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.04 
 
 
462 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.14 
 
 
490 aa  265  1e-69  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.94 
 
 
477 aa  265  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2469  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.99 
 
 
475 aa  265  1e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3384  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.23 
 
 
512 aa  264  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.34 
 
 
500 aa  264  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3054  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.59 
 
 
505 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.746759  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.96 
 
 
477 aa  263  4e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.19 
 
 
476 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4692  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.95 
 
 
476 aa  263  6e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.17 
 
 
482 aa  263  6e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.5 
 
 
488 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1364  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.44 
 
 
473 aa  262  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0241  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  33.87 
 
 
492 aa  262  1e-68  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1921  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.42 
 
 
488 aa  262  1e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1163  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.86 
 
 
487 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1479  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.08 
 
 
478 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.56 
 
 
483 aa  261  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2745  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.64 
 
 
513 aa  261  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4450  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.58 
 
 
480 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>