291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3953 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3953  cryptochrome, DASH family  100 
 
 		 515 aa  1017    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1411  cryptochrome, DASH family  51.69 
 
 		 447 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0729  cryptochrome, DASH family  36.55 
 
 		 488 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264496  normal  0.107921 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0700  cryptochrome, DASH family  36.14 
 
 		 488 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0343  cryptochrome, DASH family  37.14 
 
 		 488 aa  307  3e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4538  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  36.46 
 
 		 498 aa  305  1.0000000000000001e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1053  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.05 
 
 		 434 aa  296  6e-79  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6186  cryptochrome, DASH family  38.67 
 
 		 487 aa  288  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06693  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.02 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0320  DNA photolyase FAD-binding subunit  37.92 
 
 		 440 aa  256  9e-67  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2235  cryptochrome, DASH family  36.61 
 
 		 483 aa  251  2e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.14399  normal  0.570848 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1548  DNA photolyase FAD-binding subunit  32.72 
 
 		 448 aa  248  3e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444099  normal  0.384798 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2595  cryptochrome, DASH family  36.31 
 
 		 478 aa  238  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0775599  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1410  RNA-binding cryptochrome Cry1  51.13 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29275  predicted protein  34.46 
 
 		 551 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07806  probable bacterial cryptochrome  30.85 
 
 		 421 aa  228  2e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0336  cryptochrome DASH  49.77 
 
 		 441 aa  223  6e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000796  deoxyribodipyrimidine photolyase single-strand-specific  46.4 
 
 		 444 aa  223  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0152  deoxyribodipyrimidine photolyase  50 
 
 		 445 aa  221  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3718  cryptochrome, DASH family  28.99 
 
 		 430 aa  183  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4337  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.96 
 
 		 396 aa  172  9e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34592  cry-dash from the cryptochrome/photolyase family  42.31 
 
 		 610 aa  164  4.0000000000000004e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.92 
 
 		 481 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.95 
 
 		 481 aa  159  8e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0239  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.81 
 
 		 477 aa  159  9e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.52668  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.3 
 
 		 454 aa  159  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.71 
 
 		 452 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1651  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.25 
 
 		 493 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.309463  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.87 
 
 		 478 aa  155  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.28 
 
 		 475 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03651  putative DNA photolyase  28.63 
 
 		 504 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.305782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.59 
 
 		 475 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.71 
 
 		 474 aa  151  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5903  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.45 
 
 		 436 aa  150  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.696635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4292  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.06 
 
 		 479 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0112  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.89 
 
 		 484 aa  149  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00531501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0994  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.05 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0241  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.76 
 
 		 475 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.581458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2665  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.9 
 
 		 501 aa  148  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  28.24 
 
 		 471 aa  147  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0213  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.11 
 
 		 477 aa  146  1e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.615271  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  28.03 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05122  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.82 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0723  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.34 
 
 		 472 aa  144  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.867142 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0439  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.02 
 
 		 435 aa  144  4e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2021  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.42 
 
 		 445 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.128536 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.42 
 
 		 445 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2084  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.42 
 
 		 445 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1145  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.84 
 
 		 476 aa  142  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.81 
 
 		 486 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2364  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.54 
 
 		 487 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0798  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.53 
 
 		 472 aa  141  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.79 
 
 		 434 aa  141  3e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  29.44 
 
 		 473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  29.44 
 
 		 456 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.44 
 
 		 472 aa  140  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.44 
 
 		 472 aa  140  6e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1880  DNA photolyase  29.68 
 
 		 483 aa  139  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3098  deoxyribodipyrimidine photolyase  33.75 
 
 		 487 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.383524  normal  0.0341678 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  31.03 
 
 		 472 aa  139  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0776  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.13 
 
 		 479 aa  138  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0436296  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3384  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.75 
 
 		 512 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1262  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.46 
 
 		 463 aa  137  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.25 
 
 		 471 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0287  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.52 
 
 		 478 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.39 
 
 		 493 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  29.44 
 
 		 492 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2143  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.83 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.92 
 
 		 472 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  30.5 
 
 		 481 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03081  putative DNA photolyase  23.84 
 
 		 477 aa  134  3e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2747  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.08 
 
 		 474 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00995843  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1302  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.44 
 
 		 456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.674491  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1165  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  27.92 
 
 		 493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1166  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.6 
 
 		 493 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4704  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.12 
 
 		 459 aa  134  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.940834 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2469  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.36 
 
 		 475 aa  133  7.999999999999999e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205711 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0998  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.85 
 
 		 453 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0430  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  26.95 
 
 		 541 aa  132  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.12 
 
 		 493 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03091  putative DNA photolyase  22.41 
 
 		 478 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.94 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3589  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.26 
 
 		 483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0465  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.13 
 
 		 541 aa  132  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3963  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.26 
 
 		 511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000556996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.11 
 
 		 470 aa  131  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.46 
 
 		 484 aa  131  3e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  24.9 
 
 		 476 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3894  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.63 
 
 		 470 aa  131  4.0000000000000003e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00387  DNA photolyase (Eurofung)  36.32 
 
 		 567 aa  130  5.0000000000000004e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.892479  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.9 
 
 		 476 aa  130  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1577  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.58 
 
 		 493 aa  130  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547552  normal  0.6563 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1989  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.81 
 
 		 468 aa  130  6e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.382914  normal  0.885594 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0814  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.67 
 
 		 490 aa  130  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  24.9 
 
 		 476 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2677  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.03 
 
 		 486 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2734  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.03 
 
 		 486 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.913993  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3180  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  25.1 
 
 		 469 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.42 
 
 		 477 aa  128  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2800  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.03 
 
 		 486 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>