272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1981 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1981  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  100 
 
 		 454 aa  860    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0691  DNA photolyase domain-containing protein  95.37 
 
 		 454 aa  760    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3080  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  67.1 
 
 		 455 aa  499  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.153672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1873  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  43.36 
 
 		 517 aa  266  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543845 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1225  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.81 
 
 		 514 aa  263  4e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.474608  normal  0.333965 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03991  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  25.54 
 
 		 503 aa  192  9e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1651  deoxyribodipyrimidine photolyase  31.13 
 
 		 496 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0708  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  31.99 
 
 		 493 aa  184  3e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03931  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  25.05 
 
 		 498 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3105  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.58 
 
 		 505 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03921  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  24.57 
 
 		 498 aa  176  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.322027  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0151  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.09 
 
 		 495 aa  160  3e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617218  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1306  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.38 
 
 		 507 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1248  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.62 
 
 		 493 aa  154  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00593835 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1549  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.08 
 
 		 517 aa  146  6e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701631  normal  0.426947 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0779  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.67 
 
 		 504 aa  145  2e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001126  deoxyribodipyrimidine photolyase/cryptochrome family protein  26.18 
 
 		 493 aa  144  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00185581  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06659  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.4 
 
 		 493 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0600  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.84 
 
 		 561 aa  135  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3951  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.63 
 
 		 526 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0343  cryptochrome, DASH family  25.3 
 
 		 488 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1004  cryptochrome Cry2  27.17 
 
 		 504 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1163  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.61 
 
 		 487 aa  123  7e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3586  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.61 
 
 		 487 aa  123  7e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1112  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.4 
 
 		 487 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196695  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_1947  cyclobutane pyrimidine dimer 1  25.54 
 
 		 515 aa  120  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000588882  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6186  cryptochrome, DASH family  27.79 
 
 		 487 aa  120  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2595  cryptochrome, DASH family  29.34 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0775599  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.23 
 
 		 463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0700  cryptochrome, DASH family  23.51 
 
 		 488 aa  117  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4538  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  23.51 
 
 		 498 aa  116  8.999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  30.86 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0723  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.04 
 
 		 472 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.867142 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  26.42 
 
 		 473 aa  111  3e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0729  cryptochrome, DASH family  22.91 
 
 		 488 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264496  normal  0.107921 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.42 
 
 		 472 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.22 
 
 		 472 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.54 
 
 		 497 aa  110  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.32 
 
 		 483 aa  109  8.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.42 
 
 		 472 aa  108  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.9 
 
 		 476 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2928  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.01 
 
 		 472 aa  108  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0755  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.01 
 
 		 472 aa  108  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.391934  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.09 
 
 		 470 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.78 
 
 		 452 aa  107  6e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0811  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.98 
 
 		 475 aa  107  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  25.74 
 
 		 456 aa  106  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0831  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.19 
 
 		 473 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.31293  hitchhiker  0.0019608 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.66 
 
 		 477 aa  106  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  25 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0866  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.47 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0769  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.59 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.568717 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1262  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.97 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103305  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.62 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0817  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.19 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  25.27 
 
 		 474 aa  104  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0814  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.54 
 
 		 490 aa  103  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2343  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.61 
 
 		 389 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1615  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.79 
 
 		 471 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0756  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.6 
 
 		 473 aa  103  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.645703  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0915  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.2 
 
 		 477 aa  103  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.35 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0798  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.39 
 
 		 472 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.48 
 
 		 475 aa  101  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  24.43 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05122  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.26 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  23.03 
 
 		 476 aa  101  3e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  23.37 
 
 		 476 aa  101  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.53 
 
 		 482 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.94 
 
 		 491 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.16 
 
 		 481 aa  99.8  9e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0940349 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1613  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.76 
 
 		 425 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.51 
 
 		 477 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.52 
 
 		 471 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.83 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.53 
 
 		 487 aa  99  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.66 
 
 		 478 aa  98.2  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0276  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.82 
 
 		 431 aa  97.8  4e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02013  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  29.06 
 
 		 478 aa  97.8  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000664179  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1134  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.39 
 
 		 477 aa  97.8  4e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172014  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.86 
 
 		 493 aa  97.4  5e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1152  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.05 
 
 		 470 aa  96.3  9e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0172656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0906  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.97 
 
 		 493 aa  96.3  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207875  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1122  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.75 
 
 		 457 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000025981 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.4 
 
 		 500 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.69 
 
 		 497 aa  95.1  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.77 
 
 		 481 aa  95.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0810  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  23.48 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2777  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.16 
 
 		 469 aa  95.1  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0704  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.21 
 
 		 497 aa  95.5  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.93 
 
 		 480 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0994  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  22.8 
 
 		 462 aa  94.7  3e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0439  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.35 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3369  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.28 
 
 		 526 aa  94.4  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.149993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.95 
 
 		 477 aa  94  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3211  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.9 
 
 		 499 aa  93.6  7e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3193  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  23.22 
 
 		 476 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.27 
 
 		 476 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1479  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.57 
 
 		 478 aa  92.4  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0767  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.52 
 
 		 475 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>