More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1122 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_1122  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  100 
 
 
457 aa  895    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000025981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10630  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  63.68 
 
 
450 aa  548  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  58.5 
 
 
454 aa  486  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4704  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  55.12 
 
 
459 aa  449  1e-125  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.940834 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3554  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  56.49 
 
 
450 aa  437  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00327054  normal  0.728656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4086  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  54.05 
 
 
449 aa  409  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.703366  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0529  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  52.75 
 
 
421 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0312273  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  52.37 
 
 
445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2084  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  52.37 
 
 
445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.963187  normal  0.606959 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2021  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  52.37 
 
 
445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.128536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1272  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  51.43 
 
 
434 aa  392  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3030  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  51.3 
 
 
451 aa  394  1e-108  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.334621  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0778  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  55.65 
 
 
453 aa  386  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2257  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  51.75 
 
 
442 aa  381  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7233  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  48.48 
 
 
409 aa  333  3e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172483  normal  0.496846 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1302  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.9 
 
 
456 aa  320  1.9999999999999998e-86  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.674491  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.13 
 
 
487 aa  311  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0151  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  48.42 
 
 
497 aa  306  7e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0953516  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.31 
 
 
491 aa  297  3e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1623  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.95 
 
 
482 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.01 
 
 
479 aa  286  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4658  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.95 
 
 
476 aa  284  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0553081  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1615  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  43.7 
 
 
471 aa  282  9e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0575  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.04 
 
 
468 aa  281  2e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0817  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.58 
 
 
473 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.87 
 
 
483 aa  280  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.62 
 
 
452 aa  279  8e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0831  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.38 
 
 
473 aa  279  9e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.31293  hitchhiker  0.0019608 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.18 
 
 
471 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04795  photolyase  41.46 
 
 
472 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722935  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0756  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.17 
 
 
473 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.645703  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0866  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.17 
 
 
473 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2364  deoxyribodipyrimidine photolyase  42.71 
 
 
487 aa  276  4e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.513248 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0769  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.17 
 
 
473 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.568717 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.03 
 
 
469 aa  275  9e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2747  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  40.79 
 
 
474 aa  275  9e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00995843  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2541  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.61 
 
 
466 aa  275  1.0000000000000001e-72  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.272644 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2665  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.53 
 
 
501 aa  273  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.8 
 
 
486 aa  274  3e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2879  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.13 
 
 
470 aa  274  3e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  35.43 
 
 
471 aa  273  5.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  35.43 
 
 
471 aa  272  7e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4932  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  40.66 
 
 
481 aa  271  1e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  40.5 
 
 
478 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3356  deoxyribodipyrimidine photolyase  42.22 
 
 
483 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617341  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4676  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.35 
 
 
500 aa  271  2e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.499221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  32.98 
 
 
476 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3098  deoxyribodipyrimidine photolyase  41.51 
 
 
487 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.383524  normal  0.0341678 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2919  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.25 
 
 
478 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.219923 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0080  deoxyribodipyrimidine photolyase, cyclobutane pyrimidine dimer-specific  37.1 
 
 
469 aa  270  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000198558  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.41 
 
 
463 aa  270  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  32.28 
 
 
476 aa  270  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3180  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  32.98 
 
 
469 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  34.17 
 
 
474 aa  269  5.9999999999999995e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.04 
 
 
475 aa  269  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  32.91 
 
 
476 aa  269  8e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  33.19 
 
 
476 aa  269  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4692  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  43.7 
 
 
476 aa  269  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3193  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  32.55 
 
 
476 aa  269  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.92 
 
 
475 aa  268  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0703  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.78 
 
 
525 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.79 
 
 
472 aa  268  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  37.79 
 
 
473 aa  267  2e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.79 
 
 
472 aa  267  2e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.41 
 
 
477 aa  267  2e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  32.7 
 
 
476 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3894  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.66 
 
 
470 aa  266  4e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.58 
 
 
472 aa  266  5e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.47 
 
 
481 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.62 
 
 
481 aa  266  7e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1969  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.55 
 
 
486 aa  266  7e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1577  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.43 
 
 
493 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.547552  normal  0.6563 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.55 
 
 
477 aa  265  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  38.03 
 
 
456 aa  265  1e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  32.42 
 
 
476 aa  265  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.14 
 
 
488 aa  264  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2469  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.2 
 
 
475 aa  264  3e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205711 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1921  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.51 
 
 
488 aa  263  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2928  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.83 
 
 
472 aa  263  6e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0755  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.83 
 
 
472 aa  263  6e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.391934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0798  deoxyribodipyrimidine photolyase  36.49 
 
 
472 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0704  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.13 
 
 
497 aa  261  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0998  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.76 
 
 
453 aa  262  1e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0112  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.37 
 
 
484 aa  261  2e-68  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00531501  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.89 
 
 
481 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0729  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.11 
 
 
483 aa  260  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1364  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.16 
 
 
473 aa  260  3e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3586  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.19 
 
 
487 aa  260  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0906  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.98 
 
 
493 aa  260  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207875  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1145  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.42 
 
 
476 aa  259  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.15 
 
 
470 aa  259  7e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5488  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  41.29 
 
 
518 aa  259  8e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1163  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.97 
 
 
487 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.37 
 
 
476 aa  258  1e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05122  deoxyribodipyrimidine photolyase  34.88 
 
 
471 aa  259  1e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4409  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.2 
 
 
504 aa  258  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.735576 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3589  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.08 
 
 
483 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6799  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.73 
 
 
499 aa  258  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000114492  decreased coverage  0.000000135491 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1112  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.97 
 
 
487 aa  258  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196695  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2178  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.96 
 
 
519 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>