More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1134 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1163  deoxyribodipyrimidine photolyase  68.57 
 
 		 487 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3586  deoxyribodipyrimidine photolyase  68.78 
 
 		 487 aa  665    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1134  deoxyribodipyrimidine photolyase  100 
 
 		 477 aa  983    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172014  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  69.77 
 
 		 476 aa  674    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1112  deoxyribodipyrimidine photolyase  68.78 
 
 		 487 aa  665    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196695  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  75.42 
 
 		 476 aa  740    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  70.89 
 
 		 497 aa  697    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  68.7 
 
 		 492 aa  686    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  62.24 
 
 		 470 aa  587  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2928  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  60.63 
 
 		 472 aa  578  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0755  deoxyribodipyrimidine photolyase  60.63 
 
 		 472 aa  578  1e-164  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.391934  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0798  deoxyribodipyrimidine photolyase  60.21 
 
 		 472 aa  575  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0769  deoxyribodipyrimidine photolyase  60.17 
 
 		 473 aa  571  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.568717 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  60.17 
 
 		 472 aa  572  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0866  deoxyribodipyrimidine photolyase  60.38 
 
 		 473 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0831  deoxyribodipyrimidine photolyase  60.46 
 
 		 473 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.31293  hitchhiker  0.0019608 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0817  deoxyribodipyrimidine photolyase  60.59 
 
 		 473 aa  572  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  59.96 
 
 		 473 aa  570  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  59.96 
 
 		 472 aa  570  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  59.75 
 
 		 472 aa  570  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0756  deoxyribodipyrimidine photolyase  60.04 
 
 		 473 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.645703  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0723  deoxyribodipyrimidine photolyase  59.54 
 
 		 472 aa  566  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.867142 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  59.87 
 
 		 456 aa  551  1e-156  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0080  deoxyribodipyrimidine photolyase, cyclobutane pyrimidine dimer-specific  51.05 
 
 		 469 aa  444  1e-123  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000198558  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  47.67 
 
 		 482 aa  432  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  50.96 
 
 		 477 aa  422  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  46.71 
 
 		 482 aa  421  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  47.87 
 
 		 477 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  48.31 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0940349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4450  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  46.2 
 
 		 480 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  46.32 
 
 		 471 aa  412  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0811  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  48.96 
 
 		 475 aa  411  1e-113  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05122  deoxyribodipyrimidine photolyase  47.06 
 
 		 471 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0998  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.32 
 
 		 453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.53 
 
 		 480 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  45.32 
 
 		 488 aa  403  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0767  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.53 
 
 		 475 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1309  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.23 
 
 		 499 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1166  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  46.82 
 
 		 493 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3054  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.34 
 
 		 505 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.746759  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.53 
 
 		 500 aa  395  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.85 
 
 		 477 aa  395  1e-109  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  45.51 
 
 		 497 aa  394  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3211  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.61 
 
 		 499 aa  392  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0866  deoxyribodipyrimidine photo-lyase (photoreactivating enzyme)  44.21 
 
 		 479 aa  392  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0465  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  48.09 
 
 		 473 aa  394  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1165  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  46.19 
 
 		 493 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  46.19 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3384  deoxyribodipyrimidine photolyase  43.2 
 
 		 512 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0780  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.8 
 
 		 475 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2777  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.41 
 
 		 469 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1152  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.21 
 
 		 470 aa  387  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0172656  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  46.17 
 
 		 468 aa  386  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.62 
 
 		 493 aa  388  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1479  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  43.84 
 
 		 478 aa  384  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.78 
 
 		 463 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1380  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.76 
 
 		 470 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866986  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0465  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.03 
 
 		 541 aa  354  2e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  43.36 
 
 		 479 aa  352  1e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2179  deoxyribodipyrimidine photolyase  39.62 
 
 		 481 aa  352  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0430  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.57 
 
 		 541 aa  348  1e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00387  DNA photolyase (Eurofung)  40.49 
 
 		 567 aa  338  9e-92  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.892479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40 
 
 		 487 aa  311  1e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.63 
 
 		 483 aa  307  3e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1623  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.6 
 
 		 482 aa  300  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.528738 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.21 
 
 		 481 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2879  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.75 
 
 		 470 aa  299  6e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.57 
 
 		 481 aa  299  8e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1444  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.91 
 
 		 483 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.750444 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0241  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.77 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.581458 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.64 
 
 		 481 aa  296  6e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3694  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.45 
 
 		 484 aa  296  7e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0575  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.73 
 
 		 468 aa  295  1e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  35.83 
 
 		 476 aa  294  2e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6799  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.44 
 
 		 499 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000114492  decreased coverage  0.000000135491 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3894  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  39.59 
 
 		 470 aa  292  8e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1969  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.08 
 
 		 486 aa  292  8e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  35.69 
 
 		 476 aa  292  9e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0810  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.96 
 
 		 470 aa  291  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.5 
 
 		 475 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.72 
 
 		 491 aa  290  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  39.31 
 
 		 499 aa  290  4e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.675954 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  38.48 
 
 		 471 aa  289  7e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0377  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.59 
 
 		 486 aa  288  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.215425 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  38.48 
 
 		 471 aa  288  2e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2844  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  40.68 
 
 		 499 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.81 
 
 		 454 aa  288  2e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  39.88 
 
 		 478 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0213  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  40.38 
 
 		 477 aa  287  4e-76  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.615271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.66 
 
 		 475 aa  286  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5488  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  40.25 
 
 		 518 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.21 
 
 		 469 aa  286  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  35.52 
 
 		 476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  35.32 
 
 		 476 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  40.29 
 
 		 488 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2469  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.97 
 
 		 475 aa  285  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000205711 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  34.98 
 
 		 490 aa  284  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3187  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  35.32 
 
 		 476 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3180  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  35.33 
 
 		 469 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.478094  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2935  deoxyribodipyrimidine photolyase  35.32 
 
 		 476 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>