More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1224 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3586  deoxyribodipyrimidine photolyase  69.4 
 
 
487 aa  708    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  71.55 
 
 
476 aa  694    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  71.13 
 
 
476 aa  703    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1163  deoxyribodipyrimidine photolyase  69.4 
 
 
487 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1112  deoxyribodipyrimidine photolyase  69.2 
 
 
487 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196695  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  100 
 
 
497 aa  1040    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1134  deoxyribodipyrimidine photolyase  70.89 
 
 
477 aa  689    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172014  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3112  deoxyribodipyrimidine photolyase  89.74 
 
 
492 aa  935    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.671492  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0798  deoxyribodipyrimidine photolyase  62 
 
 
472 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  62.29 
 
 
470 aa  604  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0723  deoxyribodipyrimidine photolyase  62.42 
 
 
472 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.867142 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2928  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  62.21 
 
 
472 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0755  deoxyribodipyrimidine photolyase  62.21 
 
 
472 aa  604  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.391934  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  61.57 
 
 
473 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  61.57 
 
 
472 aa  598  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  61.57 
 
 
472 aa  598  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  61.36 
 
 
472 aa  597  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0756  deoxyribodipyrimidine photolyase  61.65 
 
 
473 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.645703  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0866  deoxyribodipyrimidine photolyase  61.65 
 
 
473 aa  595  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.55052 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0831  deoxyribodipyrimidine photolyase  61.44 
 
 
473 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.31293  hitchhiker  0.0019608 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0769  deoxyribodipyrimidine photolyase  61.44 
 
 
473 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.568717 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0817  deoxyribodipyrimidine photolyase  61.23 
 
 
473 aa  588  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  61.84 
 
 
456 aa  584  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  48.64 
 
 
477 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  47.36 
 
 
482 aa  428  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  47.25 
 
 
482 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  46.99 
 
 
471 aa  427  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4450  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  46.43 
 
 
480 aa  425  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05122  deoxyribodipyrimidine photolyase  46.04 
 
 
471 aa  422  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0080  deoxyribodipyrimidine photolyase, cyclobutane pyrimidine dimer-specific  48.63 
 
 
469 aa  425  1e-117  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000198558  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0811  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  47.29 
 
 
475 aa  424  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  46.97 
 
 
463 aa  422  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  47.57 
 
 
477 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0465  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  46.96 
 
 
473 aa  419  1e-116  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  47.05 
 
 
481 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0940349 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1479  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  46.88 
 
 
478 aa  421  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0739  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.45 
 
 
480 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0767  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  46.2 
 
 
475 aa  418  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4736  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  45.67 
 
 
488 aa  413  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.303761 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0998  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  46.27 
 
 
453 aa  409  1e-113  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0780  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.38 
 
 
475 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.431367  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1236  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  46.32 
 
 
493 aa  402  1e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2714  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.76 
 
 
493 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1165  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  46.53 
 
 
493 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1166  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  47.05 
 
 
493 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1309  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.98 
 
 
499 aa  398  1e-109  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  45.62 
 
 
468 aa  394  1e-108  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3068  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  45.09 
 
 
500 aa  394  1e-108  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3054  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.51 
 
 
505 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.746759  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3211  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.56 
 
 
499 aa  395  1e-108  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3384  deoxyribodipyrimidine photolyase  42.32 
 
 
512 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  43.6 
 
 
497 aa  389  1e-107  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  44.35 
 
 
477 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2777  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.79 
 
 
469 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0866  deoxyribodipyrimidine photo-lyase (photoreactivating enzyme)  43.3 
 
 
479 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1152  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  42.77 
 
 
470 aa  376  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0172656  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1380  deoxyribodipyrimidine photolyase  41.35 
 
 
470 aa  374  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866986  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0465  deoxyribodipyrimidine photolyase  38.59 
 
 
541 aa  360  2e-98  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2179  deoxyribodipyrimidine photolyase  40.92 
 
 
481 aa  355  1e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0430  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.12 
 
 
541 aa  354  2e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.71 
 
 
479 aa  331  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.040956 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00387  DNA photolyase (Eurofung)  36.8 
 
 
567 aa  320  3.9999999999999996e-86  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.892479  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  41.88 
 
 
469 aa  313  4.999999999999999e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3694  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.45 
 
 
484 aa  310  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3894  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  40.46 
 
 
470 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.08 
 
 
487 aa  300  3e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0810  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.55 
 
 
470 aa  300  6e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0575  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.99 
 
 
468 aa  297  4e-79  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1467  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.68 
 
 
481 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1441  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.4 
 
 
481 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0241  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.76 
 
 
475 aa  294  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.581458 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0074  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.48 
 
 
475 aa  295  2e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6799  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.92 
 
 
499 aa  293  6e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000114492  decreased coverage  0.000000135491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0906  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.04 
 
 
493 aa  291  2e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207875  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2745  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.62 
 
 
513 aa  290  4e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.14 
 
 
481 aa  288  1e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2844  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  40.52 
 
 
499 aa  288  2e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0758456  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0241  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.4 
 
 
492 aa  286  5.999999999999999e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2879  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.05 
 
 
470 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.26 
 
 
483 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1921  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.56 
 
 
488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_1801  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.35 
 
 
488 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1623  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.04 
 
 
482 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.528738 
 
 
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NC_009972  Haur_1969  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  38.76 
 
 
486 aa  283  5.000000000000001e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009667  Oant_0339  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.13 
 
 
484 aa  283  6.000000000000001e-75  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_4409  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.92 
 
 
504 aa  282  9e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.421142  normal  0.735576 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  35.5 
 
 
490 aa  282  9e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_007604  Synpcc7942_0112  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.35 
 
 
484 aa  281  1e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00531501  normal 
 
 
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NC_007347  Reut_A0703  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.8 
 
 
525 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_3446  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  37.77 
 
 
491 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.998107  normal  0.118354 
 
 
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NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  37.95 
 
 
452 aa  281  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_3963  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  39.19 
 
 
511 aa  281  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000556996 
 
 
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NC_008825  Mpe_A0704  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.2 
 
 
497 aa  280  3e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  36.57 
 
 
471 aa  280  4e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008340  Mlg_2256  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  38.64 
 
 
479 aa  280  6e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.786952  normal 
 
 
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NC_008312  Tery_1113  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.33 
 
 
474 aa  279  8e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.289495  normal  0.288843 
 
 
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NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  36.16 
 
 
471 aa  279  1e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_1491  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  37.22 
 
 
499 aa  279  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.675954 
 
 
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NC_007413  Ava_4292  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  35.31 
 
 
479 aa  278  2e-73  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008781  Pnap_3349  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.53 
 
 
477 aa  278  2e-73  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.355989  normal 
 
 
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