273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0691 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1981  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  95.37 
 
 		 454 aa  761    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0691  DNA photolyase domain-containing protein  100 
 
 		 454 aa  858    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3080  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  68.91 
 
 		 455 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.153672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1225  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  40.96 
 
 		 514 aa  270  4e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.474608  normal  0.333965 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1873  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  43.17 
 
 		 517 aa  266  7e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0543845 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03991  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  25.54 
 
 		 503 aa  193  7e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1651  deoxyribodipyrimidine photolyase  30.91 
 
 		 496 aa  189  8e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0708  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  32.21 
 
 		 493 aa  187  3e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03931  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  25.48 
 
 		 498 aa  179  7e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3105  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.62 
 
 		 505 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03921  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  25 
 
 		 498 aa  176  7e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.322027  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1248  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  32.69 
 
 		 493 aa  155  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00593835 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1306  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.61 
 
 		 507 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0151  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.56 
 
 		 495 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617218  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1549  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.15 
 
 		 517 aa  140  3.9999999999999997e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.701631  normal  0.426947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0600  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.68 
 
 		 561 aa  138  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001126  deoxyribodipyrimidine photolyase/cryptochrome family protein  25.27 
 
 		 493 aa  134  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00185581  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0779  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.92 
 
 		 504 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0343  cryptochrome, DASH family  26.22 
 
 		 488 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3951  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.27 
 
 		 526 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06659  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.83 
 
 		 493 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0700  cryptochrome, DASH family  24.39 
 
 		 488 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4538  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  23.9 
 
 		 498 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_1947  cyclobutane pyrimidine dimer 1  26.1 
 
 		 515 aa  124  4e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000588882  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0729  cryptochrome, DASH family  23.98 
 
 		 488 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.264496  normal  0.107921 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1004  cryptochrome Cry2  26.93 
 
 		 504 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3586  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.2 
 
 		 487 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1112  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.55 
 
 		 487 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.196695  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1163  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.2 
 
 		 487 aa  116  8.999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2595  cryptochrome, DASH family  28.22 
 
 		 478 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0775599  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0814  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.96 
 
 		 490 aa  113  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0723  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.78 
 
 		 472 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.121356  normal  0.867142 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41430  Deoxyribodipyrimidine photolyase  29.92 
 
 		 468 aa  111  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0915  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.83 
 
 		 477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2357  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.77 
 
 		 463 aa  111  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6186  cryptochrome, DASH family  26.35 
 
 		 487 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4658  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  30.98 
 
 		 476 aa  109  8.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0553081  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2343  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  36.16 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2838  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.93 
 
 		 497 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.182548  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1394  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.32 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0271  hypothetical protein  25.21 
 
 		 471 aa  107  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0513  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.89 
 
 		 475 aa  107  5e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.237418 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2924  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.65 
 
 		 476 aa  107  6e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00668  deoxyribodipyrimidine photolyase, FAD-binding  27.57 
 
 		 473 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0266  hypothetical protein  25.42 
 
 		 471 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2947  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.57 
 
 		 472 aa  106  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.139043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1252  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.54 
 
 		 476 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0460072  normal  0.903658 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02016  DNA photolyase  25.27 
 
 		 474 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0782959  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0625  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.37 
 
 		 472 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0733  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.57 
 
 		 472 aa  103  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1615  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.79 
 
 		 471 aa  103  7e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1262  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.3 
 
 		 463 aa  103  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.103305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1071  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.02 
 
 		 477 aa  103  9e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1212  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.63 
 
 		 470 aa  102  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.0350184 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2928  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26.75 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0755  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.75 
 
 		 472 aa  101  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.391934  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00657  hypothetical protein  26.92 
 
 		 456 aa  100  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2903  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.58 
 
 		 478 aa  101  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.599485  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0811  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.68 
 
 		 475 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1122  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  31.26 
 
 		 457 aa  100  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000025981 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1268a  deoxyribodipyrimidine photolyase  23.27 
 
 		 452 aa  100  6e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.432586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2075  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  23.37 
 
 		 476 aa  100  6e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0906  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  29.96 
 
 		 493 aa  100  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207875  normal  0.966672 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1613  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.61 
 
 		 425 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3165  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.81 
 
 		 476 aa  100  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1134  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.8 
 
 		 477 aa  100  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.172014  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0961  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.31 
 
 		 482 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0798  deoxyribodipyrimidine photolyase  26.54 
 
 		 472 aa  97.8  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.825453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0439  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  24.73 
 
 		 435 aa  97.8  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05122  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.21 
 
 		 471 aa  98.2  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1121  deoxyribodipyrimidine photolyase  25.67 
 
 		 482 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0870  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.02 
 
 		 479 aa  97.8  4e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.040956 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3894  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.31 
 
 		 470 aa  97.1  6e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4411  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.18 
 
 		 487 aa  97.1  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00088119  normal  0.0752784 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0276  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.82 
 
 		 431 aa  97.1  7e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1215  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  26 
 
 		 477 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.300983  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0241  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.69 
 
 		 492 aa  95.9  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.76233  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0565  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.69 
 
 		 518 aa  95.9  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.470462  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2777  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.9 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0849  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.68 
 
 		 454 aa  95.5  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.201808  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1152  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.37 
 
 		 470 aa  95.1  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0172656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10630  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.86 
 
 		 450 aa  94.7  3e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61640  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.76 
 
 		 481 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0940349 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1224  deoxyribodipyrimidine photolyase  27.25 
 
 		 497 aa  94.4  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0591  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  25.57 
 
 		 481 aa  94.4  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.2693 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0704  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  28.21 
 
 		 497 aa  94.4  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0263  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  23.71 
 
 		 490 aa  94  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02013  deoxyribodipyrimidine photolyase, putative  29.18 
 
 		 478 aa  94  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000664179  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5309  deoxyribodipyrimidine photolyase  28.51 
 
 		 477 aa  94  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3193  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  23.43 
 
 		 476 aa  93.6  6e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3369  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  27.68 
 
 		 526 aa  93.6  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.149993  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2956  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.39 
 
 		 476 aa  93.2  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.13805  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0820  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  29.14 
 
 		 469 aa  93.2  9e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.627339 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001252  deoxyribodipyrimidine photolyase  24.09 
 
 		 471 aa  93.2  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.553687  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0729  deoxyribodipyrimidine photo-lyase type I  23.87 
 
 		 483 aa  92.8  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3694  Deoxyribodipyrimidine photo-lyase  28.77 
 
 		 484 aa  92.4  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3038  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  25.77 
 
 		 477 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3184  deoxyribodipyrimidine photolyase family protein  22.74 
 
 		 476 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.262936  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1479  deoxyribodipyrimidine photo-lyase  24.54 
 
 		 478 aa  92  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0320  DNA photolyase FAD-binding subunit  26.88 
 
 		 440 aa  92  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>