More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0546 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0546  hypothetical protein  100 
 
 		 661 aa  1326    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  41.22 
 
 		 419 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  50.66 
 
 		 461 aa  147  7.0000000000000006e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  39.18 
 
 		 421 aa  145  2e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1010  hypothetical protein  50.36 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819939  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  37.13 
 
 		 421 aa  137  8e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  39.18 
 
 		 412 aa  136  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  34.69 
 
 		 402 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  30.79 
 
 		 402 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  33.73 
 
 		 454 aa  118  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  30.67 
 
 		 403 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  32.81 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  33.07 
 
 		 403 aa  116  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  31.4 
 
 		 418 aa  110  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2532  flagellar hook protein FlgE  32.55 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  41.3 
 
 		 417 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.58 
 
 		 636 aa  109  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  38.82 
 
 		 475 aa  108  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  45.07 
 
 		 422 aa  107  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  32.94 
 
 		 432 aa  107  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  29.94 
 
 		 411 aa  106  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  30.2 
 
 		 564 aa  107  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.85 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.27 
 
 		 562 aa  105  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.85 
 
 		 428 aa  105  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.07 
 
 		 488 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  42.86 
 
 		 519 aa  104  4e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  33.2 
 
 		 433 aa  104  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.3 
 
 		 513 aa  103  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  45.38 
 
 		 426 aa  102  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  45.74 
 
 		 396 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.22 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  32.98 
 
 		 394 aa  102  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  33.53 
 
 		 446 aa  102  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  32 
 
 		 430 aa  101  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  38.85 
 
 		 496 aa  101  4e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  39.57 
 
 		 623 aa  100  7e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  36.6 
 
 		 433 aa  100  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  40.58 
 
 		 422 aa  100  7e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  31.05 
 
 		 430 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.44 
 
 		 545 aa  100  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  40.41 
 
 		 434 aa  100  8e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  39.57 
 
 		 750 aa  100  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  30.61 
 
 		 414 aa  100  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  38.36 
 
 		 851 aa  99.4  2e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  33.61 
 
 		 407 aa  99.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  29.7 
 
 		 441 aa  99.8  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  39.29 
 
 		 819 aa  99.4  2e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  38.13 
 
 		 428 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1111  flagellar hook protein FlgE  44.44 
 
 		 411 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397372  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  44.25 
 
 		 440 aa  98.6  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.17 
 
 		 508 aa  98.2  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0108  hypothetical protein  40.8 
 
 		 702 aa  97.8  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00280188  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  35.25 
 
 		 398 aa  97.4  7e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  31.94 
 
 		 463 aa  97.4  8e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2736  hypothetical protein  35.53 
 
 		 474 aa  97.1  9e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  38.97 
 
 		 420 aa  97.1  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  37.86 
 
 		 814 aa  96.7  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  38.36 
 
 		 452 aa  96.3  2e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  37.41 
 
 		 442 aa  96.3  2e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2011  flagellar basal body rod protein FlgG  44.25 
 
 		 265 aa  95.9  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.01 
 
 		 415 aa  96.3  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  31.1 
 
 		 407 aa  95.5  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  33.33 
 
 		 425 aa  94.7  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  38.55 
 
 		 718 aa  95.1  4e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  29.12 
 
 		 419 aa  94.7  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  38.4 
 
 		 419 aa  94.7  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  42.4 
 
 		 479 aa  94.7  5e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  35.97 
 
 		 705 aa  94.7  5e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1303  putative flagellar hook protein  36.42 
 
 		 465 aa  94.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2963  hypothetical protein  36.42 
 
 		 465 aa  94.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1711  flagellar hook protein FlgE  38.71 
 
 		 527 aa  94.4  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.185044  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  36.3 
 
 		 911 aa  94  8e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.59 
 
 		 808 aa  94  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  35.51 
 
 		 405 aa  93.6  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  44.96 
 
 		 404 aa  93.6  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.98 
 
 		 390 aa  93.2  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.3 
 
 		 413 aa  92.8  2e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.21 
 
 		 462 aa  92.8  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  36.62 
 
 		 266 aa  92.4  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2210  ribonuclease III  28.43 
 
 		 804 aa  91.3  5e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7242  putative flagellar hook protein FlgE  30.74 
 
 		 466 aa  91.3  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.53 
 
 		 397 aa  90.9  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  35.29 
 
 		 418 aa  90.9  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1107  flagellar basal body rod protein FlgG  38.85 
 
 		 262 aa  90.9  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  40.15 
 
 		 413 aa  90.9  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  28.19 
 
 		 425 aa  90.1  1e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  35.04 
 
 		 450 aa  89.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  35.97 
 
 		 425 aa  90.1  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  35.19 
 
 		 414 aa  90.5  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5537  putative flagellar hook protein flgE  37.21 
 
 		 601 aa  89.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.29 
 
 		 276 aa  89.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  37.42 
 
 		 838 aa  89.4  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  30.36 
 
 		 845 aa  89.7  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  39.42 
 
 		 413 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  32.87 
 
 		 453 aa  89.4  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2953  flagellar basal body rod protein FlgG  43.97 
 
 		 262 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480008 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  36.96 
 
 		 401 aa  89.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3100  flagellar basal-body rod protein FlgG  41.53 
 
 		 263 aa  89.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3830  hypothetical protein  31.11 
 
 		 538 aa  89.7  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0390801  normal  0.276632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>