More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3379 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 434 aa  854    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  64.77 
 
 		 452 aa  546  1e-154  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  56.73 
 
 		 446 aa  493  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2963  hypothetical protein  54.41 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1303  putative flagellar hook protein  54.41 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2736  hypothetical protein  54.01 
 
 		 474 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  54.48 
 
 		 422 aa  427  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  34.75 
 
 		 461 aa  225  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 422 aa  180  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  32.2 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  32.05 
 
 		 403 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  32.27 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  31.71 
 
 		 421 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  31.29 
 
 		 426 aa  169  1e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  32.35 
 
 		 402 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  33.18 
 
 		 412 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  30.91 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  33.64 
 
 		 421 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  30.91 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  30.43 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  31.75 
 
 		 430 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  31.39 
 
 		 430 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  31.36 
 
 		 407 aa  155  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  30.61 
 
 		 377 aa  155  1e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1111  flagellar hook protein FlgE  31.91 
 
 		 411 aa  153  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397372  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  32.21 
 
 		 419 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  30.77 
 
 		 432 aa  152  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  27.87 
 
 		 407 aa  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  29.15 
 
 		 425 aa  147  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  30.46 
 
 		 414 aa  146  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  29.21 
 
 		 433 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2532  flagellar hook protein FlgE  30.43 
 
 		 460 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  30.2 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  31.15 
 
 		 420 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  30.09 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  27.65 
 
 		 442 aa  137  5e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  29.91 
 
 		 413 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.69 
 
 		 428 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.76 
 
 		 428 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  30.39 
 
 		 394 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  28.12 
 
 		 450 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.51 
 
 		 415 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.63 
 
 		 423 aa  130  4.0000000000000003e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  28.85 
 
 		 433 aa  130  6e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  28.6 
 
 		 441 aa  130  7.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  29.54 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1010  hypothetical protein  33.66 
 
 		 556 aa  127  4.0000000000000003e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819939  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  28.77 
 
 		 398 aa  125  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  26.95 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  25.78 
 
 		 410 aa  124  3e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  27.77 
 
 		 463 aa  124  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  31.41 
 
 		 409 aa  124  5e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  29.5 
 
 		 454 aa  123  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  27.98 
 
 		 440 aa  123  6e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  26.74 
 
 		 442 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  29.53 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7242  putative flagellar hook protein FlgE  28.48 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  30.09 
 
 		 411 aa  121  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.31 
 
 		 413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  32.28 
 
 		 398 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  27.35 
 
 		 425 aa  119  9e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  28.88 
 
 		 479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  29.21 
 
 		 404 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  26.91 
 
 		 426 aa  118  3e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01289  flagellar hook protein FlgE  26.36 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.07 
 
 		 462 aa  117  3e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  26.11 
 
 		 475 aa  117  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  26.21 
 
 		 405 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  26.35 
 
 		 458 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  28.67 
 
 		 418 aa  116  8.999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.56 
 
 		 488 aa  116  8.999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  29.57 
 
 		 408 aa  116  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  28.1 
 
 		 408 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  27.77 
 
 		 437 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  26.89 
 
 		 398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  27.54 
 
 		 404 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.33 
 
 		 390 aa  114  5e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  28.79 
 
 		 453 aa  112  9e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  29.8 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.22 
 
 		 397 aa  111  2.0000000000000002e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1716  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.41 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.727886  normal  0.851107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2431  hypothetical protein  28.41 
 
 		 442 aa  111  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  27.91 
 
 		 425 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  25.56 
 
 		 430 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0080  flagellar hook protein FlgE  28.41 
 
 		 423 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  26.57 
 
 		 462 aa  110  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1541  flagellar hook protein FlgE  27.39 
 
 		 437 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1568  flagellar hook protein FlgE  26.74 
 
 		 437 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.874042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1686  flagellar hook protein FlgE  26.74 
 
 		 437 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  29.06 
 
 		 453 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  29.64 
 
 		 402 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  27.71 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  27.65 
 
 		 399 aa  109  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  29.61 
 
 		 398 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  27.56 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  28.91 
 
 		 455 aa  108  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1789  flagellar hook protein FlgE  26.1 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  27.56 
 
 		 403 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  28.51 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  26.36 
 
 		 462 aa  107  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>