More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0683 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  93.3 
 
 		 402 aa  746    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  96.28 
 
 		 403 aa  771    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 403 aa  800    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  59.33 
 
 		 407 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  51.7 
 
 		 407 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1111  flagellar hook protein FlgE  51.56 
 
 		 411 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397372  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  46.46 
 
 		 422 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  48.55 
 
 		 402 aa  325  1e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  43.98 
 
 		 430 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  45.54 
 
 		 433 aa  319  6e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  45.62 
 
 		 432 aa  318  9e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  47.67 
 
 		 396 aa  318  1e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  43.75 
 
 		 430 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  46.44 
 
 		 426 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  46.19 
 
 		 377 aa  299  5e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  41.29 
 
 		 418 aa  289  6e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  43.2 
 
 		 414 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  41.09 
 
 		 415 aa  277  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  38.39 
 
 		 411 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  38.39 
 
 		 404 aa  221  9.999999999999999e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  34.02 
 
 		 421 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  32.66 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  32.6 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 399 aa  172  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  33.17 
 
 		 405 aa  172  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  32.27 
 
 		 434 aa  172  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  33.66 
 
 		 405 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  32.26 
 
 		 421 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  30.74 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  31.29 
 
 		 420 aa  166  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  29.93 
 
 		 422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  32.79 
 
 		 419 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  33.33 
 
 		 413 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  31.77 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.77 
 
 		 400 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  31.85 
 
 		 412 aa  161  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.24 
 
 		 423 aa  159  8e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.25 
 
 		 395 aa  156  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.45 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.45 
 
 		 428 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  32.85 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  32.44 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  32.44 
 
 		 403 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  32.85 
 
 		 402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  32.2 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  30.4 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  32.44 
 
 		 403 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  32.44 
 
 		 403 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  32.44 
 
 		 403 aa  153  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  32.3 
 
 		 398 aa  153  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  32.6 
 
 		 402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  32.6 
 
 		 402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  30.56 
 
 		 425 aa  152  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  32.36 
 
 		 401 aa  152  8e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  32.36 
 
 		 401 aa  152  8e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  31.32 
 
 		 419 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.73 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1303  putative flagellar hook protein  30.02 
 
 		 465 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  31.95 
 
 		 401 aa  151  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  30.4 
 
 		 446 aa  151  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2963  hypothetical protein  30.02 
 
 		 465 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  31.4 
 
 		 419 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  32.51 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  31.04 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  32.6 
 
 		 398 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  31.82 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  31.82 
 
 		 413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  31.9 
 
 		 405 aa  146  7.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.48 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  31.58 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  32.11 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  31.19 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  31.78 
 
 		 401 aa  143  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  29.91 
 
 		 413 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  31.73 
 
 		 404 aa  143  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.27 
 
 		 397 aa  144  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  31.19 
 
 		 410 aa  143  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  29.88 
 
 		 402 aa  143  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  28.87 
 
 		 417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  30.25 
 
 		 425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  29.83 
 
 		 414 aa  141  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.34 
 
 		 426 aa  140  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  30.31 
 
 		 413 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  29.83 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  28.98 
 
 		 428 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  28.98 
 
 		 428 aa  137  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  30.57 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  30.71 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  29.12 
 
 		 408 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  28.98 
 
 		 428 aa  137  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  30.26 
 
 		 413 aa  137  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  30.48 
 
 		 414 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  30.48 
 
 		 414 aa  136  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2431  hypothetical protein  28.89 
 
 		 442 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254601  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  31.16 
 
 		 407 aa  136  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  30.4 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.97 
 
 		 415 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  30.7 
 
 		 408 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  30.49 
 
 		 441 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1716  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.09 
 
 		 423 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.727886  normal  0.851107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>