More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2001 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
428 aa  861    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
428 aa  861    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
428 aa  861    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  66.12 
 
 
407 aa  539  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  61.92 
 
 
401 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  61.92 
 
 
401 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  62.15 
 
 
401 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  61.92 
 
 
401 aa  505  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  61.07 
 
 
402 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  61.07 
 
 
402 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  61.45 
 
 
403 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  61.45 
 
 
403 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  61.07 
 
 
402 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  60.75 
 
 
403 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  60.84 
 
 
402 aa  496  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  60.75 
 
 
403 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  60.75 
 
 
403 aa  497  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  59.91 
 
 
404 aa  487  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  53.5 
 
 
399 aa  439  9.999999999999999e-123  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  56.07 
 
 
405 aa  439  9.999999999999999e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  53.85 
 
 
405 aa  436  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  55.61 
 
 
405 aa  431  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  45.37 
 
 
404 aa  331  1e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  45.06 
 
 
405 aa  315  8e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  44.39 
 
 
383 aa  312  5.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  43.62 
 
 
415 aa  304  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  41.86 
 
 
417 aa  303  5.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  43.02 
 
 
413 aa  291  1e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  43.08 
 
 
410 aa  290  3e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  43.17 
 
 
442 aa  285  8e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01080  hypothetical protein  63.23 
 
 
219 aa  285  8e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  42.24 
 
 
414 aa  281  1e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  42.34 
 
 
406 aa  281  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  42.11 
 
 
413 aa  280  4e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  39.86 
 
 
420 aa  277  3e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  41.88 
 
 
413 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  41.88 
 
 
413 aa  275  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  41.88 
 
 
413 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  38.71 
 
 
410 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  41.95 
 
 
401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  41.76 
 
 
423 aa  274  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  40.64 
 
 
414 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  40.64 
 
 
414 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  40.64 
 
 
414 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  40.6 
 
 
413 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  40.6 
 
 
413 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  40.6 
 
 
413 aa  272  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  40.6 
 
 
413 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  40.6 
 
 
413 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  40.6 
 
 
413 aa  272  7e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  41.65 
 
 
413 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  40.6 
 
 
413 aa  272  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  39.95 
 
 
401 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  41.42 
 
 
413 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  40.6 
 
 
387 aa  265  8.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  41 
 
 
402 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  41 
 
 
402 aa  265  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  39.6 
 
 
425 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.15 
 
 
426 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  39.09 
 
 
414 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  39.13 
 
 
404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  37.67 
 
 
440 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  36.84 
 
 
441 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  35.39 
 
 
408 aa  238  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  36.71 
 
 
399 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  38.44 
 
 
400 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  36.26 
 
 
398 aa  237  3e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  35.85 
 
 
450 aa  236  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  38.41 
 
 
398 aa  236  4e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  37.24 
 
 
402 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  36.26 
 
 
440 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.49 
 
 
435 aa  234  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.97 
 
 
400 aa  233  6e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.16 
 
 
418 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  35.53 
 
 
442 aa  230  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  34.04 
 
 
462 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  35.31 
 
 
462 aa  228  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  36.59 
 
 
425 aa  227  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  35.2 
 
 
418 aa  224  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.99 
 
 
428 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  37.94 
 
 
395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.68 
 
 
413 aa  222  9e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  36.22 
 
 
407 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  36.22 
 
 
407 aa  221  9.999999999999999e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.77 
 
 
428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.27 
 
 
430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  36.68 
 
 
402 aa  221  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  37.09 
 
 
402 aa  221  3e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  36.53 
 
 
395 aa  220  5e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  34.48 
 
 
408 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.75 
 
 
395 aa  219  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  35.57 
 
 
413 aa  219  7.999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  34.26 
 
 
451 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  35.45 
 
 
395 aa  216  5e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  35.45 
 
 
395 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  34.89 
 
 
398 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  34.79 
 
 
437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  34.93 
 
 
407 aa  211  2e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  33.63 
 
 
443 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  34.5 
 
 
438 aa  209  8e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>