More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA1139 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
396 aa  787    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  86.9 
 
 
426 aa  694    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  94.7 
 
 
377 aa  712    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  51.18 
 
 
422 aa  386  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  48.51 
 
 
432 aa  351  1e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  47.02 
 
 
433 aa  341  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  49.64 
 
 
402 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  46.65 
 
 
430 aa  332  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  47.04 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1111  flagellar hook protein FlgE  48.55 
 
 
411 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397372  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  45.18 
 
 
430 aa  322  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  47.67 
 
 
403 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  44.87 
 
 
415 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  44.23 
 
 
414 aa  316  4e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  45.95 
 
 
403 aa  308  9e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  44.88 
 
 
407 aa  300  3e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  43.58 
 
 
407 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  39.76 
 
 
418 aa  258  9e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  40.19 
 
 
404 aa  256  5e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  39.1 
 
 
411 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  32.46 
 
 
422 aa  196  5.000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.59 
 
 
400 aa  189  1e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  33.59 
 
 
400 aa  188  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  33.81 
 
 
419 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  32.86 
 
 
419 aa  182  6e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.75 
 
 
395 aa  181  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  32.43 
 
 
434 aa  179  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  31.03 
 
 
452 aa  179  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  33.41 
 
 
413 aa  177  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  34.02 
 
 
421 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  29.97 
 
 
399 aa  172  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  34.58 
 
 
419 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  33.09 
 
 
405 aa  169  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  32.25 
 
 
420 aa  168  1e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  33.65 
 
 
412 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  31.41 
 
 
405 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  32.83 
 
 
395 aa  166  9e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  33.08 
 
 
395 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.5 
 
 
390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.37 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  32.66 
 
 
398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  32.3 
 
 
405 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.71 
 
 
415 aa  162  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  29.82 
 
 
442 aa  162  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  32.02 
 
 
421 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  31.18 
 
 
461 aa  160  5e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  31.62 
 
 
401 aa  159  8e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.89 
 
 
456 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.39 
 
 
423 aa  159  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  31.74 
 
 
413 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  30.05 
 
 
410 aa  158  1e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  31.6 
 
 
403 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  31.6 
 
 
403 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  31.74 
 
 
413 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  31.74 
 
 
413 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  31.6 
 
 
403 aa  158  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  31.36 
 
 
403 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  31.36 
 
 
403 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  31.47 
 
 
413 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  30.73 
 
 
401 aa  157  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  31.67 
 
 
414 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  30.89 
 
 
433 aa  157  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  32.31 
 
 
413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  32.31 
 
 
413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  32.31 
 
 
413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  32.31 
 
 
413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  32.31 
 
 
413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  32.31 
 
 
413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  32.31 
 
 
413 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  28.77 
 
 
425 aa  156  6e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  31.55 
 
 
406 aa  156  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  31.5 
 
 
413 aa  156  8e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2736  hypothetical protein  30.32 
 
 
474 aa  155  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  31.34 
 
 
425 aa  155  9e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  31.48 
 
 
413 aa  155  1e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  30.35 
 
 
402 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  29.77 
 
 
417 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.08 
 
 
397 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.36 
 
 
454 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2963  hypothetical protein  28.6 
 
 
465 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1303  putative flagellar hook protein  28.6 
 
 
465 aa  154  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  29.3 
 
 
410 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  32.14 
 
 
413 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.86 
 
 
435 aa  152  8e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  29.27 
 
 
446 aa  152  8e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  29.02 
 
 
407 aa  151  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  29.19 
 
 
408 aa  151  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  29.98 
 
 
418 aa  151  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  31.44 
 
 
414 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  31.32 
 
 
414 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  29.02 
 
 
407 aa  151  2e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  31.44 
 
 
414 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  31.19 
 
 
402 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  30.65 
 
 
399 aa  150  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  31.19 
 
 
402 aa  150  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  29.9 
 
 
404 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  31.83 
 
 
413 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  29.22 
 
 
462 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  29.75 
 
 
398 aa  150  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  31.19 
 
 
402 aa  150  4e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>