More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0370 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  92.4 
 
 
433 aa  763    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
432 aa  854    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  74.31 
 
 
430 aa  630  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  73.38 
 
 
430 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  50.57 
 
 
422 aa  401  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  51.13 
 
 
402 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  48.28 
 
 
418 aa  364  2e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  49.43 
 
 
426 aa  353  5e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  48.51 
 
 
396 aa  347  2e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1111  flagellar hook protein FlgE  48.97 
 
 
411 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397372  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  46.54 
 
 
402 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  45.06 
 
 
411 aa  328  9e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  46.08 
 
 
415 aa  322  8e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  45.62 
 
 
403 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  46.21 
 
 
377 aa  318  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  46.08 
 
 
414 aa  316  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  45.62 
 
 
403 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  45.85 
 
 
407 aa  306  3e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  43.38 
 
 
407 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  34.93 
 
 
404 aa  216  5e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  34.27 
 
 
399 aa  179  7e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.03 
 
 
413 aa  179  8e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  34.61 
 
 
413 aa  176  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.35 
 
 
395 aa  172  1e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  33.79 
 
 
413 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.11 
 
 
400 aa  169  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  33.19 
 
 
440 aa  169  1e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  32.72 
 
 
400 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  33.26 
 
 
419 aa  167  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.32 
 
 
423 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  32.03 
 
 
405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  34.23 
 
 
419 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  32 
 
 
461 aa  164  3e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  30.48 
 
 
422 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  29.39 
 
 
452 aa  163  6e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  31.22 
 
 
442 aa  162  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  31.36 
 
 
405 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  33.26 
 
 
398 aa  161  2e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  32.51 
 
 
428 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  32.51 
 
 
428 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  32.51 
 
 
428 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  32.49 
 
 
402 aa  159  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  31.05 
 
 
446 aa  159  9e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  32.06 
 
 
434 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  31.51 
 
 
405 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  31.41 
 
 
402 aa  158  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  31.61 
 
 
420 aa  157  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  31.16 
 
 
398 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.46 
 
 
397 aa  157  5.0000000000000005e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  29.75 
 
 
475 aa  156  7e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  32.46 
 
 
412 aa  156  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  30.91 
 
 
405 aa  155  9e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  31.88 
 
 
407 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  32.1 
 
 
415 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  31.88 
 
 
407 aa  154  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.76 
 
 
426 aa  154  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  31.97 
 
 
417 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  34.15 
 
 
419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  30.7 
 
 
425 aa  154  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  30.6 
 
 
433 aa  153  5e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  30.38 
 
 
425 aa  153  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  31.36 
 
 
407 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  32.18 
 
 
402 aa  151  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.8 
 
 
456 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  31.19 
 
 
421 aa  151  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  29.17 
 
 
454 aa  150  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  32.04 
 
 
404 aa  149  8e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  29.63 
 
 
450 aa  149  9e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  31.95 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  32.03 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  32.03 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  31.58 
 
 
401 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  31.94 
 
 
404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  30.48 
 
 
403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  31.15 
 
 
406 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  31.61 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  31.63 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  32.26 
 
 
401 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  30.48 
 
 
403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  30.94 
 
 
394 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  30.34 
 
 
413 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  30.79 
 
 
413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  32.42 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  32.42 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  30.25 
 
 
403 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  30.25 
 
 
403 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  30.25 
 
 
403 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  28.28 
 
 
410 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  30.18 
 
 
398 aa  146  8.000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  30.7 
 
 
395 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  31.64 
 
 
407 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  31.35 
 
 
421 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2736  hypothetical protein  30.29 
 
 
474 aa  144  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2310  flagellar basal body FlaE domain protein  31.43 
 
 
456 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0296188  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  30.56 
 
 
413 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  30.56 
 
 
413 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  30.25 
 
 
425 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  30.77 
 
 
395 aa  144  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  31.22 
 
 
402 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  31.22 
 
 
402 aa  144  4e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>