More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2310 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  78.95 
 
 
456 aa  696    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2310  flagellar basal body FlaE domain protein  100 
 
 
456 aa  890    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0296188  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0889  protein of unknown function DUF1078 domain protein  62.04 
 
 
460 aa  556  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.466386  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0950  hypothetical protein  61.61 
 
 
460 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0412167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  61.61 
 
 
460 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5543  hypothetical protein  54.72 
 
 
461 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194556  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  49.27 
 
 
464 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7242  putative flagellar hook protein FlgE  49.47 
 
 
466 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  42.76 
 
 
454 aa  358  9.999999999999999e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1099  flagellar basal body rod protein, FlaE  52.59 
 
 
613 aa  248  2e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1331  flagellar basal body FlaE  51 
 
 
615 aa  243  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5537  putative flagellar hook protein flgE  49.8 
 
 
601 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0639187 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1667  hypothetical protein  47.04 
 
 
610 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.551124  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  49.4 
 
 
598 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1485  hypothetical protein  45.83 
 
 
599 aa  224  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4455  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.1 
 
 
598 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  34.03 
 
 
425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  32.14 
 
 
421 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  31.49 
 
 
404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  31.24 
 
 
421 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.3 
 
 
428 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.3 
 
 
428 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  32.98 
 
 
419 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  31.05 
 
 
419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  30.61 
 
 
430 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  29.98 
 
 
430 aa  153  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  32.28 
 
 
419 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  30.75 
 
 
399 aa  150  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.97 
 
 
400 aa  150  4e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.13 
 
 
423 aa  150  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  32.97 
 
 
400 aa  149  9e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  30.88 
 
 
428 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  32.12 
 
 
413 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  29.03 
 
 
426 aa  146  6e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  28.51 
 
 
396 aa  144  5e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  29.55 
 
 
413 aa  143  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  30.67 
 
 
410 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  30.71 
 
 
442 aa  140  3e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  31.43 
 
 
432 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  29.54 
 
 
401 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  27.02 
 
 
425 aa  140  6e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  29.89 
 
 
415 aa  139  1e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  31.36 
 
 
401 aa  138  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  31.17 
 
 
405 aa  138  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  31.12 
 
 
414 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.11 
 
 
435 aa  138  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.29 
 
 
488 aa  138  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  31.12 
 
 
414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  31.12 
 
 
414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.38 
 
 
462 aa  137  6.0000000000000005e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  27.86 
 
 
377 aa  136  6.0000000000000005e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  31.14 
 
 
405 aa  136  7.000000000000001e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  31.39 
 
 
404 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  31.13 
 
 
413 aa  136  8e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  30.98 
 
 
413 aa  136  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  30.04 
 
 
433 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  30.87 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  29.18 
 
 
394 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  31.61 
 
 
412 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  30.92 
 
 
413 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  30.92 
 
 
413 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  32.19 
 
 
414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  26.64 
 
 
441 aa  133  5e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  30.28 
 
 
405 aa  133  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  30.34 
 
 
414 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  31.13 
 
 
413 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  30.31 
 
 
417 aa  132  9e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  28.69 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  29.61 
 
 
404 aa  132  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  30.4 
 
 
411 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2431  hypothetical protein  31.35 
 
 
442 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254601  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  31.5 
 
 
413 aa  131  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  28.05 
 
 
519 aa  131  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.16 
 
 
390 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  28.32 
 
 
410 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  29.45 
 
 
450 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  27.91 
 
 
398 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.03 
 
 
426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  29.2 
 
 
403 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  31 
 
 
413 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  31 
 
 
413 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  31 
 
 
413 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  31 
 
 
413 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  29.61 
 
 
398 aa  127  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  31 
 
 
413 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  29.2 
 
 
403 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  31 
 
 
413 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  30.26 
 
 
399 aa  128  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  28.57 
 
 
383 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  31 
 
 
413 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.95 
 
 
395 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  29.21 
 
 
402 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.86 
 
 
397 aa  127  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  27.93 
 
 
417 aa  127  5e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  29.61 
 
 
402 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  29.61 
 
 
402 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0080  flagellar hook protein FlgE  27.95 
 
 
423 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  29.23 
 
 
403 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.21 
 
 
413 aa  126  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1716  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  27.95 
 
 
423 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.727886  normal  0.851107 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>