More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4788 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  90.05 
 
 
401 aa  733    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
402 aa  801    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  83.33 
 
 
401 aa  682    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
402 aa  801    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  53.19 
 
 
405 aa  390  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  47.95 
 
 
410 aa  370  1e-101  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  48.1 
 
 
413 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  47.86 
 
 
413 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  47.86 
 
 
413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  47.86 
 
 
413 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  47.38 
 
 
413 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  47.62 
 
 
413 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  46.67 
 
 
413 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  47.16 
 
 
414 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  48.66 
 
 
406 aa  353  4e-96  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  44.62 
 
 
442 aa  348  9e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  46.67 
 
 
414 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  46.67 
 
 
414 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  46.67 
 
 
414 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  48.31 
 
 
404 aa  346  5e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  46.21 
 
 
413 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  46.21 
 
 
413 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  46.21 
 
 
413 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  46.21 
 
 
413 aa  344  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  46.21 
 
 
413 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  46.21 
 
 
413 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  46.21 
 
 
413 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  46.21 
 
 
414 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  46.21 
 
 
420 aa  335  9e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  44.66 
 
 
418 aa  318  9e-86  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  46.36 
 
 
401 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  46.36 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  46.36 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  41.57 
 
 
440 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  43.88 
 
 
410 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  45.39 
 
 
401 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  45.52 
 
 
402 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  41.61 
 
 
443 aa  300  3e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  39.95 
 
 
438 aa  300  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  44.99 
 
 
399 aa  298  9e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  44.82 
 
 
405 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  39.1 
 
 
440 aa  296  3e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  45.04 
 
 
402 aa  296  4e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  44.87 
 
 
404 aa  295  7e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  41.26 
 
 
425 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  44.55 
 
 
402 aa  292  7e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  44.55 
 
 
402 aa  292  7e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  40.27 
 
 
451 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  37.85 
 
 
462 aa  290  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  40.48 
 
 
407 aa  290  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  40.48 
 
 
407 aa  290  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  37.2 
 
 
462 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  43.98 
 
 
417 aa  288  1e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  43.52 
 
 
423 aa  287  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  44.06 
 
 
415 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  41.79 
 
 
407 aa  287  2e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  43.86 
 
 
405 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  40.04 
 
 
450 aa  282  8.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  43.96 
 
 
403 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  43.96 
 
 
403 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  43.72 
 
 
403 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  43.72 
 
 
403 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  43.72 
 
 
403 aa  280  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  40.86 
 
 
442 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  39.76 
 
 
408 aa  278  1e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  41.28 
 
 
383 aa  278  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  43.37 
 
 
405 aa  277  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  40.22 
 
 
441 aa  277  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  40.33 
 
 
426 aa  275  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  39.52 
 
 
408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  42.62 
 
 
404 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  39.25 
 
 
425 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38 
 
 
418 aa  268  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.48 
 
 
430 aa  268  2e-70  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  43.57 
 
 
407 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  41 
 
 
428 aa  265  8e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  41 
 
 
428 aa  265  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  41 
 
 
428 aa  265  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  37.56 
 
 
437 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  40.63 
 
 
398 aa  260  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.41 
 
 
395 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  39.56 
 
 
400 aa  260  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.32 
 
 
400 aa  259  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  36.78 
 
 
453 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  37.19 
 
 
437 aa  256  7e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  39.27 
 
 
399 aa  251  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  34.8 
 
 
453 aa  249  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  35.24 
 
 
453 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  34.8 
 
 
453 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  34.8 
 
 
453 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  34.58 
 
 
453 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  34.8 
 
 
453 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  34.8 
 
 
453 aa  247  3e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  34.58 
 
 
453 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  35.65 
 
 
459 aa  246  3e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  34.95 
 
 
454 aa  246  6e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  35.06 
 
 
460 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  35.68 
 
 
453 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  35.94 
 
 
398 aa  241  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  34.73 
 
 
453 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>