More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1183 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  100 
 
 		 413 aa  824    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  47.61 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  46.51 
 
 		 419 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  44.85 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.02 
 
 		 428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.02 
 
 		 428 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.32 
 
 		 413 aa  258  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  37.11 
 
 		 410 aa  250  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  39.13 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  35.66 
 
 		 496 aa  243  3.9999999999999997e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  38.57 
 
 		 399 aa  243  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  36.44 
 
 		 462 aa  243  6e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  37.41 
 
 		 428 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  36.51 
 
 		 417 aa  239  8e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  36.59 
 
 		 438 aa  239  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  34.89 
 
 		 442 aa  238  1e-61  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  35.36 
 
 		 462 aa  238  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  37.16 
 
 		 440 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.49 
 
 		 454 aa  229  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  36.32 
 
 		 442 aa  229  9e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  36.85 
 
 		 420 aa  227  2e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.5 
 
 		 488 aa  228  2e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  36.26 
 
 		 425 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  38.57 
 
 		 413 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.52 
 
 		 418 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.72 
 
 		 430 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  36.63 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  36.14 
 
 		 441 aa  225  1e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  37.79 
 
 		 414 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  36.76 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  36.03 
 
 		 398 aa  223  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  35.85 
 
 		 410 aa  222  8e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  35.08 
 
 		 442 aa  220  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  37.05 
 
 		 408 aa  220  3.9999999999999997e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  35.6 
 
 		 441 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  35.76 
 
 		 407 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  35.76 
 
 		 407 aa  219  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  37.41 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  37.41 
 
 		 413 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  37.41 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  37.8 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  38.28 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  35.04 
 
 		 404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  33.71 
 
 		 440 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.3 
 
 		 435 aa  216  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.94 
 
 		 415 aa  216  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.68 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  35.57 
 
 		 443 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  35.97 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  36.3 
 
 		 399 aa  213  5.999999999999999e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.24 
 
 		 397 aa  212  9e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  37.27 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  34.5 
 
 		 417 aa  210  4e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.05 
 
 		 395 aa  209  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  33.2 
 
 		 475 aa  210  5e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  35.52 
 
 		 406 aa  209  6e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  34.65 
 
 		 398 aa  209  8e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  35.08 
 
 		 401 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  35.38 
 
 		 394 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  36.59 
 
 		 402 aa  208  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  35.06 
 
 		 398 aa  208  2e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  34.98 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  35.56 
 
 		 414 aa  207  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  36.97 
 
 		 408 aa  207  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  35.32 
 
 		 414 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  35.32 
 
 		 414 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  34.52 
 
 		 402 aa  206  7e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  34.52 
 
 		 402 aa  206  7e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  35.7 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  34.52 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  33.05 
 
 		 463 aa  204  2e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  35.52 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  32.96 
 
 		 440 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.89 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  35.17 
 
 		 409 aa  204  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  34.84 
 
 		 401 aa  203  4e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  33.89 
 
 		 400 aa  203  4e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  34.23 
 
 		 403 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  34.37 
 
 		 403 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  34.23 
 
 		 403 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  34.37 
 
 		 403 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  34.37 
 
 		 403 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  35.41 
 
 		 414 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.12 
 
 		 426 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  36.21 
 
 		 415 aa  201  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.84 
 
 		 390 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  34.05 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  32.76 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  32.52 
 
 		 451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  34.61 
 
 		 401 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  34.61 
 
 		 401 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  33.62 
 
 		 460 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  35.75 
 
 		 405 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.87 
 
 		 501 aa  199  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  35.71 
 
 		 418 aa  200  5e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  32.67 
 
 		 455 aa  199  5e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  32.45 
 
 		 453 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  34.97 
 
 		 415 aa  199  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  34.13 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  31.57 
 
 		 453 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>