More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2847 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 438 aa  870    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  64.72 
 
 		 462 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  64.07 
 
 		 462 aa  580  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  54.88 
 
 		 440 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  53.27 
 
 		 442 aa  433  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  51.93 
 
 		 440 aa  430  1e-119  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  53.62 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  52.34 
 
 		 443 aa  425  1e-118  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  51.32 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  47.62 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  45.68 
 
 		 398 aa  345  8e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  46.8 
 
 		 405 aa  339  7e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  44.14 
 
 		 408 aa  337  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  45.88 
 
 		 420 aa  336  5.999999999999999e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  42.63 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  42.63 
 
 		 407 aa  330  3e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  44.32 
 
 		 437 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  42.54 
 
 		 410 aa  325  7e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  44.54 
 
 		 437 aa  325  8.000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  42.63 
 
 		 407 aa  325  9e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  43.94 
 
 		 395 aa  325  9e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  42.24 
 
 		 398 aa  320  3e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.19 
 
 		 430 aa  316  5e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  43.08 
 
 		 408 aa  315  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  42.92 
 
 		 418 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  41.87 
 
 		 442 aa  311  1e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  40.86 
 
 		 401 aa  310  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  42.47 
 
 		 395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  43.74 
 
 		 406 aa  306  6e-82  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  41.85 
 
 		 425 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  42.24 
 
 		 413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  42.24 
 
 		 413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  42.24 
 
 		 413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  42.24 
 
 		 413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  42.24 
 
 		 413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  42.24 
 
 		 413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  42.24 
 
 		 413 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  41.61 
 
 		 425 aa  303  6.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.64 
 
 		 418 aa  302  7.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  41.86 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  42.01 
 
 		 395 aa  299  7e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  39.82 
 
 		 401 aa  298  1e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  40.5 
 
 		 413 aa  297  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  42.33 
 
 		 414 aa  296  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  41.59 
 
 		 413 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  40.78 
 
 		 453 aa  294  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  39.3 
 
 		 454 aa  293  4e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  39.82 
 
 		 398 aa  293  6e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  38.25 
 
 		 453 aa  292  7e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  40.55 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  41.14 
 
 		 402 aa  291  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  40.55 
 
 		 414 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  40.55 
 
 		 414 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  41.42 
 
 		 413 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  41.42 
 
 		 413 aa  290  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  41.19 
 
 		 413 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  40.92 
 
 		 400 aa  288  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  39.95 
 
 		 402 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  42.01 
 
 		 413 aa  288  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  39.95 
 
 		 402 aa  288  2e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  40.69 
 
 		 400 aa  286  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  38.41 
 
 		 460 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  40.96 
 
 		 413 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  38.72 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  39.09 
 
 		 402 aa  281  1e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  39.55 
 
 		 414 aa  280  3e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  37.11 
 
 		 458 aa  280  5e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  39.31 
 
 		 453 aa  279  6e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  38.38 
 
 		 453 aa  278  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  38.96 
 
 		 459 aa  278  2e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  38.61 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  41.57 
 
 		 404 aa  275  9e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  37.71 
 
 		 461 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  39.22 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  39.22 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  39.22 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  39.36 
 
 		 383 aa  272  8.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  38.43 
 
 		 402 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  38.95 
 
 		 410 aa  271  2e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  38.84 
 
 		 413 aa  271  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.69 
 
 		 426 aa  269  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  40.4 
 
 		 423 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0080  flagellar hook protein FlgE  37.23 
 
 		 423 aa  256  7e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1716  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.23 
 
 		 423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.727886  normal  0.851107 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  38.15 
 
 		 399 aa  254  3e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.37 
 
 		 435 aa  253  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  35.39 
 
 		 450 aa  249  6e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  37.09 
 
 		 415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  46.67 
 
 		 584 aa  244  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2210  ribonuclease III  44.22 
 
 		 804 aa  240  2.9999999999999997e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  36.59 
 
 		 413 aa  240  4e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  36.4 
 
 		 395 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  36.51 
 
 		 402 aa  238  2e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1105  hypothetical protein  47.24 
 
 		 637 aa  237  3e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  36.65 
 
 		 402 aa  236  4e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  36.4 
 
 		 395 aa  237  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  35.29 
 
 		 437 aa  236  4e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  36.57 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  36.57 
 
 		 402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  36.73 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>