More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0970 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  100 
 
 		 408 aa  814    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  53.11 
 
 		 394 aa  392  1e-108  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  50.24 
 
 		 398 aa  376  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  53.51 
 
 		 397 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  51.34 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  46.04 
 
 		 417 aa  345  1e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.78 
 
 		 462 aa  320  3e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  39.87 
 
 		 442 aa  294  2e-78  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  41.72 
 
 		 440 aa  285  7e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  40 
 
 		 441 aa  276  3e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.69 
 
 		 454 aa  276  6e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  35.52 
 
 		 463 aa  263  3e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.95 
 
 		 415 aa  253  6e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  40.24 
 
 		 409 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  35.34 
 
 		 475 aa  241  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0145  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.12 
 
 		 431 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4124  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.32 
 
 		 426 aa  236  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  34.77 
 
 		 479 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  37.2 
 
 		 413 aa  218  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.43 
 
 		 413 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.57 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.02 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  35.8 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  32.48 
 
 		 419 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  34.85 
 
 		 433 aa  209  9e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  35.14 
 
 		 405 aa  207  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  32.55 
 
 		 419 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  36.34 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  36.34 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  36.34 
 
 		 402 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  35.79 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  36.1 
 
 		 401 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  36.1 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  36.1 
 
 		 401 aa  199  6e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  36.1 
 
 		 401 aa  199  6e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  35.87 
 
 		 405 aa  199  7e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  36.1 
 
 		 401 aa  199  9e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  34.94 
 
 		 425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  35.63 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  32.94 
 
 		 407 aa  196  9e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  32.94 
 
 		 407 aa  196  9e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  35.31 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  33.57 
 
 		 407 aa  195  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2339  protein of unknown function DUF1078 domain protein  58.7 
 
 		 276 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.515219  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  35.07 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  35.6 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  35.05 
 
 		 404 aa  193  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  35.6 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  32.86 
 
 		 408 aa  193  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  36.52 
 
 		 406 aa  192  6e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  34.34 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  34.34 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  34.34 
 
 		 403 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  34.8 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  32.74 
 
 		 441 aa  189  5e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1773  flagellar hook protein FlgE  32.54 
 
 		 407 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1829  flagellar hook protein FlgE  32.3 
 
 		 407 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.162311  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 		 428 aa  189  1e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  34.28 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  32.37 
 
 		 442 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  33.97 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.89 
 
 		 508 aa  187  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1530  flagellar hook protein FlgE  32.51 
 
 		 437 aa  186  7e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1751  flagellar hook protein FlgE  32.51 
 
 		 437 aa  186  9e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  31.65 
 
 		 410 aa  184  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  32.94 
 
 		 408 aa  184  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  33.65 
 
 		 413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1570  flagellar hook protein FlgE  31.19 
 
 		 407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.370708  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  33.49 
 
 		 420 aa  183  6e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  33.97 
 
 		 398 aa  183  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  32.81 
 
 		 438 aa  182  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1541  flagellar hook protein FlgE  32.28 
 
 		 437 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3626  flagellar hook protein FlgE  31.19 
 
 		 407 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1720  flagellar hook protein FlgE  31.19 
 
 		 407 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  33.96 
 
 		 387 aa  182  9.000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  32.49 
 
 		 418 aa  181  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.82 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  34.29 
 
 		 398 aa  181  2e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  33.1 
 
 		 413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  33.57 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1568  flagellar hook protein FlgE  32.05 
 
 		 437 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.874042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1686  flagellar hook protein FlgE  32.05 
 
 		 437 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.19 
 
 		 423 aa  179  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  31.55 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  33.18 
 
 		 413 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  33.1 
 
 		 410 aa  178  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  34.13 
 
 		 401 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  34.15 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  34.43 
 
 		 414 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  32.94 
 
 		 413 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  32.94 
 
 		 413 aa  176  5e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  32.33 
 
 		 451 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  32.94 
 
 		 413 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  33.57 
 
 		 414 aa  176  9e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  32.94 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  30.91 
 
 		 443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  32.46 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  32.46 
 
 		 413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>