More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1645 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  100 
 
 
409 aa  809    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  40.57 
 
 
417 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  41.06 
 
 
394 aa  270  4e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.67 
 
 
488 aa  249  7e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  40.24 
 
 
408 aa  243  5e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  38.9 
 
 
398 aa  241  2e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.61 
 
 
397 aa  236  4e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  38.88 
 
 
440 aa  236  4e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.92 
 
 
390 aa  235  9e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  35.29 
 
 
441 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  37.97 
 
 
410 aa  230  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  38.76 
 
 
399 aa  229  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.28 
 
 
454 aa  225  1e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0145  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.65 
 
 
431 aa  225  1e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  36.99 
 
 
410 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.14 
 
 
415 aa  224  2e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  36.21 
 
 
408 aa  222  7e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  36.67 
 
 
419 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  37.91 
 
 
413 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  35.38 
 
 
463 aa  221  1.9999999999999999e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  37.62 
 
 
414 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  36.73 
 
 
419 aa  220  3e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  37.38 
 
 
414 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  37.15 
 
 
414 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.44 
 
 
428 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  37.15 
 
 
414 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.74 
 
 
428 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  37.53 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  37.27 
 
 
425 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  38.03 
 
 
404 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  36.73 
 
 
413 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  35.73 
 
 
433 aa  212  9e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  36.19 
 
 
383 aa  212  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  38.06 
 
 
401 aa  210  4e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  36.64 
 
 
413 aa  210  4e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  37.83 
 
 
401 aa  210  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  36.73 
 
 
413 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  37.35 
 
 
401 aa  209  7e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  37.35 
 
 
401 aa  209  7e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  34.87 
 
 
413 aa  209  8e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.43 
 
 
423 aa  209  8e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  36.26 
 
 
414 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.41 
 
 
418 aa  207  2e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  35.78 
 
 
413 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  35.78 
 
 
413 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  35.78 
 
 
413 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  36.77 
 
 
398 aa  206  8e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.13 
 
 
462 aa  205  1e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  35.61 
 
 
401 aa  204  2e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  36.12 
 
 
413 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  36.12 
 
 
413 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  36.12 
 
 
413 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  36.12 
 
 
413 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  37.03 
 
 
402 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  36.12 
 
 
413 aa  204  3e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  36.12 
 
 
413 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  37.03 
 
 
402 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  36.12 
 
 
413 aa  204  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  37.26 
 
 
402 aa  202  7e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  37.26 
 
 
402 aa  202  7e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  37.26 
 
 
402 aa  202  8e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  36.49 
 
 
441 aa  202  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  39.43 
 
 
404 aa  202  9e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  35.76 
 
 
401 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  34.47 
 
 
442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  33.92 
 
 
450 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  35.66 
 
 
408 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  35.75 
 
 
438 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  37.03 
 
 
402 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  32.65 
 
 
496 aa  198  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  33.63 
 
 
442 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.27 
 
 
413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  38.66 
 
 
406 aa  197  3e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  35.92 
 
 
443 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  30.74 
 
 
475 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  34.26 
 
 
462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  36.24 
 
 
399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  37.03 
 
 
407 aa  196  7e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  36.94 
 
 
440 aa  196  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  34.6 
 
 
405 aa  196  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.07 
 
 
426 aa  195  1e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  33.83 
 
 
462 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  34.82 
 
 
407 aa  194  3e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  34.19 
 
 
407 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  34.19 
 
 
407 aa  194  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  36.83 
 
 
428 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  34.07 
 
 
451 aa  192  8e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  36.1 
 
 
403 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  36.1 
 
 
403 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  36.1 
 
 
403 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  36.1 
 
 
403 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  36.1 
 
 
403 aa  191  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  35.15 
 
 
405 aa  189  7e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  34.79 
 
 
415 aa  189  1e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  35.21 
 
 
404 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  36.15 
 
 
405 aa  186  6e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  34.25 
 
 
420 aa  186  9e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  34.69 
 
 
440 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  34.4 
 
 
425 aa  182  7e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  34.55 
 
 
417 aa  182  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>