More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0858 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  100 
 
 
475 aa  980    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.07 
 
 
454 aa  323  5e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  40.34 
 
 
442 aa  319  6e-86  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  40.2 
 
 
440 aa  311  1e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  38.01 
 
 
519 aa  311  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.01 
 
 
508 aa  307  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.37 
 
 
488 aa  291  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  37.22 
 
 
441 aa  286  5e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  36.76 
 
 
417 aa  282  1e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  36.55 
 
 
398 aa  271  1e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  35.07 
 
 
463 aa  270  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.57 
 
 
462 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.97 
 
 
397 aa  253  5.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  33.89 
 
 
394 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  35.43 
 
 
479 aa  249  8e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.85 
 
 
415 aa  237  3e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  36.31 
 
 
408 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  30.75 
 
 
419 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  33.82 
 
 
413 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  31.87 
 
 
419 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.97 
 
 
428 aa  205  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.76 
 
 
428 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  30.38 
 
 
496 aa  199  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  31.58 
 
 
409 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  29.55 
 
 
450 aa  191  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  31.34 
 
 
433 aa  189  1e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  30.86 
 
 
428 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0145  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.26 
 
 
431 aa  189  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  31.36 
 
 
454 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  29.27 
 
 
408 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  30.04 
 
 
442 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  30.94 
 
 
461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.19 
 
 
413 aa  182  1e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  29.54 
 
 
413 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  29.72 
 
 
410 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.87 
 
 
423 aa  180  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  31.84 
 
 
460 aa  179  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  28.9 
 
 
410 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  30.21 
 
 
425 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  29.56 
 
 
405 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  27.63 
 
 
498 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  31.29 
 
 
399 aa  177  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  29.39 
 
 
458 aa  177  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  30.61 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  30.61 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  29.79 
 
 
453 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  30.61 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0257  hypothetical protein  45.74 
 
 
623 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  29.5 
 
 
413 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0255  hypothetical protein  46.28 
 
 
750 aa  172  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  28.18 
 
 
413 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  28.18 
 
 
413 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  28.18 
 
 
413 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  28.18 
 
 
413 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  28.18 
 
 
413 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  29.5 
 
 
413 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  30.75 
 
 
462 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  29.5 
 
 
413 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  28.18 
 
 
413 aa  172  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  28.18 
 
 
413 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  29.96 
 
 
453 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  29.35 
 
 
414 aa  170  5e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  29.41 
 
 
413 aa  169  7e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  30.46 
 
 
401 aa  169  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  29.12 
 
 
453 aa  168  2e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.23 
 
 
426 aa  168  2e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  29.53 
 
 
438 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  29.84 
 
 
453 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.44 
 
 
501 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  29.52 
 
 
453 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  30.36 
 
 
462 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  28.11 
 
 
413 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  27.97 
 
 
420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  27.25 
 
 
413 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  29.75 
 
 
453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.81 
 
 
513 aa  165  2.0000000000000002e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  28.39 
 
 
414 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1537  hypothetical protein  41.49 
 
 
770 aa  164  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  28.93 
 
 
442 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  29.63 
 
 
405 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  29.69 
 
 
455 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  29.41 
 
 
453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  29.28 
 
 
453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  51.37 
 
 
636 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  29.44 
 
 
453 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  29.9 
 
 
407 aa  163  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  29.9 
 
 
407 aa  163  6e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  28.48 
 
 
459 aa  163  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  28.24 
 
 
407 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  29.26 
 
 
401 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1471  hypothetical protein  27.61 
 
 
538 aa  162  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  27.52 
 
 
414 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.49 
 
 
430 aa  162  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  36.2 
 
 
705 aa  162  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  27.31 
 
 
414 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  27.31 
 
 
414 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  29.07 
 
 
430 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2278  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.48 
 
 
395 aa  159  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345323  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  27.88 
 
 
406 aa  159  9e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  29.18 
 
 
407 aa  158  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>