More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0145 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0145  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 431 aa  824    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  42.23 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  40.64 
 
 		 394 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.55 
 
 		 462 aa  242  7.999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  39.12 
 
 		 408 aa  239  9e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.91 
 
 		 397 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  40.65 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  33.12 
 
 		 463 aa  226  7e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  35.12 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.04 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  33.72 
 
 		 417 aa  219  8.999999999999998e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.93 
 
 		 415 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  33.84 
 
 		 440 aa  209  6e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  32.1 
 
 		 442 aa  208  2e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  29.92 
 
 		 475 aa  201  3e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  35.51 
 
 		 399 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  34.13 
 
 		 442 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  33.94 
 
 		 407 aa  193  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.65 
 
 		 423 aa  191  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  33.12 
 
 		 451 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  32.31 
 
 		 440 aa  190  4e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  35.87 
 
 		 405 aa  190  4e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  33.77 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  34.68 
 
 		 405 aa  187  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  34.19 
 
 		 401 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  34.92 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  34.92 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  34.92 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  34.92 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  34.92 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  34.92 
 
 		 413 aa  186  7e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  32.81 
 
 		 407 aa  186  9e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  32.81 
 
 		 407 aa  186  9e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  34.92 
 
 		 413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  35.84 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  35.65 
 
 		 413 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.36 
 
 		 426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  34.51 
 
 		 410 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  35.04 
 
 		 425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  36.14 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  36.14 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  34.09 
 
 		 405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  36.14 
 
 		 413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  36.14 
 
 		 413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  36.14 
 
 		 413 aa  183  6e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  35.67 
 
 		 404 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  36.14 
 
 		 414 aa  183  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  28.28 
 
 		 479 aa  182  1e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  35.33 
 
 		 414 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  33.61 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  34.55 
 
 		 413 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  33.55 
 
 		 441 aa  180  4e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  33.94 
 
 		 402 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  33.94 
 
 		 402 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.67 
 
 		 454 aa  179  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  33.41 
 
 		 425 aa  178  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  32.58 
 
 		 406 aa  179  1e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.91 
 
 		 413 aa  177  3e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  32.25 
 
 		 442 aa  177  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 		 401 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  32.65 
 
 		 462 aa  176  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  32.29 
 
 		 404 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  35.65 
 
 		 425 aa  176  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1366  flagellar hook protein FlgE  28.78 
 
 		 467 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0579567  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  35 
 
 		 413 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4124  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.29 
 
 		 426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.85 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  31.96 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  31.96 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  31.96 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  34.09 
 
 		 405 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  33.63 
 
 		 407 aa  174  3.9999999999999995e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1568  flagellar hook protein FlgE  30.07 
 
 		 437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.874042  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1686  flagellar hook protein FlgE  30.07 
 
 		 437 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  34.68 
 
 		 413 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1541  flagellar hook protein FlgE  30.89 
 
 		 437 aa  173  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1570  flagellar hook protein FlgE  31.29 
 
 		 407 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.370708  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.82 
 
 		 428 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 410 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1530  flagellar hook protein FlgE  29.46 
 
 		 437 aa  172  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3626  flagellar hook protein FlgE  31.07 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1720  flagellar hook protein FlgE  31.07 
 
 		 407 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  32.36 
 
 		 408 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1751  flagellar hook protein FlgE  29.46 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  32.74 
 
 		 413 aa  168  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  31.32 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  31.32 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  34.39 
 
 		 399 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  33.71 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  30.08 
 
 		 437 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.71 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  33.11 
 
 		 403 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.55 
 
 		 435 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  33.11 
 
 		 403 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  33.11 
 
 		 403 aa  167  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  33.11 
 
 		 403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  33.11 
 
 		 403 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  31.61 
 
 		 401 aa  166  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  31.08 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  31.69 
 
 		 402 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>