More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_31140 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 394 aa  771    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  69.02 
 
 		 397 aa  503  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  57.18 
 
 		 390 aa  426  1e-118  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  55.09 
 
 		 398 aa  403  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  53.11 
 
 		 408 aa  381  1e-105  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  44.89 
 
 		 417 aa  336  5e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.52 
 
 		 462 aa  329  5.0000000000000004e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  43.41 
 
 		 440 aa  295  8e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  40.54 
 
 		 441 aa  283  3.0000000000000004e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.25 
 
 		 454 aa  281  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  39.24 
 
 		 442 aa  279  5e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.24 
 
 		 415 aa  266  5e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  34.53 
 
 		 475 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  36.02 
 
 		 463 aa  254  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  41.3 
 
 		 409 aa  252  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4124  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.3 
 
 		 426 aa  246  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0145  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.87 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  39.29 
 
 		 399 aa  226  6e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  33.57 
 
 		 419 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37 
 
 		 428 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  35.61 
 
 		 413 aa  216  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  32.87 
 
 		 419 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  36.21 
 
 		 401 aa  209  5e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  35.85 
 
 		 403 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  35.85 
 
 		 403 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  35.73 
 
 		 407 aa  209  6e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  36.6 
 
 		 401 aa  209  8e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  36.6 
 
 		 401 aa  209  8e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  35.65 
 
 		 410 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  36.21 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  34.99 
 
 		 404 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  35.61 
 
 		 403 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  35.61 
 
 		 403 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  35.61 
 
 		 403 aa  206  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  34.8 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  35.55 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  35.55 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  36.32 
 
 		 405 aa  203  3e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  35.7 
 
 		 402 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  36.53 
 
 		 407 aa  202  9e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  35.95 
 
 		 404 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  35.56 
 
 		 402 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  33.86 
 
 		 425 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 407 aa  201  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 407 aa  201  3e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  33.77 
 
 		 451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  34.35 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  34.75 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  33.72 
 
 		 413 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  35.38 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.2 
 
 		 413 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  35.68 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  33.1 
 
 		 410 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  35.53 
 
 		 414 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  34.65 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  34.52 
 
 		 405 aa  194  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  35.29 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  35.29 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  34.17 
 
 		 414 aa  194  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  36.03 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  34.42 
 
 		 413 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  34.42 
 
 		 413 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  34.61 
 
 		 433 aa  193  4e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.33 
 
 		 423 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  33.41 
 
 		 408 aa  192  6e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  33.49 
 
 		 413 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  34.5 
 
 		 413 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  34.5 
 
 		 413 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  34.5 
 
 		 413 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  34.5 
 
 		 413 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  34.5 
 
 		 413 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  34.5 
 
 		 413 aa  191  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  34.72 
 
 		 413 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  36.56 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  33.41 
 
 		 387 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  35.21 
 
 		 413 aa  189  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  32.2 
 
 		 428 aa  189  9e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  32.2 
 
 		 428 aa  189  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1570  flagellar hook protein FlgE  33.01 
 
 		 407 aa  189  9e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.370708  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  32.2 
 
 		 428 aa  189  9e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  35.27 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  35.27 
 
 		 402 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  33.41 
 
 		 442 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  33.41 
 
 		 440 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  35.19 
 
 		 401 aa  187  4e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  33.41 
 
 		 418 aa  187  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  33.57 
 
 		 408 aa  186  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  34.79 
 
 		 402 aa  185  9e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3626  flagellar hook protein FlgE  32.53 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0031  hypothetical protein  29.77 
 
 		 430 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1720  flagellar hook protein FlgE  32.53 
 
 		 407 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.04 
 
 		 501 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  35.49 
 
 		 406 aa  184  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2278  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.66 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.345323  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1829  flagellar hook protein FlgE  32.37 
 
 		 407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.162311  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1773  flagellar hook protein FlgE  32.45 
 
 		 407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  34.1 
 
 		 420 aa  182  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  33.99 
 
 		 442 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  34.38 
 
 		 399 aa  182  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>