More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2195 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  88.34 
 
 		 401 aa  707    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  88.12 
 
 		 402 aa  704    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 403 aa  805    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  98.26 
 
 		 403 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  84.28 
 
 		 404 aa  671    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  87.84 
 
 		 401 aa  701    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  88.34 
 
 		 401 aa  707    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  98.26 
 
 		 403 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  87.87 
 
 		 402 aa  701    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 403 aa  805    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  88.09 
 
 		 401 aa  701    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  87.87 
 
 		 402 aa  702    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 403 aa  805    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  87.87 
 
 		 402 aa  701    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  60.05 
 
 		 428 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  60.05 
 
 		 428 aa  495  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  60.05 
 
 		 428 aa  495  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  65.53 
 
 		 407 aa  496  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  59.51 
 
 		 405 aa  465  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  58.56 
 
 		 399 aa  456  1e-127  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  59.66 
 
 		 405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  58.44 
 
 		 405 aa  449  1e-125  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01080  hypothetical protein  91.28 
 
 		 219 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  48.66 
 
 		 404 aa  352  5.9999999999999994e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  46.46 
 
 		 415 aa  323  3e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  45.28 
 
 		 417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  46.27 
 
 		 383 aa  316  6e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  46.1 
 
 		 405 aa  312  4.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  43.68 
 
 		 423 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  42.41 
 
 		 401 aa  288  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  43.57 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  42.39 
 
 		 410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  42.17 
 
 		 410 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  41 
 
 		 420 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  43.16 
 
 		 413 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  41.71 
 
 		 414 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  42.22 
 
 		 413 aa  280  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  42.69 
 
 		 413 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  42.69 
 
 		 413 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  42.69 
 
 		 413 aa  280  5e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  42.45 
 
 		 413 aa  279  6e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  42.17 
 
 		 425 aa  279  7e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  44.31 
 
 		 406 aa  279  8e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  42.22 
 
 		 387 aa  278  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  41.24 
 
 		 426 aa  277  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  44.1 
 
 		 402 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  44.1 
 
 		 402 aa  276  3e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  41.47 
 
 		 413 aa  276  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  42.26 
 
 		 442 aa  275  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  41.92 
 
 		 414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  41.92 
 
 		 414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  41.92 
 
 		 414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  41.63 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  41.63 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  41.63 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  41.63 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  41.63 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  41.63 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  41.63 
 
 		 413 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  40.28 
 
 		 414 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  39.33 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  37.53 
 
 		 408 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  39.06 
 
 		 440 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  40.24 
 
 		 399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  39.91 
 
 		 441 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  41.27 
 
 		 404 aa  249  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.13 
 
 		 435 aa  247  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  40.05 
 
 		 402 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  38.07 
 
 		 408 aa  246  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.62 
 
 		 430 aa  245  9e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  38.43 
 
 		 440 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  39.04 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  39.04 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  40.63 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  38.73 
 
 		 425 aa  239  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  39.34 
 
 		 413 aa  239  5e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  38.82 
 
 		 402 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  35.15 
 
 		 450 aa  239  8e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  35.61 
 
 		 462 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  39.01 
 
 		 400 aa  238  2e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  37.25 
 
 		 438 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  36.62 
 
 		 451 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.77 
 
 		 400 aa  236  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  39.08 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  35.39 
 
 		 462 aa  236  8e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  39.31 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  38.57 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  38.77 
 
 		 395 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  37.41 
 
 		 407 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  37.93 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.87 
 
 		 395 aa  233  6e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  39.26 
 
 		 395 aa  232  9e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.96 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0240  flagellar hook protein FlgE  37.28 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0187  flagellar hook protein flgE  37.97 
 
 		 395 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.327871  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  37.26 
 
 		 418 aa  226  4e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  34.21 
 
 		 455 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.98 
 
 		 413 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.02 
 
 		 428 aa  209  5e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.02 
 
 		 428 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>