More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0110 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
425 aa  815    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  33.97 
 
 
454 aa  224  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2310  flagellar basal body FlaE domain protein  35.07 
 
 
456 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0296188  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.68 
 
 
456 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0889  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.23 
 
 
460 aa  201  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.466386  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0950  hypothetical protein  33.82 
 
 
460 aa  192  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0412167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.82 
 
 
460 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  34.03 
 
 
461 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  33.63 
 
 
421 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5543  hypothetical protein  33.2 
 
 
461 aa  189  8e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194556  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  33.18 
 
 
421 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 
419 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  32.33 
 
 
446 aa  179  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  34.18 
 
 
413 aa  172  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0145  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.87 
 
 
431 aa  172  1e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  32.69 
 
 
430 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  32.69 
 
 
430 aa  170  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.31 
 
 
428 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  30.2 
 
 
464 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7242  putative flagellar hook protein FlgE  31.7 
 
 
466 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 
413 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 
413 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 
413 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 
413 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 
413 aa  168  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 
413 aa  168  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  31.25 
 
 
426 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  33.03 
 
 
413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.31 
 
 
428 aa  167  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  32.81 
 
 
402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  32.49 
 
 
412 aa  166  8e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  32.36 
 
 
414 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  32.03 
 
 
396 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  30.08 
 
 
433 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  31.83 
 
 
403 aa  160  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  31.95 
 
 
413 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  32.03 
 
 
413 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  29.87 
 
 
428 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  32.64 
 
 
414 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  32.64 
 
 
414 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  31.38 
 
 
403 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  32.8 
 
 
413 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  29.15 
 
 
434 aa  158  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  32.8 
 
 
413 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  32.64 
 
 
414 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  32.8 
 
 
413 aa  158  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  30.3 
 
 
432 aa  156  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  31.21 
 
 
407 aa  156  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  31.21 
 
 
407 aa  156  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  30.48 
 
 
402 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.09 
 
 
525 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  28.06 
 
 
452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  32.49 
 
 
414 aa  153  5e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  31.95 
 
 
413 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2736  hypothetical protein  29.46 
 
 
474 aa  152  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  29.85 
 
 
422 aa  152  8.999999999999999e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  31.24 
 
 
398 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  31.29 
 
 
410 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  31.34 
 
 
377 aa  150  6e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  30.11 
 
 
410 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  32.31 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3444  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.59 
 
 
569 aa  148  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  30.73 
 
 
417 aa  147  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  28.67 
 
 
394 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.67 
 
 
426 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  27.46 
 
 
404 aa  147  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  31.61 
 
 
419 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  29.21 
 
 
407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  28.67 
 
 
441 aa  147  4.0000000000000006e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  30.41 
 
 
401 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  30.53 
 
 
433 aa  145  1e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  28.31 
 
 
425 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  29.87 
 
 
442 aa  144  2e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  28.6 
 
 
417 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  27.66 
 
 
422 aa  144  4e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  29.79 
 
 
405 aa  143  5e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  30.49 
 
 
415 aa  143  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  31.72 
 
 
419 aa  142  8e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  29.24 
 
 
413 aa  142  8e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  30.59 
 
 
404 aa  142  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  29.19 
 
 
418 aa  143  8e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  29.11 
 
 
463 aa  142  9.999999999999999e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  30.7 
 
 
400 aa  142  9.999999999999999e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  29.7 
 
 
440 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2532  flagellar hook protein FlgE  31.25 
 
 
460 aa  140  3e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.91 
 
 
390 aa  140  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.22 
 
 
415 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  31.29 
 
 
408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1789  flagellar hook protein FlgE  29.4 
 
 
434 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  30.66 
 
 
402 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  30.66 
 
 
402 aa  140  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.23 
 
 
400 aa  140  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  29.87 
 
 
437 aa  139  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  30.36 
 
 
414 aa  139  1e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.49 
 
 
413 aa  139  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26 
 
 
488 aa  138  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  32.1 
 
 
399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  29.45 
 
 
404 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  29.36 
 
 
406 aa  137  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  28.32 
 
 
440 aa  137  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>