More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1618 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 525 aa  1037    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.52 
 
 		 545 aa  425  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  43.49 
 
 		 564 aa  420  1e-116  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1711  flagellar hook protein FlgE  42.91 
 
 		 527 aa  390  1e-107  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.185044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.75 
 
 		 562 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  37.85 
 
 		 513 aa  348  1e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0298  flagella basal body rod domain-containing protein  39.36 
 
 		 501 aa  332  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  38.21 
 
 		 501 aa  330  4e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  40.15 
 
 		 498 aa  329  1.0000000000000001e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2091  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.82 
 
 		 499 aa  277  3e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0508836  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  39.5 
 
 		 808 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  34.12 
 
 		 496 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  32.12 
 
 		 440 aa  203  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  33.79 
 
 		 442 aa  200  6e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  29.69 
 
 		 462 aa  200  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  31.3 
 
 		 442 aa  195  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  29.59 
 
 		 451 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  30.25 
 
 		 420 aa  190  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  28.92 
 
 		 425 aa  190  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  29.52 
 
 		 458 aa  189  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  31.84 
 
 		 417 aa  189  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  33.27 
 
 		 441 aa  187  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.88 
 
 		 488 aa  187  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  28.35 
 
 		 462 aa  187  5e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  29.5 
 
 		 463 aa  186  7e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3103  flagellar basal body FlaE domain protein  30.36 
 
 		 531 aa  186  7e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178988  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.69 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  30.87 
 
 		 461 aa  184  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  29.25 
 
 		 440 aa  184  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  28.79 
 
 		 410 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  31.61 
 
 		 453 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  29.87 
 
 		 443 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  28.33 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  31.35 
 
 		 453 aa  181  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1471  hypothetical protein  29.2 
 
 		 538 aa  179  1e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.17 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  29.98 
 
 		 404 aa  177  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  30.81 
 
 		 414 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  28.12 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  30.56 
 
 		 407 aa  174  2.9999999999999996e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  30.5 
 
 		 425 aa  173  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  28.44 
 
 		 450 aa  171  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  29.17 
 
 		 428 aa  171  4e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  29.17 
 
 		 428 aa  171  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  29.17 
 
 		 428 aa  171  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  30.06 
 
 		 406 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  38.1 
 
 		 419 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  28.63 
 
 		 414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  28.63 
 
 		 414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  28.63 
 
 		 414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  29.43 
 
 		 413 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  29.37 
 
 		 455 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  28.85 
 
 		 418 aa  159  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  35.71 
 
 		 419 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  28.4 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  29.21 
 
 		 438 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  28.11 
 
 		 437 aa  155  2e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  40.24 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01289  flagellar hook protein FlgE  28.33 
 
 		 437 aa  153  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  34.55 
 
 		 413 aa  153  8.999999999999999e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1789  flagellar hook protein FlgE  28.49 
 
 		 434 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  27.59 
 
 		 479 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  29.17 
 
 		 405 aa  150  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  27.37 
 
 		 425 aa  150  7e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  34.33 
 
 		 413 aa  142  9.999999999999999e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  52.23 
 
 		 814 aa  139  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  48.48 
 
 		 819 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2532  flagellar hook protein FlgE  29.13 
 
 		 460 aa  134  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  28.89 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  27.07 
 
 		 423 aa  131  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  29.96 
 
 		 430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0107  flagellar hook protein FlgE  32.29 
 
 		 814 aa  130  7.000000000000001e-29  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000370744  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4674  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  25.93 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00485317 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  37.78 
 
 		 408 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2049  hypothetical protein  29.56 
 
 		 533 aa  128  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.2 
 
 		 636 aa  127  3e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  48.18 
 
 		 399 aa  127  5e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  32.17 
 
 		 911 aa  125  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.33 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.33 
 
 		 428 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  32.64 
 
 		 408 aa  125  3e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  49.64 
 
 		 851 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2736  hypothetical protein  28.15 
 
 		 474 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  27.41 
 
 		 407 aa  121  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1105  hypothetical protein  30.77 
 
 		 637 aa  120  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  27.36 
 
 		 845 aa  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.71 
 
 		 454 aa  117  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  48.06 
 
 		 405 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  31.33 
 
 		 428 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  34.08 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  47.29 
 
 		 405 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  45.04 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  45.04 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3580  hypothetical protein  31.93 
 
 		 565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.304343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  44.27 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2731  hypothetical protein  40.26 
 
 		 501 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000961084 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  45.04 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  45.04 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  45.04 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  45.04 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>