More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0279 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
422 aa  838    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  50.57 
 
 
432 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  52.4 
 
 
433 aa  403  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  51.18 
 
 
426 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  49.77 
 
 
430 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  50.95 
 
 
396 aa  383  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  49.77 
 
 
430 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1111  flagellar hook protein FlgE  52 
 
 
411 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397372  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  48.48 
 
 
402 aa  372  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  49.53 
 
 
377 aa  363  4e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  47.16 
 
 
415 aa  354  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  47.41 
 
 
402 aa  350  3e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  47.41 
 
 
403 aa  341  1e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  44.03 
 
 
418 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  46.46 
 
 
403 aa  335  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  46.21 
 
 
414 aa  333  3e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  45.99 
 
 
407 aa  320  3e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  44.13 
 
 
407 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  42.49 
 
 
411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  38.23 
 
 
404 aa  233  3e-60  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  34.02 
 
 
420 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  32.43 
 
 
422 aa  187  3e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  33.64 
 
 
413 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  33.25 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  33.04 
 
 
452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  33.9 
 
 
400 aa  180  4e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 
434 aa  180  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.9 
 
 
400 aa  179  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  32.51 
 
 
421 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.98 
 
 
426 aa  172  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.01 
 
 
395 aa  171  3e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  33.86 
 
 
421 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  30.39 
 
 
408 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  34.17 
 
 
419 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  33.41 
 
 
419 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  31 
 
 
405 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  33.72 
 
 
425 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  30.07 
 
 
405 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  29.87 
 
 
446 aa  164  4.0000000000000004e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  31.67 
 
 
425 aa  163  5.0000000000000005e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  32.61 
 
 
399 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  31.29 
 
 
407 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  31.89 
 
 
398 aa  162  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  32.31 
 
 
405 aa  160  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  30.55 
 
 
401 aa  160  5e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  32.64 
 
 
417 aa  159  7e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2736  hypothetical protein  29.86 
 
 
474 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  30.12 
 
 
401 aa  159  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1303  putative flagellar hook protein  29.5 
 
 
465 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1716  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.14 
 
 
423 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.727886  normal  0.851107 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  32.74 
 
 
419 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  30.82 
 
 
408 aa  159  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2963  hypothetical protein  29.5 
 
 
465 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  31.72 
 
 
398 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0080  flagellar hook protein FlgE  30.14 
 
 
423 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  31.18 
 
 
398 aa  158  2e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  32.49 
 
 
408 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  30.59 
 
 
413 aa  156  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  29.91 
 
 
403 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  29.91 
 
 
403 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.56 
 
 
415 aa  156  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  29.23 
 
 
403 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  29.23 
 
 
403 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  29.23 
 
 
403 aa  155  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.19 
 
 
423 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  29.65 
 
 
401 aa  154  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  31.6 
 
 
413 aa  155  2e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  31.75 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.41 
 
 
435 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  33.1 
 
 
383 aa  154  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  31.36 
 
 
433 aa  154  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  30.24 
 
 
401 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  32.17 
 
 
405 aa  152  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2532  flagellar hook protein FlgE  31.91 
 
 
460 aa  152  8e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.37 
 
 
428 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  30.16 
 
 
413 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.37 
 
 
428 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  29.83 
 
 
461 aa  152  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  29.41 
 
 
401 aa  151  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  29.58 
 
 
402 aa  151  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  29.41 
 
 
401 aa  151  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  29.58 
 
 
402 aa  151  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  27.61 
 
 
418 aa  150  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  29.82 
 
 
417 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  29.56 
 
 
413 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  29.56 
 
 
413 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.45 
 
 
430 aa  149  9e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  29.1 
 
 
413 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  29.13 
 
 
402 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  29.87 
 
 
438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  31.05 
 
 
454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  28.8 
 
 
428 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  30.93 
 
 
412 aa  147  3e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  28.8 
 
 
428 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  28.8 
 
 
428 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  29.6 
 
 
410 aa  147  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  27.21 
 
 
440 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  30.72 
 
 
407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  30.22 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  30.72 
 
 
407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>