More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1303 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1303  putative flagellar hook protein  100 
 
 		 465 aa  927    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2736  hypothetical protein  78.27 
 
 		 474 aa  739    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2963  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  927    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  58.23 
 
 		 446 aa  499  1e-140  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  54.41 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  53.86 
 
 		 452 aa  467  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  47.31 
 
 		 422 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  32.86 
 
 		 461 aa  196  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  29.5 
 
 		 422 aa  159  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  30.36 
 
 		 403 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  29.81 
 
 		 402 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  29.46 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  30.02 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  28.39 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  30.26 
 
 		 421 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  28.78 
 
 		 426 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  28.6 
 
 		 415 aa  141  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  29.61 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.45 
 
 		 415 aa  137  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  29.71 
 
 		 414 aa  136  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  29.09 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  29.72 
 
 		 419 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  27.12 
 
 		 377 aa  132  9e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  29.86 
 
 		 462 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  29.03 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  29.26 
 
 		 407 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  27.98 
 
 		 430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  26.52 
 
 		 475 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  28.82 
 
 		 425 aa  130  6e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  29.69 
 
 		 462 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  28.27 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1111  flagellar hook protein FlgE  28.94 
 
 		 411 aa  128  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397372  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.01 
 
 		 428 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2532  flagellar hook protein FlgE  29.3 
 
 		 460 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  26.95 
 
 		 425 aa  124  4e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  28.18 
 
 		 441 aa  124  4e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  27.33 
 
 		 479 aa  124  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.8 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  27.45 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  28.29 
 
 		 402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  28.12 
 
 		 420 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  28.27 
 
 		 407 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  27.87 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  27.87 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  29.18 
 
 		 405 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  26.18 
 
 		 458 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  25.88 
 
 		 442 aa  120  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  27.86 
 
 		 402 aa  119  7.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  29.42 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  28.05 
 
 		 408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  26.86 
 
 		 398 aa  117  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  26.84 
 
 		 425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  27.16 
 
 		 404 aa  116  8.999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  27 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  29.22 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  28.31 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  28.31 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  26.95 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  26.89 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  29.22 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  28.31 
 
 		 453 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1010  hypothetical protein  38.81 
 
 		 556 aa  114  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0819939  normal  0.629928 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  28.21 
 
 		 404 aa  114  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  27.31 
 
 		 450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  28.69 
 
 		 401 aa  114  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  25.56 
 
 		 461 aa  114  5e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  27.39 
 
 		 410 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  26.68 
 
 		 462 aa  113  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  24.96 
 
 		 564 aa  113  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  29.25 
 
 		 438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  27.31 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  29.55 
 
 		 409 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  25.85 
 
 		 410 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  27.71 
 
 		 454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  27.43 
 
 		 400 aa  111  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  27.43 
 
 		 400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  36.24 
 
 		 419 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  27.39 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  27.39 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  28.63 
 
 		 460 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  27.39 
 
 		 403 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  27.31 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  28.21 
 
 		 406 aa  109  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  26.79 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0080  flagellar hook protein FlgE  25.21 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1716  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  25.21 
 
 		 423 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.727886  normal  0.851107 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  25.7 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  25.56 
 
 		 442 aa  107  5e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01289  flagellar hook protein FlgE  25.73 
 
 		 437 aa  107  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  28.54 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  26.56 
 
 		 398 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  28.22 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  26.91 
 
 		 394 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  26.09 
 
 		 399 aa  104  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0145  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.31 
 
 		 431 aa  105  3e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  25.31 
 
 		 437 aa  104  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  27.92 
 
 		 433 aa  104  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  27.19 
 
 		 405 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  26.98 
 
 		 454 aa  103  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  25.32 
 
 		 426 aa  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>