More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0764 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 418 aa  824    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  59.1 
 
 		 411 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  48.51 
 
 		 432 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  49.42 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  49.19 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  48.62 
 
 		 433 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  44.26 
 
 		 422 aa  351  1e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  45.26 
 
 		 407 aa  319  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  42.49 
 
 		 402 aa  313  4.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  44.6 
 
 		 414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  41.33 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  40.43 
 
 		 407 aa  302  7.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  41.33 
 
 		 403 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  41.71 
 
 		 415 aa  299  7e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1111  flagellar hook protein FlgE  44.18 
 
 		 411 aa  295  1e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397372  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  41.19 
 
 		 403 aa  293  3e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  41.67 
 
 		 426 aa  280  3e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  40 
 
 		 396 aa  269  8e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  38.57 
 
 		 377 aa  250  4e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  33.26 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  32.71 
 
 		 413 aa  202  9e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  34.7 
 
 		 399 aa  199  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  33.11 
 
 		 422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  33.65 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  33.17 
 
 		 405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  34.62 
 
 		 400 aa  192  8e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.38 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  31.89 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 419 aa  188  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.34 
 
 		 428 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.11 
 
 		 428 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  33.79 
 
 		 419 aa  186  8e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  35.52 
 
 		 421 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  32.61 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  32.61 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  32.37 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  33.01 
 
 		 401 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  32.37 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  32.37 
 
 		 403 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  34.78 
 
 		 412 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  32.78 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  32.78 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  29.69 
 
 		 446 aa  180  4e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  31.13 
 
 		 434 aa  179  5.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  32.57 
 
 		 428 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  30.72 
 
 		 452 aa  178  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  32.54 
 
 		 402 aa  178  2e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  31.74 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  31.74 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  31.74 
 
 		 428 aa  178  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  32.05 
 
 		 401 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  32.45 
 
 		 402 aa  177  4e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  32.05 
 
 		 401 aa  176  6e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  32.05 
 
 		 401 aa  176  6e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  32.24 
 
 		 405 aa  176  9.999999999999999e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  32.4 
 
 		 407 aa  175  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  35.48 
 
 		 419 aa  173  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  31.9 
 
 		 417 aa  172  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  31.33 
 
 		 404 aa  171  2e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  30.82 
 
 		 408 aa  169  8e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.84 
 
 		 418 aa  169  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  33.94 
 
 		 421 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  31.78 
 
 		 405 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.12 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  30.7 
 
 		 413 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  30.29 
 
 		 433 aa  166  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.33 
 
 		 395 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  31.12 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  31.82 
 
 		 399 aa  165  2.0000000000000002e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  30.39 
 
 		 394 aa  162  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  30.36 
 
 		 387 aa  162  8.000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  29.79 
 
 		 410 aa  162  9e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  30.52 
 
 		 408 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.68 
 
 		 423 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.83 
 
 		 488 aa  161  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  31.4 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  31.65 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  32.33 
 
 		 459 aa  161  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  31.95 
 
 		 440 aa  161  2e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  31.49 
 
 		 408 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  30.11 
 
 		 453 aa  159  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  31.71 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  29.18 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  27.59 
 
 		 442 aa  159  1e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  30.11 
 
 		 453 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  30.11 
 
 		 453 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  30.02 
 
 		 425 aa  157  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  30.11 
 
 		 453 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  31.66 
 
 		 453 aa  157  3e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  30.84 
 
 		 398 aa  157  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  28.87 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  30.11 
 
 		 453 aa  157  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  28.87 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  28.94 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  28.87 
 
 		 413 aa  157  4e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  30.07 
 
 		 453 aa  157  4e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  31.52 
 
 		 453 aa  157  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  30.36 
 
 		 398 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  30.49 
 
 		 460 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>