More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1164 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  78.65 
 
 		 453 aa  726    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  79.3 
 
 		 453 aa  709    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  79.3 
 
 		 453 aa  709    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  79.52 
 
 		 453 aa  707    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  77.8 
 
 		 460 aa  716    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  80.39 
 
 		 453 aa  736    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  78.65 
 
 		 453 aa  706    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  79.3 
 
 		 453 aa  709    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  82 
 
 		 455 aa  722    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  76.25 
 
 		 454 aa  700    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  80.39 
 
 		 453 aa  705    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  80.61 
 
 		 453 aa  709    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 459 aa  910    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  78.65 
 
 		 453 aa  704    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  80.39 
 
 		 453 aa  717    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  78.65 
 
 		 453 aa  689    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  55.25 
 
 		 461 aa  481  1e-134  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  54.32 
 
 		 458 aa  456  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2335  flagellar hook protein FlgE  50.43 
 
 		 432 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  47.22 
 
 		 437 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  46.3 
 
 		 425 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01289  flagellar hook protein FlgE  46.7 
 
 		 437 aa  366  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1789  flagellar hook protein FlgE  46.85 
 
 		 434 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  42.8 
 
 		 418 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  40.04 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  38.83 
 
 		 408 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1480  flagellar hook protein FlgE  58.02 
 
 		 554 aa  282  9e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  38.62 
 
 		 438 aa  281  3e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0080  flagellar hook protein FlgE  38.05 
 
 		 423 aa  280  5e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1716  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.05 
 
 		 423 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.727886  normal  0.851107 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  39.26 
 
 		 407 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  39.26 
 
 		 407 aa  273  5.000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  38.88 
 
 		 408 aa  269  8.999999999999999e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  40.17 
 
 		 451 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  37.81 
 
 		 462 aa  268  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  37.18 
 
 		 462 aa  266  4e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  37.91 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  37.61 
 
 		 407 aa  265  2e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  40.09 
 
 		 442 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  40.56 
 
 		 440 aa  262  8e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  39.57 
 
 		 441 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.9 
 
 		 418 aa  259  9e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  36.72 
 
 		 420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  36.06 
 
 		 442 aa  253  5.000000000000001e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  35.51 
 
 		 401 aa  253  6e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  37.74 
 
 		 443 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.22 
 
 		 430 aa  252  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1669  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37 
 
 		 423 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456133  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  39.48 
 
 		 440 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.55 
 
 		 395 aa  249  1e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  35.22 
 
 		 402 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  35.22 
 
 		 402 aa  246  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  36.01 
 
 		 413 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  35.79 
 
 		 413 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  35.79 
 
 		 413 aa  242  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  33.84 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  36.23 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  36.24 
 
 		 413 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  35.83 
 
 		 450 aa  240  5e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  34.42 
 
 		 410 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  36.85 
 
 		 414 aa  239  8e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  36.53 
 
 		 437 aa  238  1e-61  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  35.93 
 
 		 413 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  36.01 
 
 		 413 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.38 
 
 		 423 aa  236  6e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  35.22 
 
 		 414 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  35.22 
 
 		 414 aa  236  6e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  35.22 
 
 		 414 aa  236  7e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  36.33 
 
 		 437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  34.78 
 
 		 414 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  35.08 
 
 		 413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  35.08 
 
 		 413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  35.08 
 
 		 413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  35.08 
 
 		 413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  35.08 
 
 		 413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  36.58 
 
 		 406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  35.08 
 
 		 413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  35.08 
 
 		 413 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  35.51 
 
 		 399 aa  232  9e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  36.66 
 
 		 398 aa  230  5e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  34.78 
 
 		 402 aa  229  7e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  35.29 
 
 		 402 aa  228  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  34.86 
 
 		 398 aa  226  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  34.64 
 
 		 410 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  34.64 
 
 		 398 aa  225  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  34.05 
 
 		 425 aa  223  7e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  36.64 
 
 		 413 aa  221  1.9999999999999999e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.76 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  34.35 
 
 		 402 aa  220  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  35.29 
 
 		 395 aa  217  4e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  33.91 
 
 		 387 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  33.69 
 
 		 404 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  34.85 
 
 		 404 aa  208  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  34.69 
 
 		 401 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  32.33 
 
 		 402 aa  206  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  32.33 
 
 		 402 aa  206  9e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  32.33 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  33.62 
 
 		 401 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  33.62 
 
 		 401 aa  205  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  33.62 
 
 		 401 aa  205  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>