More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3557 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 415 aa  806    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  62.89 
 
 		 414 aa  472  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1111  flagellar hook protein FlgE  52.02 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397372  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  47.16 
 
 		 422 aa  363  4e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  49.54 
 
 		 430 aa  355  7.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  49.54 
 
 		 430 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  46.54 
 
 		 432 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  44.87 
 
 		 426 aa  326  6e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  46.9 
 
 		 407 aa  324  2e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  46.1 
 
 		 433 aa  319  7e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  44.12 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  45.28 
 
 		 411 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  45.58 
 
 		 407 aa  305  7e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  45.31 
 
 		 402 aa  305  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  42.21 
 
 		 377 aa  290  3e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  41.47 
 
 		 418 aa  290  4e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  41.9 
 
 		 402 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  41.43 
 
 		 403 aa  278  1e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  41.43 
 
 		 403 aa  277  3e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  38.32 
 
 		 419 aa  212  1e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  36.6 
 
 		 419 aa  209  6e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  36.68 
 
 		 413 aa  206  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  36.23 
 
 		 399 aa  203  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  32.32 
 
 		 404 aa  199  9e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  36.34 
 
 		 421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.49 
 
 		 428 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  35.55 
 
 		 421 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.72 
 
 		 413 aa  181  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.26 
 
 		 428 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  31.31 
 
 		 422 aa  180  4e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34 
 
 		 395 aa  178  2e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  32.51 
 
 		 400 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  36.99 
 
 		 412 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  31.8 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.84 
 
 		 400 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  33.19 
 
 		 461 aa  174  2.9999999999999996e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  32.28 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  33.82 
 
 		 383 aa  174  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  32.61 
 
 		 446 aa  173  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  34.55 
 
 		 419 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  32.18 
 
 		 420 aa  170  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  33.41 
 
 		 406 aa  169  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  33.49 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  28.79 
 
 		 452 aa  169  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  33.81 
 
 		 405 aa  168  2e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  30.86 
 
 		 410 aa  167  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  31.57 
 
 		 434 aa  166  5e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  33.09 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  33.57 
 
 		 404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  33.96 
 
 		 413 aa  163  7e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  33.18 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  32.13 
 
 		 410 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  31.67 
 
 		 438 aa  160  4e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  34.03 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  34.03 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  34.03 
 
 		 413 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 413 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  32.04 
 
 		 405 aa  159  7e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  31.46 
 
 		 398 aa  159  7e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  32.78 
 
 		 408 aa  159  8e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  31.98 
 
 		 402 aa  159  9e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.33 
 
 		 423 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  31.92 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.05 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  31 
 
 		 413 aa  155  8e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2736  hypothetical protein  29.55 
 
 		 474 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  31.18 
 
 		 442 aa  155  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  32.22 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  32.94 
 
 		 398 aa  155  2e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  31.55 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  30.51 
 
 		 401 aa  153  5e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  30.51 
 
 		 401 aa  153  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  27.72 
 
 		 450 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.18 
 
 		 426 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  31.26 
 
 		 417 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  30.34 
 
 		 395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  32.31 
 
 		 407 aa  153  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  32.31 
 
 		 407 aa  153  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  32.72 
 
 		 425 aa  152  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  30.27 
 
 		 395 aa  152  1e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  30.7 
 
 		 401 aa  152  1e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  32.59 
 
 		 442 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  32.14 
 
 		 413 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  32.5 
 
 		 409 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  30.98 
 
 		 404 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  30.84 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1303  putative flagellar hook protein  29.54 
 
 		 465 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  31.1 
 
 		 401 aa  151  3e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2963  hypothetical protein  29.54 
 
 		 465 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.97 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  31.99 
 
 		 441 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  31.13 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  32.09 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  32.09 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  31.08 
 
 		 401 aa  150  6e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  33.96 
 
 		 414 aa  150  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  31.03 
 
 		 402 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  31.03 
 
 		 402 aa  149  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  32.09 
 
 		 414 aa  149  7e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0080  flagellar hook protein FlgE  30.79 
 
 		 423 aa  149  9e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>