More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4173 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  899    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  64.77 
 
 
434 aa  546  1e-154  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  53.23 
 
 
446 aa  476  1e-133  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1303  putative flagellar hook protein  53.86 
 
 
465 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2963  hypothetical protein  53.86 
 
 
465 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2736  hypothetical protein  52.42 
 
 
474 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  52.16 
 
 
422 aa  417  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  34.1 
 
 
461 aa  207  3e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  32.51 
 
 
402 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  31.38 
 
 
402 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  32.74 
 
 
403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  33.04 
 
 
422 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  32.66 
 
 
403 aa  181  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  32.36 
 
 
412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  30.72 
 
 
426 aa  173  5.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  31.13 
 
 
421 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  30.65 
 
 
396 aa  171  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  30.24 
 
 
430 aa  166  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  30.64 
 
 
433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  29.87 
 
 
430 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  33.48 
 
 
421 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  28.67 
 
 
415 aa  162  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  28.57 
 
 
414 aa  159  8e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  30.15 
 
 
418 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  32.75 
 
 
419 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  28.95 
 
 
432 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  29.53 
 
 
377 aa  156  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.95 
 
 
428 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.95 
 
 
428 aa  153  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1111  flagellar hook protein FlgE  30.58 
 
 
411 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397372  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  29.86 
 
 
407 aa  147  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  30.74 
 
 
428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  29.56 
 
 
407 aa  143  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  26.73 
 
 
425 aa  142  9e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  27.91 
 
 
442 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2532  flagellar hook protein FlgE  29.68 
 
 
460 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  30.11 
 
 
441 aa  140  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  28.81 
 
 
450 aa  140  6e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.67 
 
 
415 aa  139  1e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  29.16 
 
 
411 aa  137  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  29.3 
 
 
394 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  28.7 
 
 
419 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.45 
 
 
435 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  27.33 
 
 
404 aa  130  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  27.93 
 
 
420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  27.52 
 
 
460 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  28.34 
 
 
402 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  27.41 
 
 
425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  28.6 
 
 
413 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  28.82 
 
 
413 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  27.44 
 
 
458 aa  127  3e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  27.11 
 
 
398 aa  127  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  27.55 
 
 
419 aa  127  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  24.89 
 
 
410 aa  127  5e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  27.57 
 
 
400 aa  126  9e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  29.12 
 
 
413 aa  126  9e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  27.45 
 
 
426 aa  125  1e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.92 
 
 
395 aa  125  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  27.43 
 
 
425 aa  125  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  27.57 
 
 
400 aa  125  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  27.67 
 
 
433 aa  125  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  28.21 
 
 
399 aa  125  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  27.33 
 
 
418 aa  123  6e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  27.29 
 
 
402 aa  123  7e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  26.99 
 
 
461 aa  122  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.67 
 
 
423 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  27.53 
 
 
453 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  28.48 
 
 
413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  26.98 
 
 
454 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  27.56 
 
 
402 aa  121  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  27.73 
 
 
402 aa  121  3e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  27.73 
 
 
402 aa  121  3e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  27.9 
 
 
417 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  27.81 
 
 
413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  27.81 
 
 
413 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  27.15 
 
 
404 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  27.54 
 
 
428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  27.54 
 
 
428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  27.54 
 
 
428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  29.61 
 
 
409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  27.42 
 
 
403 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  27.5 
 
 
413 aa  120  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  27.42 
 
 
403 aa  120  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  26.87 
 
 
453 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.11 
 
 
397 aa  119  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  25.85 
 
 
442 aa  119  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  27.13 
 
 
398 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  27.42 
 
 
401 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  27.67 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  27.48 
 
 
408 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  27.33 
 
 
402 aa  118  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  27.45 
 
 
413 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  27.72 
 
 
404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.2 
 
 
462 aa  117  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  27.95 
 
 
401 aa  116  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  27.35 
 
 
413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  27.35 
 
 
413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  27.35 
 
 
413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  27.73 
 
 
401 aa  116  6.9999999999999995e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  27.35 
 
 
413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>