More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0276 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 402 aa  798    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  50.68 
 
 		 432 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  50.34 
 
 		 433 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  49.07 
 
 		 422 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  50.68 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  50.45 
 
 		 430 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1111  flagellar hook protein FlgE  53.38 
 
 		 411 aa  344  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397372  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  49.88 
 
 		 426 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  49.15 
 
 		 396 aa  341  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  49.28 
 
 		 403 aa  333  2e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  48.43 
 
 		 402 aa  328  8e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  48.55 
 
 		 403 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  47.2 
 
 		 377 aa  315  9.999999999999999e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  48.69 
 
 		 407 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  46.01 
 
 		 415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  45.08 
 
 		 407 aa  310  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  42.02 
 
 		 418 aa  298  1e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  46.48 
 
 		 414 aa  297  2e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  41.29 
 
 		 404 aa  246  4e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  39.53 
 
 		 411 aa  243  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  35.21 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  35.45 
 
 		 405 aa  196  7e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  33.25 
 
 		 422 aa  193  5e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.75 
 
 		 395 aa  192  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  35.61 
 
 		 399 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  35.04 
 
 		 394 aa  189  9e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  33.58 
 
 		 398 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  31.83 
 
 		 452 aa  186  9e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  32.33 
 
 		 420 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  35.58 
 
 		 397 aa  182  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  34.15 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  34.27 
 
 		 418 aa  180  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  33.83 
 
 		 399 aa  180  4.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  34.35 
 
 		 421 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  34.86 
 
 		 402 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  34.12 
 
 		 401 aa  176  7e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  34.86 
 
 		 402 aa  176  7e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  33.49 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  33.88 
 
 		 412 aa  176  9.999999999999999e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  33.49 
 
 		 402 aa  175  9.999999999999999e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  33.49 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  33.57 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  33.57 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  34.29 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  33.96 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  35.14 
 
 		 404 aa  173  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  33.57 
 
 		 401 aa  173  5e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  33.95 
 
 		 413 aa  173  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  33.26 
 
 		 419 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  33.25 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  34.22 
 
 		 402 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  31.97 
 
 		 461 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  33.02 
 
 		 402 aa  171  3e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.96 
 
 		 423 aa  171  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.32 
 
 		 400 aa  170  4e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  32.06 
 
 		 417 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  34.82 
 
 		 421 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  30.52 
 
 		 398 aa  168  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  32.79 
 
 		 419 aa  168  2e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  33.66 
 
 		 401 aa  168  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  34.07 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  32.45 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  32.45 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.62 
 
 		 426 aa  167  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  32.6 
 
 		 408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  29.22 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  32.94 
 
 		 403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  32.94 
 
 		 403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  33.01 
 
 		 405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  32.7 
 
 		 403 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  32.7 
 
 		 403 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  32.7 
 
 		 403 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  32.43 
 
 		 404 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  30.28 
 
 		 434 aa  160  3e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  33.41 
 
 		 408 aa  159  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  30.07 
 
 		 446 aa  159  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  33.41 
 
 		 413 aa  159  9e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2983  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.29 
 
 		 390 aa  157  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.10179 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  32.05 
 
 		 398 aa  157  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.42 
 
 		 454 aa  156  7e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.64 
 
 		 418 aa  155  9e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.88 
 
 		 413 aa  155  9e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  32.2 
 
 		 408 aa  155  9e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1303  putative flagellar hook protein  29.25 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2963  hypothetical protein  29.25 
 
 		 465 aa  155  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.35 
 
 		 415 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 407 aa  154  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  29.7 
 
 		 425 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  33.5 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  32.87 
 
 		 428 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  32.87 
 
 		 428 aa  153  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  32.87 
 
 		 428 aa  153  5e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  31.75 
 
 		 417 aa  153  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  32.08 
 
 		 419 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  30.86 
 
 		 402 aa  152  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  35 
 
 		 413 aa  152  8e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  31.58 
 
 		 387 aa  152  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.05 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.05 
 
 		 428 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  30.95 
 
 		 425 aa  151  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>