More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0871 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 419 aa  802    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  69.19 
 
 		 421 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  68.96 
 
 		 421 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  61.14 
 
 		 412 aa  443  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2532  flagellar hook protein FlgE  37.55 
 
 		 460 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  36.03 
 
 		 461 aa  215  9.999999999999999e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  35.63 
 
 		 430 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  34.26 
 
 		 402 aa  204  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  35.41 
 
 		 430 aa  203  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  35.71 
 
 		 418 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  33.78 
 
 		 425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  33.96 
 
 		 426 aa  197  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  34.82 
 
 		 396 aa  196  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3557  flagellar hook protein FlgE  35.23 
 
 		 415 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0694  flagellar hook protein FlgE  33.26 
 
 		 403 aa  194  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.124421  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  34.07 
 
 		 433 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0683  flagellar hook protein FlgE  33.72 
 
 		 403 aa  193  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.248006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4173  hypothetical protein  33.41 
 
 		 452 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  32.88 
 
 		 434 aa  189  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.03 
 
 		 428 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  35.03 
 
 		 432 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  33.86 
 
 		 422 aa  187  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.03 
 
 		 428 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0042  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 414 aa  179  8e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  33.02 
 
 		 402 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1044  flagellar hook protein FlgE  33.18 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  31.45 
 
 		 446 aa  175  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2736  hypothetical protein  31.85 
 
 		 474 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  34.01 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  34.14 
 
 		 433 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  32.12 
 
 		 428 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2310  flagellar basal body FlaE domain protein  32.7 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0296188  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2939  hypothetical protein  31.15 
 
 		 422 aa  171  3e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  32.03 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  32.03 
 
 		 413 aa  171  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1303  putative flagellar hook protein  31.89 
 
 		 465 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2963  hypothetical protein  31.89 
 
 		 465 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  31.8 
 
 		 413 aa  169  9e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  32.08 
 
 		 413 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1111  flagellar hook protein FlgE  33.49 
 
 		 411 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.397372  normal  0.647831 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  30.72 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  30.34 
 
 		 414 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0546  hypothetical protein  41.22 
 
 		 661 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  31.64 
 
 		 417 aa  164  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.7 
 
 		 456 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  33.25 
 
 		 399 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.07 
 
 		 413 aa  162  8.000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  31.26 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1707  flagellar hook protein FlgE  31.85 
 
 		 407 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.119812 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  31.04 
 
 		 401 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  31.55 
 
 		 410 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  31.34 
 
 		 413 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0950  hypothetical protein  31.2 
 
 		 460 aa  159  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0412167 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  30.57 
 
 		 401 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5543  hypothetical protein  32.99 
 
 		 461 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194556  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.4 
 
 		 460 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  31.24 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0889  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.66 
 
 		 460 aa  156  6e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.466386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  32.25 
 
 		 413 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  32.25 
 
 		 413 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  32.25 
 
 		 413 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  32.25 
 
 		 413 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  32.25 
 
 		 413 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  32.25 
 
 		 413 aa  156  8e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  32.25 
 
 		 413 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6506  flagellar hook protein FlgE  30.75 
 
 		 407 aa  155  9e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.145294  normal  0.0393248 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  29.95 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  29.95 
 
 		 401 aa  155  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  30.75 
 
 		 419 aa  154  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  33.56 
 
 		 409 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  29.65 
 
 		 405 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  31.19 
 
 		 400 aa  154  4e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  30.73 
 
 		 394 aa  153  7e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  30.96 
 
 		 425 aa  152  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  31.51 
 
 		 419 aa  152  8.999999999999999e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.19 
 
 		 400 aa  152  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  30.13 
 
 		 442 aa  152  1e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  30.21 
 
 		 454 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  32.33 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  29.89 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  29.33 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  29.33 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  30.02 
 
 		 402 aa  150  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  30.02 
 
 		 402 aa  150  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  29.79 
 
 		 415 aa  149  7e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  30.45 
 
 		 414 aa  149  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  31.57 
 
 		 398 aa  149  8e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  32.86 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.11 
 
 		 423 aa  148  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  30.75 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  29.41 
 
 		 402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  30.73 
 
 		 413 aa  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2431  hypothetical protein  31.78 
 
 		 442 aa  146  7.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.254601  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7242  putative flagellar hook protein FlgE  32.71 
 
 		 466 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  29.1 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  29.18 
 
 		 402 aa  145  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  29.51 
 
 		 387 aa  145  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0970  flagellar hook-basal body protein  32.35 
 
 		 408 aa  145  2e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.14 
 
 		 488 aa  145  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  27.11 
 
 		 441 aa  144  3e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>