More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2542 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2542  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  916    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.369818  normal  0.298513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4184  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  43.66 
 
 		 456 aa  349  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0889  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.92 
 
 		 460 aa  346  5e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.466386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2310  flagellar basal body FlaE domain protein  42.76 
 
 		 456 aa  343  4e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0296188  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0950  hypothetical protein  43.9 
 
 		 460 aa  326  6e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0412167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.9 
 
 		 460 aa  326  6e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.879826 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7242  putative flagellar hook protein FlgE  40.04 
 
 		 466 aa  309  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.988127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5543  hypothetical protein  39.57 
 
 		 461 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.194556  normal  0.0410767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2013  hypothetical protein  39.87 
 
 		 464 aa  302  1e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.918287 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1485  hypothetical protein  52.61 
 
 		 599 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1667  hypothetical protein  51.41 
 
 		 610 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.551124  normal  0.12233 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4455  protein of unknown function DUF1078 domain protein  50.6 
 
 		 598 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3817  hypothetical protein  53.11 
 
 		 598 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1099  flagellar basal body rod protein, FlaE  44.49 
 
 		 613 aa  233  6e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.216398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5537  putative flagellar hook protein flgE  46.28 
 
 		 601 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0639187 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1331  flagellar basal body FlaE  46.22 
 
 		 615 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0110  flagellar hook protein FlgE  32.91 
 
 		 425 aa  212  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5531  flagellar hook protein FlgE  30.96 
 
 		 430 aa  178  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0483375 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5251  flagellar hook protein FlgE  31.17 
 
 		 430 aa  176  9e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.698537 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.63 
 
 		 428 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  30.98 
 
 		 413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.63 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  31.53 
 
 		 419 aa  161  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  31.5 
 
 		 419 aa  160  6e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  31.7 
 
 		 428 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0765  flagellar hook protein FlgE  30.19 
 
 		 421 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  29.31 
 
 		 413 aa  154  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0712  flagellar hook protein FlgE  30.11 
 
 		 421 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0370  flagellar hook protein FlgE  29.17 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.578734  normal  0.846173 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  32.02 
 
 		 404 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  28.99 
 
 		 441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0279  flagellar hook protein FlgE  31.05 
 
 		 422 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1122  flagellar hook protein FlgE  29.39 
 
 		 404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  29.03 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  28.25 
 
 		 440 aa  144  4e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0338  flagellar hook protein FlgE  28.96 
 
 		 433 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.994654  normal  0.811098 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  28.78 
 
 		 417 aa  143  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2532  flagellar hook protein FlgE  30.66 
 
 		 460 aa  143  8e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0764  flagellar hook protein FlgE  29.87 
 
 		 418 aa  142  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0817021  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  28.57 
 
 		 475 aa  141  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4193  flagellar hook protein FlgE  29 
 
 		 426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  29.54 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.14 
 
 		 488 aa  139  7.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  28.54 
 
 		 405 aa  139  8.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.38 
 
 		 454 aa  139  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  28.18 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  29.3 
 
 		 433 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  29.23 
 
 		 399 aa  137  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.07 
 
 		 430 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  26.92 
 
 		 418 aa  136  8e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0470  flagellar hook protein FlgE  28.24 
 
 		 411 aa  136  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3165  flagellar hook protein FlgE  30.92 
 
 		 412 aa  134  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.278586 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.31 
 
 		 395 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  29.18 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  28.75 
 
 		 437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  29.1 
 
 		 401 aa  131  3e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  29.1 
 
 		 401 aa  131  3e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  28.23 
 
 		 401 aa  130  3e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  29.54 
 
 		 404 aa  130  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  31.18 
 
 		 417 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  27.8 
 
 		 442 aa  129  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  28.79 
 
 		 401 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  28.76 
 
 		 401 aa  128  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  27.37 
 
 		 383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1139  flagellar hook protein FlgE  27.25 
 
 		 396 aa  127  5e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0780  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.02 
 
 		 415 aa  127  5e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  29.53 
 
 		 423 aa  127  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  26.98 
 
 		 425 aa  127  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2335  flagellar hook protein FlgE  27.23 
 
 		 432 aa  126  6e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  26.43 
 
 		 442 aa  126  7e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  26.53 
 
 		 463 aa  126  7e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0871  flagellar hook protein FlgE  28.67 
 
 		 419 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  28.67 
 
 		 402 aa  125  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  28.67 
 
 		 400 aa  125  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  28.6 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1645  flagellar basal body FlaE  29.46 
 
 		 409 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2696  hypothetical protein  28.46 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  28.6 
 
 		 403 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0276  flagellar hook protein FlgE  26.12 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  27.79 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0657  flagellar hook protein FlgE  28.76 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  27.79 
 
 		 402 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1789  flagellar hook protein FlgE  28.6 
 
 		 434 aa  124  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  28.17 
 
 		 420 aa  124  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  28.6 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  28.6 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  28.6 
 
 		 403 aa  124  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.45 
 
 		 400 aa  124  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  27.73 
 
 		 404 aa  124  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  27.79 
 
 		 402 aa  124  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  26.47 
 
 		 437 aa  123  6e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3379  flagellar hook protein FlgE  29.5 
 
 		 434 aa  123  7e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  27.94 
 
 		 450 aa  123  8e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  29.47 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  28.74 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  28.78 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  28.78 
 
 		 414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  28.78 
 
 		 414 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  29.14 
 
 		 402 aa  121  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0145  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.2 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>