More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I2335 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I2335  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 
432 aa  885    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  68.19 
 
 
437 aa  625  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1789  flagellar hook protein FlgE  67.28 
 
 
434 aa  622  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01289  flagellar hook protein FlgE  67.05 
 
 
437 aa  615  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  49.46 
 
 
453 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  48.26 
 
 
454 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  48.25 
 
 
453 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  50 
 
 
453 aa  389  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  48.46 
 
 
453 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  50.11 
 
 
453 aa  382  1e-105  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  48.48 
 
 
460 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  50.54 
 
 
459 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  49.23 
 
 
453 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  49.01 
 
 
453 aa  372  1e-102  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  49.23 
 
 
453 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  49.23 
 
 
453 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  49.23 
 
 
453 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  47.05 
 
 
455 aa  367  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  48.57 
 
 
453 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  48.57 
 
 
453 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  44.13 
 
 
458 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  43.13 
 
 
461 aa  333  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  42.05 
 
 
425 aa  301  2e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  40.09 
 
 
418 aa  279  9e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  37.16 
 
 
408 aa  249  8e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  36.64 
 
 
420 aa  248  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  38.48 
 
 
408 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  36.66 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.48 
 
 
435 aa  241  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  35.19 
 
 
410 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  36.11 
 
 
406 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  35.04 
 
 
442 aa  228  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.55 
 
 
430 aa  227  3e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.68 
 
 
426 aa  226  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1716  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.92 
 
 
423 aa  226  9e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.727886  normal  0.851107 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  35.36 
 
 
401 aa  225  9e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0080  flagellar hook protein FlgE  33.92 
 
 
423 aa  226  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  34.15 
 
 
437 aa  225  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  35.03 
 
 
438 aa  225  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  33.72 
 
 
401 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  33.04 
 
 
442 aa  224  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  34.18 
 
 
407 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  35.12 
 
 
402 aa  222  8e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  35.12 
 
 
402 aa  222  8e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  35.33 
 
 
399 aa  222  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  34.15 
 
 
437 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  33.95 
 
 
407 aa  221  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  33.95 
 
 
407 aa  221  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  35.19 
 
 
441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.94 
 
 
423 aa  217  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.96 
 
 
418 aa  215  1.9999999999999998e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  34.93 
 
 
440 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  34.19 
 
 
451 aa  212  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  32.79 
 
 
413 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  34.18 
 
 
398 aa  209  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  31.91 
 
 
462 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1669  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  33.48 
 
 
423 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456133  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  32.23 
 
 
450 aa  206  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  33.18 
 
 
410 aa  206  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  31.98 
 
 
462 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  33.72 
 
 
402 aa  205  1e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  31.41 
 
 
414 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  31.41 
 
 
414 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  32.02 
 
 
414 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  31.41 
 
 
414 aa  203  4e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  32.27 
 
 
402 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1480  flagellar hook protein FlgE  48.7 
 
 
554 aa  201  1.9999999999999998e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  32.11 
 
 
413 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  32.11 
 
 
413 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  32.11 
 
 
413 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  33.87 
 
 
414 aa  200  5e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  32.97 
 
 
443 aa  199  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  32.21 
 
 
425 aa  199  9e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  32.95 
 
 
398 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  33.55 
 
 
440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  30.73 
 
 
413 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  31.34 
 
 
403 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  31.93 
 
 
399 aa  196  6e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  31.34 
 
 
403 aa  196  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  30.94 
 
 
428 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  30.94 
 
 
428 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  30.94 
 
 
428 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  30.73 
 
 
413 aa  195  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1975  flagellar basal body FlaE  32.95 
 
 
387 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  30.77 
 
 
413 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  30.77 
 
 
413 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  30.77 
 
 
413 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  31.64 
 
 
401 aa  194  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  30.77 
 
 
413 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  30.77 
 
 
413 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  30.77 
 
 
413 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  30.77 
 
 
413 aa  194  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  30.68 
 
 
404 aa  192  8e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  33.72 
 
 
395 aa  192  9e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  31.48 
 
 
398 aa  192  1e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.18 
 
 
395 aa  191  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  32.71 
 
 
383 aa  191  2.9999999999999997e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  30.65 
 
 
403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  30.65 
 
 
403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  30.65 
 
 
403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>