More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1480 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1480  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 554 aa  1103    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  70.29 
 
 		 461 aa  350  3e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  67.97 
 
 		 458 aa  324  3e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  60 
 
 		 453 aa  290  7e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  59.67 
 
 		 453 aa  288  1e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  57.26 
 
 		 459 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  57.74 
 
 		 460 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  57.5 
 
 		 453 aa  279  9e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  56.49 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  56.49 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  56.49 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  55.42 
 
 		 453 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  55.42 
 
 		 453 aa  272  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  55.42 
 
 		 453 aa  272  1e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  56.67 
 
 		 454 aa  272  1e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  55.42 
 
 		 453 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  56.25 
 
 		 453 aa  269  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  57.68 
 
 		 455 aa  257  5e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  56.67 
 
 		 453 aa  256  9e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3580  hypothetical protein  33.61 
 
 		 565 aa  244  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.304343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3830  hypothetical protein  33.45 
 
 		 538 aa  236  9e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0390801  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3103  flagellar basal body FlaE domain protein  33.22 
 
 		 531 aa  233  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178988  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  49.14 
 
 		 425 aa  229  8e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  48.94 
 
 		 418 aa  223  9e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  47.33 
 
 		 438 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  46.5 
 
 		 437 aa  199  9e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01289  flagellar hook protein FlgE  45.49 
 
 		 437 aa  198  3e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1471  hypothetical protein  28.47 
 
 		 538 aa  196  7e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2335  flagellar hook protein FlgE  48.7 
 
 		 432 aa  189  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1789  flagellar hook protein FlgE  46.15 
 
 		 434 aa  187  3e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  44.44 
 
 		 462 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  43.88 
 
 		 420 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1716  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  44.53 
 
 		 423 aa  183  6e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.727886  normal  0.851107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0080  flagellar hook protein FlgE  44.53 
 
 		 423 aa  183  7e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505982  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  43.46 
 
 		 408 aa  182  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  42.8 
 
 		 462 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  45.87 
 
 		 405 aa  181  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  43.02 
 
 		 407 aa  180  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  43.02 
 
 		 407 aa  180  4.999999999999999e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  42.64 
 
 		 407 aa  175  1.9999999999999998e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  44.58 
 
 		 584 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  43.25 
 
 		 451 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  43.75 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.77 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  45.11 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  39.5 
 
 		 410 aa  168  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  43.57 
 
 		 440 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  44.18 
 
 		 441 aa  167  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  42.15 
 
 		 408 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  42.62 
 
 		 443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  43.22 
 
 		 406 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  43.5 
 
 		 442 aa  163  7e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3477  flagellar basal body rod protein:protein of unknown function DUF1078:flagellar basal body FlaE  44.26 
 
 		 582 aa  162  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1669  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  42.86 
 
 		 423 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  39.04 
 
 		 414 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.46 
 
 		 435 aa  160  5e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  35.31 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  35.31 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  35.31 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  35.31 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  35.31 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  35.31 
 
 		 413 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  39.18 
 
 		 450 aa  157  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  39.27 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  35 
 
 		 413 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  40.09 
 
 		 413 aa  157  6e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1937  flagellar hook protein FlgE  40.49 
 
 		 586 aa  156  8e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233363  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  40.09 
 
 		 413 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  37.93 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  38.36 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  40.56 
 
 		 398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  39.74 
 
 		 413 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  39.74 
 
 		 413 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  39.74 
 
 		 413 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  37.5 
 
 		 402 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  37.5 
 
 		 402 aa  151  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  38.91 
 
 		 413 aa  151  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  39.32 
 
 		 413 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  40.52 
 
 		 383 aa  149  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  29.02 
 
 		 519 aa  148  3e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  38.49 
 
 		 437 aa  147  4.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  36.4 
 
 		 414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  36.4 
 
 		 414 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  36.4 
 
 		 414 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  39.18 
 
 		 399 aa  147  7.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2731  hypothetical protein  48.81 
 
 		 501 aa  145  2e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000961084 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  38.1 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2210  ribonuclease III  50 
 
 		 804 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1105  hypothetical protein  42.39 
 
 		 637 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  38.65 
 
 		 425 aa  144  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  35.15 
 
 		 414 aa  143  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  40.38 
 
 		 423 aa  142  9.999999999999999e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  27.5 
 
 		 463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  40.34 
 
 		 398 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  38.66 
 
 		 398 aa  140  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  36.86 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  38.24 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.04 
 
 		 426 aa  137  7.000000000000001e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  38.35 
 
 		 404 aa  136  9e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  38.14 
 
 		 410 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>