More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3830 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_3830  hypothetical protein  100 
 
 
538 aa  1081    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0390801  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3103  flagellar basal body FlaE domain protein  85.14 
 
 
531 aa  914    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178988  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  64.01 
 
 
425 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  64.2 
 
 
426 aa  344  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  60.53 
 
 
423 aa  316  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  36.83 
 
 
442 aa  281  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  36.38 
 
 
462 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  36.79 
 
 
462 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2951  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.13 
 
 
501 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.431038 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1480  flagellar hook protein FlgE  33.45 
 
 
554 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  68.55 
 
 
404 aa  221  3e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2731  hypothetical protein  57.76 
 
 
501 aa  191  2e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000961084 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  55.06 
 
 
420 aa  190  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.99 
 
 
435 aa  187  5e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1105  hypothetical protein  53.66 
 
 
637 aa  179  1e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1400  protein of unknown function DUF1078 domain protein  27.82 
 
 
508 aa  176  7e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.153228  normal  0.872762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.65 
 
 
545 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  55.35 
 
 
405 aa  174  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  46.37 
 
 
438 aa  170  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  52.87 
 
 
410 aa  170  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  40.98 
 
 
414 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  51.79 
 
 
406 aa  167  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  39.73 
 
 
414 aa  166  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  53.85 
 
 
408 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  43.08 
 
 
413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  41.37 
 
 
413 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  42.58 
 
 
413 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  42.58 
 
 
413 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  42.58 
 
 
413 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  40.55 
 
 
414 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  40.55 
 
 
414 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  40.94 
 
 
414 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  52.8 
 
 
398 aa  160  4e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  43.08 
 
 
413 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  40.08 
 
 
413 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  54.23 
 
 
399 aa  157  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  29.75 
 
 
519 aa  157  7e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  53.52 
 
 
401 aa  156  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  52.08 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2210  ribonuclease III  48.34 
 
 
804 aa  154  4e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  38.1 
 
 
419 aa  154  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  37.7 
 
 
440 aa  153  8e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  39.2 
 
 
419 aa  152  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  46.75 
 
 
437 aa  152  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  51.02 
 
 
383 aa  153  1e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  39.85 
 
 
451 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  41.22 
 
 
441 aa  151  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  39.71 
 
 
442 aa  150  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  44.94 
 
 
437 aa  149  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  52.45 
 
 
399 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  39.22 
 
 
405 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  54.86 
 
 
404 aa  148  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  38.41 
 
 
413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  48.25 
 
 
440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  45.78 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  38.41 
 
 
413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  38.41 
 
 
413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  38.41 
 
 
413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  38.41 
 
 
413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  38.41 
 
 
413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  38.41 
 
 
413 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  45.56 
 
 
450 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  28.7 
 
 
496 aa  147  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.683662 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01072  flagellar hook protein E  38.83 
 
 
401 aa  146  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  47.26 
 
 
407 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  47.62 
 
 
418 aa  145  1e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  47.26 
 
 
407 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  42.02 
 
 
415 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1199  flagellar hook protein FlgE  38.83 
 
 
401 aa  146  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  45 
 
 
402 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  39.25 
 
 
401 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  45 
 
 
402 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  38.64 
 
 
401 aa  145  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  48.05 
 
 
425 aa  144  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1556  flagellar hook protein FlgE  38.74 
 
 
405 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.460065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  38.16 
 
 
404 aa  144  4e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  37.84 
 
 
410 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  45.58 
 
 
408 aa  144  5e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  40.23 
 
 
405 aa  144  5e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.54 
 
 
584 aa  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  39.08 
 
 
402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  50.7 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  38.19 
 
 
407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  39.54 
 
 
402 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  39.54 
 
 
402 aa  141  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2011  flagellar hook protein FlgE  42.04 
 
 
403 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.764857  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1289  flagellar hook protein FlgE  42.04 
 
 
403 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.209767  normal  0.0125362 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1245  flagellar hook protein FlgE  42.04 
 
 
403 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.273192 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1274  flagellar hook protein FlgE  42.04 
 
 
403 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.637715  normal  0.02291 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2195  flagellar hook protein FlgE  42.04 
 
 
403 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000430421 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  38.7 
 
 
402 aa  140  6e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  41.89 
 
 
430 aa  140  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01080  hypothetical protein  41.28 
 
 
219 aa  140  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  50.74 
 
 
418 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5628  flagellar hook protein FlgE  51.02 
 
 
417 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3580  hypothetical protein  38.71 
 
 
565 aa  139  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.304343  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  39.66 
 
 
461 aa  138  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  42.94 
 
 
400 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  42.94 
 
 
400 aa  138  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  37.26 
 
 
443 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.564607 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>