More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2210 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2210  ribonuclease III  100 
 
 		 804 aa  1577    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1105  hypothetical protein  41 
 
 		 637 aa  285  3.0000000000000004e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  44.41 
 
 		 438 aa  238  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  39.52 
 
 		 462 aa  227  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  39.38 
 
 		 462 aa  217  8e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  44.68 
 
 		 437 aa  211  6e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  44.33 
 
 		 437 aa  209  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  43.97 
 
 		 408 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  41.75 
 
 		 405 aa  196  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  31.14 
 
 		 407 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  38.28 
 
 		 430 aa  190  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  40.33 
 
 		 440 aa  190  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  31.75 
 
 		 407 aa  189  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  31.75 
 
 		 407 aa  189  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  39.86 
 
 		 399 aa  183  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  38.79 
 
 		 398 aa  183  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  41.28 
 
 		 408 aa  176  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  37.25 
 
 		 584 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  39.8 
 
 		 398 aa  177  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  37.2 
 
 		 440 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  36.58 
 
 		 451 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  39.86 
 
 		 420 aa  175  3.9999999999999995e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  37.2 
 
 		 443 aa  174  5e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  35.73 
 
 		 442 aa  173  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  35.31 
 
 		 442 aa  172  3e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  36.39 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2731  hypothetical protein  39.78 
 
 		 501 aa  170  1e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000961084 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  36.49 
 
 		 418 aa  169  2e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  52.25 
 
 		 441 aa  169  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  35.5 
 
 		 460 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24030  Flagellar basal body rod protein  35.44 
 
 		 383 aa  168  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3084  flagellar hook protein FlgE  35.02 
 
 		 454 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.901085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2375  hypothetical protein  38.43 
 
 		 425 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  36.55 
 
 		 406 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  37.68 
 
 		 410 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3580  hypothetical protein  56.36 
 
 		 565 aa  165  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.304343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  36.3 
 
 		 453 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  34.2 
 
 		 425 aa  164  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  35.29 
 
 		 453 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  36.64 
 
 		 453 aa  163  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1600  flagellar hook protein FlgE  36.61 
 
 		 453 aa  163  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.998442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  34.14 
 
 		 453 aa  162  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 401 aa  162  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3717  hypothetical protein  36.71 
 
 		 404 aa  161  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.493119  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2315  flagellar hook protein FlgE  35.29 
 
 		 453 aa  160  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  33.68 
 
 		 402 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1268  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.23 
 
 		 435 aa  159  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.427382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  33.68 
 
 		 402 aa  159  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  38.13 
 
 		 405 aa  158  3e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  33.69 
 
 		 401 aa  158  4e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  34.23 
 
 		 453 aa  158  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3477  flagellar basal body rod protein:protein of unknown function DUF1078:flagellar basal body FlaE  49.71 
 
 		 582 aa  158  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  35.67 
 
 		 458 aa  157  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  37.77 
 
 		 405 aa  157  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  36.56 
 
 		 413 aa  157  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  36.05 
 
 		 461 aa  156  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1937  flagellar hook protein FlgE  48.17 
 
 		 586 aa  155  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233363  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  35.35 
 
 		 453 aa  155  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  35.35 
 
 		 453 aa  155  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  35.35 
 
 		 453 aa  155  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  33.22 
 
 		 459 aa  155  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3830  hypothetical protein  48.34 
 
 		 538 aa  154  8e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0390801  normal  0.276632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  35.02 
 
 		 453 aa  154  8e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  36.93 
 
 		 402 aa  153  1e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  35.21 
 
 		 404 aa  153  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  36.01 
 
 		 413 aa  153  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  36.93 
 
 		 402 aa  153  1e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  35.86 
 
 		 414 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2951  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  36.93 
 
 		 501 aa  152  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.431038 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3103  flagellar basal body FlaE domain protein  47.65 
 
 		 531 aa  152  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178988  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  36.24 
 
 		 401 aa  153  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  35.86 
 
 		 414 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  35.86 
 
 		 414 aa  152  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.16 
 
 		 418 aa  152  3e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  35.84 
 
 		 413 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  35.84 
 
 		 413 aa  152  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  36.64 
 
 		 413 aa  151  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  35.46 
 
 		 413 aa  151  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2422  flagellar hook protein FlgE  35.92 
 
 		 428 aa  151  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.638743  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2001  flagellar hook protein FlgE  35.92 
 
 		 428 aa  151  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2321  flagellar hook protein FlgE  35.92 
 
 		 428 aa  151  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  35.48 
 
 		 413 aa  150  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  34.66 
 
 		 426 aa  150  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  35.48 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  37.63 
 
 		 414 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3737  flagellar hook protein FlgE  37.28 
 
 		 415 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  35.19 
 
 		 400 aa  148  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 437 aa  148  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  35.84 
 
 		 413 aa  148  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  35.84 
 
 		 413 aa  148  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  35.84 
 
 		 413 aa  148  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  35.84 
 
 		 413 aa  148  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  35.84 
 
 		 413 aa  148  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  35.84 
 
 		 413 aa  148  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.19 
 
 		 400 aa  147  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  35.84 
 
 		 413 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  33.81 
 
 		 398 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  33.09 
 
 		 402 aa  147  9e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2967  flagellar hook protein FlgE  36.27 
 
 		 407 aa  147  9e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  50 
 
 		 399 aa  146  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>