More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1937 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1937  flagellar hook protein FlgE  100 
 
 		 586 aa  1186    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.233363  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3477  flagellar basal body rod protein:protein of unknown function DUF1078:flagellar basal body FlaE  78.33 
 
 		 582 aa  932    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  45.69 
 
 		 584 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  43.6 
 
 		 451 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3580  hypothetical protein  34.22 
 
 		 565 aa  245  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.304343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  44.22 
 
 		 440 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  43.18 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  46.91 
 
 		 440 aa  227  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  39.05 
 
 		 442 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  41.9 
 
 		 438 aa  207  5e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  39.3 
 
 		 441 aa  205  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  40.98 
 
 		 462 aa  200  6e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  40.23 
 
 		 462 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2951  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  30.86 
 
 		 501 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.431038 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0072  flagellar hook protein FlgE  41.76 
 
 		 402 aa  170  6e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3575  flagellar hook protein FlgE  40.96 
 
 		 398 aa  170  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  42.47 
 
 		 420 aa  169  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0066  flagellar hook protein FlgE  35.5 
 
 		 398 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3968  flagellar hook protein FlgE  42.24 
 
 		 395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0209  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  40.6 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.676304 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3648  flagellar hook protein FlgE  40.43 
 
 		 402 aa  163  9e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3465  flagellar hook protein FlgE  35.67 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1105  hypothetical protein  47.49 
 
 		 637 aa  161  3e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3368  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  32.15 
 
 		 400 aa  161  4e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0266  lateral flagellar hook protein LfgE  32.15 
 
 		 400 aa  160  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1324  flagellar hook protein FlgE  41.38 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04912  flagellar hook protein FlgE  36.46 
 
 		 399 aa  158  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1480  flagellar hook protein FlgE  40.49 
 
 		 554 aa  156  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0896  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.23 
 
 		 430 aa  156  8e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2210  ribonuclease III  48.17 
 
 		 804 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0345  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.832683 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  40.68 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  40.68 
 
 		 407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  39.48 
 
 		 408 aa  153  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3711  flagellar hook protein FlgE  35.66 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.447413 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4788  flagellar hook protein FlgE  35.66 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.498374 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  38.96 
 
 		 405 aa  151  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000737  flagellar hook protein FlgE  35.14 
 
 		 398 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  38.17 
 
 		 413 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  38.17 
 
 		 413 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  38.17 
 
 		 413 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  38.17 
 
 		 413 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6368  flagellar hook protein FlgE  38.75 
 
 		 413 aa  150  8e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.674772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  38.17 
 
 		 413 aa  150  8e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  38.17 
 
 		 413 aa  150  8e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2594  flagellar hook protein FlgE  39.75 
 
 		 453 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  38.17 
 
 		 413 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  38.53 
 
 		 414 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1957  flagellar hook protein FlgE  32.57 
 
 		 410 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4713  flagellar hook protein FlgE  36.05 
 
 		 401 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0589234 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2944  flagellar hook protein FlgE  39.84 
 
 		 460 aa  146  9e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0243  flagellar hook protein FlgE  36.25 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0517  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  39.22 
 
 		 418 aa  144  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3097  flagellar hook protein FlgE  38.52 
 
 		 453 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2959  flagellar hook protein FlgE  38.52 
 
 		 453 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1419  flagellar hook protein FlgE  38.52 
 
 		 453 aa  143  7e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  38.24 
 
 		 407 aa  143  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1773  flagellar hook-basal body protein  35.53 
 
 		 418 aa  143  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  36.25 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  36.25 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  36.25 
 
 		 414 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  37.08 
 
 		 413 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  32.97 
 
 		 399 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  39.38 
 
 		 437 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  36.36 
 
 		 413 aa  141  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  39 
 
 		 437 aa  141  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  35.42 
 
 		 413 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  35.93 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  35.93 
 
 		 413 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1871  flagellar hook protein FlgE  34.38 
 
 		 405 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1164  flagellar hook protein FlgE  40.16 
 
 		 459 aa  139  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0402559  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1343  flagellar hook protein FlgE  38.31 
 
 		 453 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  34.07 
 
 		 410 aa  138  4e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2524  flagellar hook protein FlgE  36.43 
 
 		 402 aa  137  8e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.353481  hitchhiker  0.00930832 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1199  flagellar hook protein FlgE  36.43 
 
 		 402 aa  137  8e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1262  flagellar hook protein FlgE  37.7 
 
 		 453 aa  136  9e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1332  flagellar hook protein FlgE  37.7 
 
 		 453 aa  136  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1324  flagellar hook protein FlgE  37.7 
 
 		 453 aa  136  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0596368 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3247  flagellar hook protein FlgE  37.7 
 
 		 453 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4196  flagellar basal body FlaE domain protein  38.72 
 
 		 404 aa  136  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  34.17 
 
 		 414 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2570  flagellar basal body FlaE domain protein  36.05 
 
 		 402 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.494993  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  35.92 
 
 		 423 aa  134  6.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3791  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.3 
 
 		 503 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2595  flagellar hook protein FlgE  34.25 
 
 		 405 aa  133  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1455  flagellar hook protein FlgE  31.5 
 
 		 401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00159718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0143  putative flagellar hook protein FlgE  41.85 
 
 		 503 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1348  flagellar hook protein FlgE  38.78 
 
 		 453 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  30.57 
 
 		 442 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2249  flagellar hook protein FlgE  35.66 
 
 		 402 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.467124  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3097  flagellar hook protein FlgE  35.71 
 
 		 458 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.737452  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.33 
 
 		 428 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02925  flagellar hook protein FlgE  35.83 
 
 		 461 aa  131  4.0000000000000003e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.308031  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2731  hypothetical protein  44.58 
 
 		 501 aa  130  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000961084 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  40.33 
 
 		 428 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2052  flagellar hook protein FlgE  32.58 
 
 		 401 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.302696 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0929  fagellar hook-basal body protein  34.85 
 
 		 408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0224  flagellar hook protein FlgE  34.01 
 
 		 413 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0642  flagellar hook protein FlgE  33.33 
 
 		 402 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1590  flagellar hook protein FlgE  31.88 
 
 		 404 aa  129  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>