More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0246 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_1711  flagellar hook protein FlgE  70.21 
 
 		 527 aa  755    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.185044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1636  hypothetical protein  66.14 
 
 		 564 aa  733    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0290752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0246  protein of unknown function DUF1078 domain protein  100 
 
 		 545 aa  1109    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0426476 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2432  protein of unknown function DUF1078 domain protein  50.79 
 
 		 562 aa  548  1e-154  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1618  protein of unknown function DUF1078 domain protein  43.25 
 
 		 525 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1614  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.13 
 
 		 513 aa  395  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.621437  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1808  protein of unknown function DUF1078 domain protein  42.18 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2674  hypothetical protein  42.83 
 
 		 498 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0298  flagella basal body rod domain-containing protein  41.02 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1261  protein of unknown function DUF1078 domain protein  41.36 
 
 		 808 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2091  protein of unknown function DUF1078 domain protein  36.87 
 
 		 499 aa  292  8e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0508836  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0577  fagellar hook-basal body protein  32.91 
 
 		 433 aa  229  1e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2768  flagellar hook protein FlgE  32.36 
 
 		 463 aa  226  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0119321  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3570  hypothetical protein  30.82 
 
 		 496 aa  224  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683662 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2566  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.85 
 
 		 428 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.463018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2470  protein of unknown function DUF1078 domain protein  33.21 
 
 		 428 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1387  hypothetical protein  32.48 
 
 		 428 aa  204  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.457805  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1471  hypothetical protein  30.77 
 
 		 538 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2164  protein of unknown function DUF1078 domain protein  28.77 
 
 		 488 aa  184  3e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4297  flagellar hook protein FlgE  29.72 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3070  flagellar basal body and hook protein  28.28 
 
 		 420 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.232473 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3067  flagellar hook protein FlgE  28.79 
 
 		 413 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2921  flagellar basal body FlaE domain protein  28.44 
 
 		 450 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.926176  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1936  flagellar hook protein FlgE  30.81 
 
 		 441 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3729  flagellar hook protein FlgE  29.47 
 
 		 451 aa  177  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.293053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3017  flagellar hook protein FlgE  30.09 
 
 		 414 aa  176  9e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0752  flagellar hook protein FlgE  29.26 
 
 		 442 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0688  hypothetical protein  29.46 
 
 		 461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.714062  normal  0.621954 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3574  flagellar hook protein FlgE  29.48 
 
 		 414 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.575838 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1227  flagellar hook protein FlgE  29.18 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4413  flagellar hook protein FlgE  29.48 
 
 		 414 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50450  flagellar hook protein FlgE  28.79 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0277327 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3954  flagellar hook protein FlgE  29.48 
 
 		 414 aa  172  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.42967  normal  0.345321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3478  flagellar hook protein FlgE  30.04 
 
 		 442 aa  171  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1306  flagellar hook protein FlgE  28.78 
 
 		 455 aa  171  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0269  flagellar hook protein FlgE  28.22 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.593639  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3328  flagellar hook protein FlgE  28.22 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3351  flagellar hook protein FlgE  28.22 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0465  flagellar hook protein FlgE  28.22 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2997  flagellar hook protein FlgE  28.22 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0281  flagellar hook protein FlgE  28.22 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2096  flagellar hook protein FlgE  28.22 
 
 		 413 aa  169  1e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3949  flagellar hook protein FlgE  27.62 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1227  flagellar hook protein FlgE  27.7 
 
 		 437 aa  168  2.9999999999999998e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2129  flagellar hook protein FlgE  28.92 
 
 		 414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.355079  normal  0.0206733 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2708  hypothetical protein  29.2 
 
 		 479 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4388  flagellar hook protein FlgE  27.32 
 
 		 440 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.408667  normal  0.62461 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0419  flagellar hook protein FlgE  37.77 
 
 		 419 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.809638  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3103  hypothetical protein  37.14 
 
 		 419 aa  157  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2847  flagellar hook protein FlgE  29.31 
 
 		 438 aa  152  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.111901 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4248  flagellar hook protein FlgE  28.15 
 
 		 443 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.564607 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1183  flagellar biosynthesis, hook protein  36.48 
 
 		 413 aa  147  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4423  hypothetical protein  28.21 
 
 		 425 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004170  flagellar hook protein FlgE  25.69 
 
 		 437 aa  135  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01289  flagellar hook protein FlgE  26.19 
 
 		 437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3829  protein of unknown function DUF1078 domain protein  48.51 
 
 		 294 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16800  flagellar hook protein FlgE  51.22 
 
 		 519 aa  127  6e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000289081  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2291  flagellar hook protein FlgE  39.27 
 
 		 851 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3913  protein of unknown function DUF1078 domain protein  46.27 
 
 		 294 aa  124  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0335903 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0858  flagellar hook protein  45 
 
 		 475 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3435  hypothetical protein  50.39 
 
 		 259 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2042  protein of unknown function DUF1078 domain protein  48.2 
 
 		 454 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.593026  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1638  protein of unknown function DUF1078 domain protein  31.19 
 
 		 413 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.974664  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1467  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.74 
 
 		 584 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2037  fagellar hook-basal body protein  49.62 
 
 		 266 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.785533  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1684  hypothetical protein  34.06 
 
 		 417 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0289  flagellar hook protein FlgE  40.35 
 
 		 442 aa  119  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0849  hypothetical protein  41.62 
 
 		 398 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.709656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1769  flagellar hook protein FlgE  46.32 
 
 		 911 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2040  flagellar hook protein FlgE  44.93 
 
 		 819 aa  118  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1293  hypothetical protein  29.97 
 
 		 705 aa  117  5e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1862  flagellar hook protein FlgE  46.32 
 
 		 814 aa  116  1.0000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3295  protein of unknown function DUF1078 domain protein  47.45 
 
 		 296 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1328  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.2 
 
 		 636 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1896  flagellar hook protein FlgE  46.38 
 
 		 845 aa  115  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0025  flagellar hook protein FlgE  44.59 
 
 		 838 aa  115  3e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0032  flagellar hook protein FlgE  43.26 
 
 		 718 aa  114  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1528  flagellar hook protein FlgE  43.88 
 
 		 399 aa  113  7.000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31140  flagellar hook protein FlgE  42.03 
 
 		 394 aa  113  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0638977  normal  0.0911466 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1015  fagellar hook-basal body protein  47.45 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2103  flagellar hook protein FlgE  43.92 
 
 		 875 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1656  flagellar basal-body rod protein FlgG  44.44 
 
 		 266 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0107  flagellar hook protein FlgE  35.89 
 
 		 814 aa  113  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000370744  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3041  flagellar hook protein FlgE  30.95 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0630  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  31.96 
 
 		 423 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2408  flagellar hook protein FlgE  30.95 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.39901  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0566  flagellar basal body FlaE domain-containing protein  28.66 
 
 		 426 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3022  flagellar hook protein FlgE  30.95 
 
 		 413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0251942  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2019  protein of unknown function DUF1078 domain protein  32.28 
 
 		 397 aa  111  3e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.077843  normal  0.869539 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2736  hypothetical protein  25.53 
 
 		 474 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06156  flagellar hook protein FlgE  33.23 
 
 		 407 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000721061  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01010  flagellar hook protein FlgE  33.23 
 
 		 407 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.432857  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1658  protein of unknown function DUF1078 domain protein  44.37 
 
 		 462 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1634  flagellar hook protein FlgE  41.01 
 
 		 405 aa  109  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2426  flagellar basal body FlaE domain protein  32.01 
 
 		 410 aa  109  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.594401 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2731  hypothetical protein  41.01 
 
 		 501 aa  109  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000961084 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0474  protein of unknown function DUF1078-like protein  43.17 
 
 		 440 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000090236  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2932  flagellar hook protein FlgE  29.93 
 
 		 413 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1220  flagellar basal body FlaE domain protein  38.97 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.423975  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1903  flagellar hook protein FlgE  41.91 
 
 		 407 aa  108  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.117439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>